SRSF2

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2KN4, 2LEA, 2LEB, 2LEC

Ідентифікатори

Символи

SRSF2, PR264, SC-35, SC35, SFRS2, SFRS2A, SRp30b, serine/arginine-rich splicing factor 2, serine and arginine rich splicing factor 2

Зовнішні ІД

OMIM: 600813 MGI: 98284 HomoloGene: 37721 GeneCards: SRSF2

Пов'язані генетичні захворювання

гострий мієлоїдний лейкоз^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001106 transcription corepressor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nucleic acid binding • RNA binding • protein kinase C binding • pre-mRNA binding
Клітинна компонента	• PML body • nuclear speck • нуклеоплазма • екзосома • клітинне ядро • гіалоплазма • spliceosomal complex • interchromatin granule • цитоплазма
Біологічний процес	• mRNA splicing, via spliceosome • termination of RNA polymerase II transcription • mRNA processing • mRNA export from nucleus • Сплайсинг РНК • mRNA 3'-end processing • RNA export from nucleus • negative regulation of nucleic acid-templated transcription • GO:0007067 мітоз • regulation of alternative mRNA splicing, via spliceosome • response to vitamin E • regulation of RNA splicing • mRNA cis splicing, via spliceosome
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


6427


20382

Ensembl


ENSG00000161547


ENSMUSG00000034120

UniProt


Q01130


Q62093

RefSeq (мРНК)


NM_001195427 NM_003016


NM_011358

RefSeq (білок)


NP_001182356 NP_003007


NP_035488

Локус (UCSC)

Хр. 17: 76.73 – 76.74 Mb

Хр. 11: 116.85 – 116.85 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SRSF2 (англ. Serine and arginine rich splicing factor 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 221 амінокислот, а молекулярна маса — 25 476^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSYGRPPPDV	EGMTSLKVDN	LTYRTSPDTL	RRVFEKYGRV	GDVYIPRDRY
TKESRGFAFV	RFHDKRDAED	AMDAMDGAVL	DGRELRVQMA	RYGRPPDSHH
SRRGPPPRRY	GGGGYGRRSR	SPRRRRRSRS	RSRSRSRSRS	RSRYSRSKSR
SRTRSRSRST	SKSRSARRSK	SKSSSVSRSR	SRSRSRSRSR	SPPPVSKRES
KSRSRSKSPP	KSPEEEGAVS	S

A: Аланін
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у ядрі.

Література

Fu X.-D., Maniatis T. (1992). Isolation of a complementary DNA that encodes the mammalian splicing factor SC35. Science. 256: 535—538. PMID 1373910 DOI:10.1126/science.1373910
Vellard M., Sureau A., Soret J., Martinerie C., Perbal B. (1992). A potential splicing factor is encoded by the opposite strand of the trans-spliced c-myb exon. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 89: 2511—2515. PMID 1557353 DOI:10.1073/pnas.89.7.2511
Sureau A., Perbal B. (1994). Several mRNAs with variable 3' untranslated regions and different stability encode the human PR264/SC35 splicing factor. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 91: 932—936. PMID 8302870 DOI:10.1073/pnas.91.3.932
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Sureau A., Soret J., Vellard M., Crochet J., Perbal B. (1992). The PR264/c-myb connection: expression of a splicing factor modulated by a nuclear protooncogene. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 89: 11683—11687. PMID 1465383 DOI:10.1073/pnas.89.24.11683
Zahler A.M., Lane W.S., Stolk J.A., Roth M.B. (1992). SR proteins: a conserved family of pre-mRNA splicing factors. Genes Dev. 6: 837—847. PMID 1577277 DOI:10.1101/gad.6.5.837

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з SRSF2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10783 (англ.) . Архів оригіналу за 28 травня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, Q01130 (англ.) . Архів оригіналу за 27 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.