SSRP1
SSRP1 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | SSRP1, FACT, FACT80, T160, Structure specific recognition protein 1 | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 604328 MGI: 107912 HomoloGene: 110735 GeneCards: SSRP1 | ||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
![]() ![]() | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 11: 57.33 – 57.34 Mb | Хр. 2: 84.87 – 84.88 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | [1] | [2] | |||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
SSRP1 (англ. Structure specific recognition protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 709 амінокислот, а молекулярна маса — 81 075[4].
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MAETLEFNDV | YQEVKGSMND | GRLRLSRQGI | IFKNSKTGKV | DNIQAGELTE | ||||
GIWRRVALGH | GLKLLTKNGH | VYKYDGFRES | EFEKLSDFFK | THYRLELMEK | ||||
DLCVKGWNWG | TVKFGGQLLS | FDIGDQPVFE | IPLSNVSQCT | TGKNEVTLEF | ||||
HQNDDAEVSL | MEVRFYVPPT | QEDGVDPVEA | FAQNVLSKAD | VIQATGDAIC | ||||
IFRELQCLTP | RGRYDIRIYP | TFLHLHGKTF | DYKIPYTTVL | RLFLLPHKDQ | ||||
RQMFFVISLD | PPIKQGQTRY | HFLILLFSKD | EDISLTLNMN | EEEVEKRFEG | ||||
RLTKNMSGSL | YEMVSRVMKA | LVNRKITVPG | NFQGHSGAQC | ITCSYKASSG | ||||
LLYPLERGFI | YVHKPPVHIR | FDEISFVNFA | RGTTTTRSFD | FEIETKQGTQ | ||||
YTFSSIEREE | YGKLFDFVNA | KKLNIKNRGL | KEGMNPSYDE | YADSDEDQHD | ||||
AYLERMKEEG | KIREENANDS | SDDSGEETDE | SFNPGEEEED | VAEEFDSNAS | ||||
ASSSSNEGDS | DRDEKKRKQL | KKAKMAKDRK | SRKKPVEVKK | GKDPNAPKRP | ||||
MSAYMLWLNA | SREKIKSDHP | GISITDLSKK | AGEIWKGMSK | EKKEEWDRKA | ||||
EDARRDYEKA | MKEYEGGRGE | SSKRDKSKKK | KKVKVKMEKK | STPSRGSSSK | ||||
SSSRQLSESF | KSKEFVSSDE | SSSGENKSKK | KRRRSEDSEE | EELASTPPSS | ||||
EDSASGSDE |
Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, пошкодження ДНК, репарація ДНК, реплікація ДНК. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі, хромосомах.
Література
- Bruhn S.L., Pil P.M., Essigmann J.M., Housman D.E., Lippard S.J. (1992). Isolation and characterization of human cDNA clones encoding a high mobility group box protein that recognizes structural distortions to DNA caused by binding of the anticancer agent cisplatin. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 89: 2307—2311. PMID 1372440 DOI:10.1073/pnas.89.6.2307
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Orphanides G., LeRoy G., Chang C.-H., Luse D.S., Reinberg D. (1998). FACT, a factor that facilitates transcript elongation through nucleosomes. Cell. 92: 105—116. PMID 9489704 DOI:10.1016/S0092-8674(00)80903-4
- Dyer M.A., Hayes P.J., Baron M.H. (1998). The HMG domain protein SSRP1/PREIIBF is involved in activation of the human embryonic beta-like globin gene. Mol. Cell. Biol. 18: 2617—2628. PMID 9566881 DOI:10.1128/MCB.18.5.2617
- LeRoy G., Orphanides G., Lane W.S., Reinberg D. (1998). Requirement of RSF and FACT for transcription of chromatin templates in vitro. Science. 282: 1900—1904. PMID 9836642 DOI:10.1126/science.282.5395.1900
- Orphanides G., Wu W.-H., Lane W.S., Hampsey M., Reinberg D. (1999). The chromatin-specific transcription elongation factor FACT comprises human SPT16 and SSRP1 proteins. Nature. 400: 284—288. PMID 10421373 DOI:10.1038/22350
Примітки
Див. також
- Хромосома 11
![]() | Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
|