SPOP

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2CR2, 3HQH, 3HQI, 3HQL, 3HQM, 3HTM, 3HU6, 3IVB, 3IVQ, 3IVV, 4EOZ, 4HS2, 4J8Z, 4O1V

Ідентифікатори

Символи

SPOP, BTBD32, TEF2, speckle type BTB/POZ protein, NEDMIDF, NSDVS1, NSDVS2, NEDMACE

Зовнішні ІД

OMIM: 602650 MGI: 1343085 HomoloGene: 68354 GeneCards: SPOP

Пов'язані генетичні захворювання

prostate adenocarcinoma^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ubiquitin protein ligase binding
Клітинна компонента	• Cul3-RING ubiquitin ligase complex • nuclear speck • клітинне ядро • нуклеоплазма • цитоплазма • SCF ubiquitin ligase complex
Біологічний процес	• Убіквітин-залежний протеоліз • regulation of proteolysis • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • glucose homeostasis • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process • negative regulation of DNA-binding transcription factor activity • positive regulation of endoplasmic reticulum stress-induced intrinsic apoptotic signaling pathway • positive regulation of type B pancreatic cell apoptotic process • ubiquitin-dependent protein catabolic process
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


8405


20747

Ensembl


ENSG00000121067


ENSMUSG00000057522

UniProt


O43791


Q6ZWS8

RefSeq (мРНК)

NM_001007226 NM_001007227 NM_001007228 NM_001007229 NM_001007230
NM_003563 NM_001370730 NM_001370731 NM_001370732


NM_025287 NM_001359107

RefSeq (білок)

NP_001007227 NP_001007228 NP_001007229 NP_001007230 NP_001007231
NP_003554 NP_001357659 NP_001357660 NP_001357661


NP_079563 NP_001346036

Локус (UCSC)

Хр. 17: 49.6 – 49.68 Mb

Хр. 11: 95.3 – 95.38 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SPOP (англ. Speckle type BTB/POZ protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 374 амінокислот, а молекулярна маса — 42 132^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSRVPSPPPP	AEMSSGPVAE	SWCYTQIKVV	KFSYMWTINN	FSFCREEMGE
VIKSSTFSSG	ANDKLKWCLR	VNPKGLDEES	KDYLSLYLLL	VSCPKSEVRA
KFKFSILNAK	GEETKAMESQ	RAYRFVQGKD	WGFKKFIRRD	FLLDEANGLL
PDDKLTLFCE	VSVVQDSVNI	SGQNTMNMVK	VPECRLADEL	GGLWENSRFT
DCCLCVAGQE	FQAHKAILAA	RSPVFSAMFE	HEMEESKKNR	VEINDVEPEV
FKEMMCFIYT	GKAPNLDKMA	DDLLAAADKY	ALERLKVMCE	DALCSNLSVE
NAAEILILAD	LHSADQLKTQ	AVDFINYHAS	DVLETSGWKS	MVVSHPHLVA
EAYRSLASAQ	CPFLGPPRKR	LKQS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як убіквітинування білків. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Furukawa M., He Y.J., Borchers C., Xiong Y. (2003). Targeting of protein ubiquitination by BTB-Cullin 3-Roc1 ubiquitin ligases. Nat. Cell Biol. 5: 1001—1007. PMID 14528312 DOI:10.1038/ncb1056
Kent D., Bush E.W., Hooper J.E. (2006). Roadkill attenuates Hedgehog responses through degradation of Cubitus interruptus. Development. 133: 2001—2010. PMID 16651542 DOI:10.1242/dev.02370

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з SPOP переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11254 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, O43791 (англ.) . Архів оригіналу за 19 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.