SRRM2

Ідентифікатори

Символи

SRRM2, 300-KD, CWF21, Cwc21, SRL300, SRm300, HSPC075, serine/arginine repetitive matrix 2

Зовнішні ІД

OMIM: 606032 MGI: 1923206 HomoloGene: 130678 GeneCards: SRRM2

Онтологія гена
Молекулярна функція	• C2H2 zinc finger domain binding • protein N-terminus binding • RNA binding
Клітинна компонента	• Тільце Кахаля • nuclear speck • catalytic step 2 spliceosome • spliceosomal complex • клітинне ядро • нуклеоплазма • U2-type catalytic step 2 spliceosome • U2-type precatalytic spliceosome
Біологічний процес	• mRNA processing • Сплайсинг РНК • mRNA splicing, via spliceosome
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


23524


75956

Ensembl


ENSG00000167978


ENSMUSG00000039218

UniProt


Q9UQ35


Q8BTI8

RefSeq (мРНК)


NM_016333


NM_175229 NM_001368687

RefSeq (білок)


NP_057417


NP_780438 NP_001355616

Локус (UCSC)

Хр. 16: 2.75 – 2.77 Mb

Хр. 17: 24.01 – 24.04 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SRRM2 (англ. Serine/arginine repetitive matrix 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 752 амінокислот, а молекулярна маса — 299 615^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MYNGIGLPTP	RGSGTNGYVQ	RNLSLVRGRR	GERPDYKGEE	ELRRLEAALV
KRPNPDILDH	ERKRRVELRC	LELEEMMEEQ	GYEEQQIQEK	VATFRLMLLE
KDVNPGGKEE	TPGQRPAVTE	THQLAELNEK	KNERLRAAFG	ISDSYVDGSS
FDPQRRAREA	KQPAPEPPKP	YSLVRESSSS	RSPTPKQKKK	KKKKDRGRRS
ESSSPRRERK	KSSKKKKHRS	ESESKKRKHR	SPTPKSKRKS	KDKKRKRSRS
TTPAPKSRRA	HRSTSADSAS	SSDTSRSRSR	SAAAKTHTTA	LAGRSPSPAS
GRRGEGDAPF	SEPGTTSTQR	PSSPETATKQ	PSSPYEDKDK	DKKEKSATRP
SPSPERSSTG	PEPPAPTPLL	AERHGGSPQP	LATTPLSQEP	VNPPSEASPT
RDRSPPKSPE	KLPQSSSSES	SPPSPQPTKV	SRHASSSPES	PKPAPAPGSH
REISSSPTSK	NRSHGRAKRD	KSHSHTPSRR	MGRSRSPATA	KRGRSRSRTP
TKRGHSRSRS	PQWRRSRSAQ	RWGRSRSPQR	RGRSRSPQRP	GWSRSRNTQR
RGRSRSARRG	RSHSRSPATR	GRSRSRTPAR	RGRSRSRTPA	RRRSRSRTPT
RRRSRSRTPA	RRGRSRSRTP	ARRRSRTRSP	VRRRSRSRSP	ARRSGRSRSR
TPARRGRSRS	RTPARRGRSR	SRTPARRSGR	SRSRTPARRG	RSRSRTPRRG
RSRSRSLVRR	GRSHSRTPQR	RGRSGSSSER	KNKSRTSQRR	SRSNSSPEMK
KSRISSRRSR	SLSSPRSKAK	SRLSLRRSLS	GSSPCPKQKS	QTPPRRSRSG
SSQPKAKSRT	PPRRSRSSSS	PPPKQKSKTP	SRQSHSSSSP	HPKVKSGTPP
RQGSITSPQA	NEQSVTPQRR	SCFESSPDPE	LKSRTPSRHS	CSGSSPPRVK
SSTPPRQSPS	RSSSPQPKVK	AIISPRQRSH	SGSSSPSPSR	VTSRTTPRRS
RSVSPCSNVE	SRLLPRYSHS	GSSSPDTKVK	PETPPRQSHS	GSISPYPKVK
AQTPPGPSLS	GSKSPCPQEK	SKDSLVQSCP	GSLSLCAGVK	SSTPPGESYF
GVSSLQLKGQ	SQTSPDHRSD	TSSPEVRQSH	SESPSLQSKS	QTSPKGGRSR
SSSPVTELAS	RSPIRQDRGE	FSASPMLKSG	MSPEQSRFQS	DSSSYPTVDS
NSLLGQSRLE	TAESKEKMAL	PPQEDATASP	PRQKDKFSPF	PVQDRPESSL
VFKDTLRTPP	RERSGAGSSP	ETKEQNSALP	TSSQDEELME	VVEKSEEPAG
QILSHLSSEL	KEMSTSNFES	SPEVEERPAV	SLTLDQSQSQ	ASLEAVEVPS
MASSWGGPHF	SPEHKELSNS	PLRENSFGSP	LEFRNSGPLG	TEMNTGFSSE
VKEDLNGPFL	NQLETDPSLD	MKEQSTRSSG	HSSSELSPDA	VEKAGMSSNQ
SISSPVLDAV	PRTPSRERSS	SASSPEMKDG	LPRTPSRRSR	SGSSPGLRDG
SGTPSRHSLS	GSSPGMKDIP	RTPSRGRSEC	DSSPEPKALP	QTPRPRSRSP
SSPELNNKCL	TPQRERSGSE	SSVDQKTVAR	TPLGQRSRSG	SSQELDVKPS
ASPQERSESD	SSPDSKAKTR	TPLRQRSRSG	SSPEVDSKSR	LSPRRSRSGS
SPEVKDKPRA	APRAQSGSDS	SPEPKAPAPR	ALPRRSRSGS	SSKGRGPSPE
GSSSTESSPE	HPPKSRTARR	GSRSSPEPKT	KSRTPPRRRS	SRSSPELTRK
ARLSRRSRSA	SSSPETRSRT	PPRHRRSPSV	SSPEPAEKSR	SSRRRRSASS
PRTKTTSRRG	RSPSPKPRGL	QRSRSRSRRE	KTRTTRRRDR	SGSSQSTSRR
RQRSRSRSRV	TRRRRGGSGY	HSRSPARQES	SRTSSRRRRG	RSRTPPTSRK
RSRSRTSPAP	WKRSRSRASP	ATHRRSRSRT	PLISRRRSRS	RTSPVSRRRS
RSRTSVTRRR	SRSRASPVSR	RRSRSRTPPV	TRRRSRSRTP	TTRRRSRSRT
PPVTRRRSRS	RTPPVTRRRS	RSRTSPITRR	RSRSRTSPVT	RRRSRSRTSP
VTRRRSRSRT	SPVTRRRSRS	RTPPAIRRRS	RSRTPLLPRK	RSRSRSPLAI
RRRSRSRTPR	TARGKRSLTR	SPPAIRRRSA	SGSSSDRSRS	ATPPATRNHS
GSRTPPVALN	SSRMSCFSRP	SMSPTPLDRC	RSPGMLEPLG	SSRTPMSVLQ
QAGGSMMDGP	GPRIPDHQRT	SVPENHAQSR	IALALTAISL	GTARPPPSMS
AAGLAARMSQ	VPAPVPLMSL	RTAPAANLAS	RIPAASAAAM	NLASARTPAI
PTAVNLADSR	TPAAAAAMNL	ASPRTAVAPS	AVNLADPRTP	TAPAVNLAGA
RTPAALAALS	LTGSGTPPTA	ANYPSSSRTP	QAPASANLVG	PRSAHATAPV
NIAGSRTAAA	LAPASLTSAR	MAPALSGANL	TSPRVPLSAY	ERVSGRTSPP
LLDRARSRTP	PSAPSQSRMT	SERAPSPSSR	MGQAPSQSLL	PPAQDQPRSP
VPSAFSDQSR	CLIAQTTPVA	GSQSLSSGAV	ATTTSSAGDH	NGMLSVPAPG
VPHSDVGEPP	ASTGAQQPSA	LAALQPAKER	RSSSSSSSSS	SSSSSSSSSS
SSSSSSGSSS	SDSEGSSLPV	QPEVALKRVP	SPTPAPKEAV	REGRPPEPTP
AKRKRRSSSS	SSSSSSSSSS	SSSSSSSSSS	SSSSSSSSSS	SSSSSSSSPS
PAKPGPQALP	KPASPKKPPP	GERRSRSPRK	PIDSLRDSRS	LSYSPVERRR
PSPQPSPRDQ	QSSSSERGSR	RGQRGDSRSP	SHKRRRETPS	PRPMRHRSSR
SP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як процесінг мРНК, сплайсінг мРНК. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Blencowe B.J., Issner R., Nickerson J.A., Sharp P.A. (1998). A coactivator of pre-mRNA splicing. Genes Dev. 12: 996—1009. PMID 9531537 DOI:10.1101/gad.12.7.996
Jurica M.S., Licklider L.J., Gygi S.P., Grigorieff N., Moore M.J. (2002). Purification and characterization of native spliceosomes suitable for three-dimensional structural analysis. RNA. 8: 426—439. PMID 11991638 DOI:10.1017/S1355838202021088
Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
Grainger R.J., Barrass J.D., Jacquier A., Rain J.-C., Beggs J.D. (2009). Physical and genetic interactions of yeast Cwc21p, an ortholog of human SRm300/SRRM2, suggest a role at the catalytic center of the spliceosome. RNA. 15: 2161—2173. PMID 19854871 DOI:10.1261/rna.1908309

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:16639 (англ.) . Процитовано 27 лютого 2017.
↑ UniProt, Q9UQ35 (англ.) . Архів оригіналу за 8 березня 2017. Процитовано 27 лютого 2017.