SPHK2

SPHK2
Ідентифікатори
Символи SPHK2, SK 2, SK-2, SPK 2, SPK-2, sphingosine kinase 2
Зовнішні ІД OMIM: 607092 MGI: 1861380 HomoloGene: 32456 GeneCards: SPHK2
Реагує на сполуку
abc-294640[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція

• sphingosine-1-phosphate receptor activity
• transferase activity
• nucleotide binding
• kinase activity
• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
• ATP binding
• D-erythro-sphingosine kinase activity
• sphinganine kinase activity
• NAD+ kinase activity

Клітинна компонента

• цитоплазма
• лізосома
• мембрана
• lysosomal membrane
• гіалоплазма
• внутрішньоклітинна мембранна органела
• Нуклеосома
• клітинне ядро
• мітохондрія
• мітохондріальна внутрішня мембрана
• ендоплазматичний ретикулум

Біологічний процес

• фосфорилювання
• sphinganine-1-phosphate biosynthetic process
• жіноча вагітність
• sphingosine metabolic process
• sphingosine biosynthetic process
• negative regulation of apoptotic process
• sphingolipid biosynthetic process
• brain development
• blood vessel development
• positive regulation of cell population proliferation
• проліферація
• lipid phosphorylation
• sphingosine-1-phosphate receptor signaling pathway
• обмін речовин
• negative regulation of cell growth
• negative regulation of histone deacetylation
• positive regulation of mast cell activation involved in immune response
• positive regulation of apoptotic process
• regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling
• positive regulation of mast cell degranulation
• histone H2A-K5 acetylation
• histone H2B-K12 acetylation
• epigenetic maintenance of chromatin in transcription-competent conformation
• positive regulation of protein kinase C signaling
• positive regulation of calcium ion import
• negative regulation of histone deacetylase activity
• regulation of reactive oxygen species biosynthetic process
• cellular response to phorbol 13-acetate 12-myristate
• regulation of cytochrome-c oxidase activity
• positive regulation of ceramide biosynthetic process
• positive regulation of histone H3-K9 acetylation
• regulation of ATP biosynthetic process

Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
56848
56632
Ensembl
ENSG00000063176
ENSMUSG00000057342
UniProt
Q9NRA0
Q9JIA7
RefSeq (мРНК)
NM_001204158
NM_001204159
NM_001204160
NM_001243876
NM_020126
NM_001172561
NM_020011
NM_203280
RefSeq (білок)
NP_001191087
NP_001191088
NP_001191089
NP_001230805
NP_064511
NP_001166032
NP_064395
NP_975009
Локус (UCSC) Хр. 19: 48.62 – 48.63 Mb Хр. 7: 45.36 – 45.37 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

SPHK2 (англ. Sphingosine kinase 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 654 амінокислот, а молекулярна маса — 69 217[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MNGHLEAEEQQDQRPDQELTGSWGHGPRSTLVRAKAMAPPPPPLAASTPL
LHGEFGSYPARGPRFALTLTSQALHIQRLRPKPEARPRGGLVPLAEVSGC
CTLRSRSPSDSAAYFCIYTYPRGRRGARRRATRTFRADGAATYEENRAEA
QRWATALTCLLRGLPLPGDGEITPDLLPRPPRLLLLVNPFGGRGLAWQWC
KNHVLPMISEAGLSFNLIQTERQNHARELVQGLSLSEWDGIVTVSGDGLL
HEVLNGLLDRPDWEEAVKMPVGILPCGSGNALAGAVNQHGGFEPALGLDL
LLNCSLLLCRGGGHPLDLLSVTLASGSRCFSFLSVAWGFVSDVDIQSERF
RALGSARFTLGTVLGLATLHTYRGRLSYLPATVEPASPTPAHSLPRAKSE
LTLTPDPAPPMAHSPLHRSVSDLPLPLPQPALASPGSPEPLPILSLNGGG
PELAGDWGGAGDAPLSPDPLLSSPPGSPKAALHSPVSEGAPVIPPSSGLP
LPTPDARVGASTCGPPDHLLPPLGTPLPPDWVTLEGDFVLMLAISPSHLG
ADLVAAPHARFDDGLVHLCWVRSGISRAALLRLFLAMERGSHFSLGCPQL
GYAAARAFRLEPLTPRGVLTVDGEQVEYGPLQAQMHPGIGTLLTGPPGCP
GREP

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у цитоплазмі, мембрані, лізосомі.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Don A.S., Rosen H. (2009). A lipid binding domain in sphingosine kinase 2. Biochem. Biophys. Res. Commun. 380: 87—92. PMID 19168031 DOI:10.1016/j.bbrc.2009.01.075

Примітки

  1. ↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Sphingosine kinase 2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. ↑ Human PubMed Reference:.
  3. ↑ Mouse PubMed Reference:.
  4. ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:18859 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
  5. ↑ UniProt, Q9NRA0 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 19
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії.
Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій.