SPHK2 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | SPHK2, SK 2, SK-2, SPK 2, SPK-2, sphingosine kinase 2 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 607092 MGI: 1861380 HomoloGene: 32456 GeneCards: SPHK2 |
---|
|
Реагує на сполуку |
---|
abc-294640[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • sphingosine-1-phosphate receptor activity • transferase activity • nucleotide binding • kinase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ATP binding • D-erythro-sphingosine kinase activity • sphinganine kinase activity • NAD+ kinase activity |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • лізосома • мембрана • lysosomal membrane • гіалоплазма • внутрішньоклітинна мембранна органела • Нуклеосома • клітинне ядро • мітохондрія • мітохондріальна внутрішня мембрана • ендоплазматичний ретикулум |
---|
Біологічний процес | • фосфорилювання • sphinganine-1-phosphate biosynthetic process • жіноча вагітність • sphingosine metabolic process • sphingosine biosynthetic process • negative regulation of apoptotic process • sphingolipid biosynthetic process • brain development • blood vessel development • positive regulation of cell population proliferation • проліферація • lipid phosphorylation • sphingosine-1-phosphate receptor signaling pathway • обмін речовин • negative regulation of cell growth • negative regulation of histone deacetylation • positive regulation of mast cell activation involved in immune response • positive regulation of apoptotic process • regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • positive regulation of mast cell degranulation • histone H2A-K5 acetylation • histone H2B-K12 acetylation • epigenetic maintenance of chromatin in transcription-competent conformation • positive regulation of protein kinase C signaling • positive regulation of calcium ion import • negative regulation of histone deacetylase activity • regulation of reactive oxygen species biosynthetic process • cellular response to phorbol 13-acetate 12-myristate • regulation of cytochrome-c oxidase activity • positive regulation of ceramide biosynthetic process • positive regulation of histone H3-K9 acetylation • regulation of ATP biosynthetic process |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001204158 NM_001204159 NM_001204160 NM_001243876 NM_020126 |
| | NM_001172561 NM_020011 NM_203280 |
|
---|
RefSeq (білок) | | NP_001191087 NP_001191088 NP_001191089 NP_001230805 NP_064511 |
| | NP_001166032 NP_064395 NP_975009 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 19: 48.62 – 48.63 Mb | Хр. 7: 45.36 – 45.37 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
SPHK2 (англ. Sphingosine kinase 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 654 амінокислот, а молекулярна маса — 69 217[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MNGHLEAEEQ | | QDQRPDQELT | | GSWGHGPRST | | LVRAKAMAPP | | PPPLAASTPL |
LHGEFGSYPA | | RGPRFALTLT | | SQALHIQRLR | | PKPEARPRGG | | LVPLAEVSGC |
CTLRSRSPSD | | SAAYFCIYTY | | PRGRRGARRR | | ATRTFRADGA | | ATYEENRAEA |
QRWATALTCL | | LRGLPLPGDG | | EITPDLLPRP | | PRLLLLVNPF | | GGRGLAWQWC |
KNHVLPMISE | | AGLSFNLIQT | | ERQNHARELV | | QGLSLSEWDG | | IVTVSGDGLL |
HEVLNGLLDR | | PDWEEAVKMP | | VGILPCGSGN | | ALAGAVNQHG | | GFEPALGLDL |
LLNCSLLLCR | | GGGHPLDLLS | | VTLASGSRCF | | SFLSVAWGFV | | SDVDIQSERF |
RALGSARFTL | | GTVLGLATLH | | TYRGRLSYLP | | ATVEPASPTP | | AHSLPRAKSE |
LTLTPDPAPP | | MAHSPLHRSV | | SDLPLPLPQP | | ALASPGSPEP | | LPILSLNGGG |
PELAGDWGGA | | GDAPLSPDPL | | LSSPPGSPKA | | ALHSPVSEGA | | PVIPPSSGLP |
LPTPDARVGA | | STCGPPDHLL | | PPLGTPLPPD | | WVTLEGDFVL | | MLAISPSHLG |
ADLVAAPHAR | | FDDGLVHLCW | | VRSGISRAAL | | LRLFLAMERG | | SHFSLGCPQL |
GYAAARAFRL | | EPLTPRGVLT | | VDGEQVEYGP | | LQAQMHPGIG | | TLLTGPPGCP |
GREP |
Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у цитоплазмі, мембрані, лізосомі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Don A.S., Rosen H. (2009). A lipid binding domain in sphingosine kinase 2. Biochem. Biophys. Res. Commun. 380: 87—92. PMID 19168031 DOI:10.1016/j.bbrc.2009.01.075
Примітки
- ↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Sphingosine kinase 2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:18859 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q9NRA0 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |