SSBP3

Ідентифікатори

Символи

SSBP3, CSDP, SSDP, SSDP1, single stranded DNA binding protein 3

Зовнішні ІД

OMIM: 607390 MGI: 1919725 HomoloGene: 23411 GeneCards: SSBP3

Онтологія гена
Молекулярна функція	• single-stranded DNA binding • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента	• клітинне ядро • GO:0009327 protein-containing complex
Біологічний процес	• midbrain-hindbrain boundary initiation • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • prechordal plate formation • head morphogenesis • positive regulation of anterior head development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • hematopoietic progenitor cell differentiation • transcription, DNA-templated • positive regulation of cell population proliferation • transcription by RNA polymerase II • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • head development • GO:0034622 protein-containing complex assembly
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


23648


72475

Ensembl


ENSG00000157216


ENSMUSG00000061887

UniProt


Q9BWW4


Q9D032

RefSeq (мРНК)


NM_001009955 NM_018070 NM_145716


NM_023672 NM_198438 NM_001355532

RefSeq (білок)


NP_001009955 NP_060540 NP_663768


NP_076161 NP_940840 NP_001342461

Локус (UCSC)

Хр. 1: 54.23 – 54.41 Mb

Хр. 4: 106.77 – 106.91 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SSBP3 (англ. Single stranded DNA binding protein 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 388 амінокислот, а молекулярна маса — 40 421^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MFAKGKGSAV	PSDGQAREKL	ALYVYEYLLH	VGAQKSAQTF	LSEIRWEKNI
TLGEPPGFLH	SWWCVFWDLY	CAAPERRDTC	EHSSEAKAFH	DYSAAAAPSP
VLGNIPPNDG	MPGGPIPPGF	FQGPPGSQPS	PHAQPPPHNP	SSMMGPHSQP
FMSPRYAGGP	RPPIRMGNQP	PGGVPGTQPL	LPNSMDPTRQ	QGHPNMGGSM
QRMNPPRGMG	PMGPGPQNYG	SGMRPPPNSL	GPAMPGINMG	PGAGRPWPNP
NSANSIPYSS	SSPGTYVGPP	GGGGPPGTPI	MPSPADSTNS	SDNIYTMINP
VPPGGSRSNF	PMGPGSDGPM	GGMGGMEPHH	MNGSLGSGDI	DGLPKNSPNN
ISGISNPPGT	PRDDGELGGN	FLHSFQNDNY	SPSMTMSV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

Castro P.D., Liang H., Liang J.C., Nagarajan L. (2002). A novel, evolutionarily conserved gene family with putative sequence-specific single-stranded DNA-binding activity. Genomics. 80: 78—85. PMID 12079286 DOI:10.1006/geno.2002.6805
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:15674 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.
↑ UniProt, Q9BWW4 (англ.) . Архів оригіналу за 13 листопада 2017. Процитовано 28 серпня 2017.