SRSF2 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 2KN4, 2LEA, 2LEB, 2LEC | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | SRSF2, PR264, SC-35, SC35, SFRS2, SFRS2A, SRp30b, serine/arginine-rich splicing factor 2, serine and arginine rich splicing factor 2 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 600813 MGI: 98284 HomoloGene: 37721 GeneCards: SRSF2 |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
гострий мієлоїдний лейкоз[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0001106 transcription corepressor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nucleic acid binding • RNA binding • protein kinase C binding • pre-mRNA binding |
---|
Клітинна компонента | • PML body • nuclear speck • нуклеоплазма • екзосома • клітинне ядро • гіалоплазма • spliceosomal complex • interchromatin granule • цитоплазма |
---|
Біологічний процес | • mRNA splicing, via spliceosome • termination of RNA polymerase II transcription • mRNA processing • mRNA export from nucleus • Сплайсинг РНК • mRNA 3'-end processing • RNA export from nucleus • negative regulation of nucleic acid-templated transcription • GO:0007067 мітоз • regulation of alternative mRNA splicing, via spliceosome • response to vitamin E • regulation of RNA splicing • mRNA cis splicing, via spliceosome |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/5/5e/PBB_GE_SFRS2_200753_x_at_fs.png/250px-PBB_GE_SFRS2_200753_x_at_fs.png)
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/f/fc/PBB_GE_SFRS2_200754_x_at_fs.png/250px-PBB_GE_SFRS2_200754_x_at_fs.png)
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/2/2b/PBB_GE_SFRS2_214882_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_SFRS2_214882_s_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 17: 76.73 – 76.74 Mb | Хр. 11: 116.85 – 116.85 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
SRSF2 (англ. Serine and arginine rich splicing factor 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 221 амінокислот, а молекулярна маса — 25 476[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MSYGRPPPDV | | EGMTSLKVDN | | LTYRTSPDTL | | RRVFEKYGRV | | GDVYIPRDRY |
TKESRGFAFV | | RFHDKRDAED | | AMDAMDGAVL | | DGRELRVQMA | | RYGRPPDSHH |
SRRGPPPRRY | | GGGGYGRRSR | | SPRRRRRSRS | | RSRSRSRSRS | | RSRYSRSKSR |
SRTRSRSRST | | SKSRSARRSK | | SKSSSVSRSR | | SRSRSRSRSR | | SPPPVSKRES |
KSRSRSKSPP | | KSPEEEGAVS | | S |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у ядрі.
Література
- Fu X.-D., Maniatis T. (1992). Isolation of a complementary DNA that encodes the mammalian splicing factor SC35. Science. 256: 535—538. PMID 1373910 DOI:10.1126/science.1373910
- Vellard M., Sureau A., Soret J., Martinerie C., Perbal B. (1992). A potential splicing factor is encoded by the opposite strand of the trans-spliced c-myb exon. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 89: 2511—2515. PMID 1557353 DOI:10.1073/pnas.89.7.2511
- Sureau A., Perbal B. (1994). Several mRNAs with variable 3' untranslated regions and different stability encode the human PR264/SC35 splicing factor. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 91: 932—936. PMID 8302870 DOI:10.1073/pnas.91.3.932
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Sureau A., Soret J., Vellard M., Crochet J., Perbal B. (1992). The PR264/c-myb connection: expression of a splicing factor modulated by a nuclear protooncogene. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 89: 11683—11687. PMID 1465383 DOI:10.1073/pnas.89.24.11683
- Zahler A.M., Lane W.S., Stolk J.A., Roth M.B. (1992). SR proteins: a conserved family of pre-mRNA splicing factors. Genes Dev. 6: 837—847. PMID 1577277 DOI:10.1101/gad.6.5.837
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з SRSF2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10783 (англ.) . Архів оригіналу за 28 травня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q01130 (англ.) . Архів оригіналу за 27 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |