SUGP2 |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/c/c3/Protein_SFRS14_PDB_1x4p.png/250px-Protein_SFRS14_PDB_1x4p.png) |
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | SUGP2, SFRS14, SURP and G-patch domain containing 2, SRFS14 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 607993 MGI: 2678085 HomoloGene: 8923 GeneCards: SUGP2 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • nucleic acid binding • RNA binding |
---|
Клітинна компонента | • клітинне ядро • нуклеоплазма • ядерні тільця |
---|
Біологічний процес | • mRNA processing • GO:0033168, GO:0036404, GO:1902360 RNA processing • Сплайсинг РНК |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/d/d7/PBB_GE_SFRS14_64371_at_fs.png/250px-PBB_GE_SFRS14_64371_at_fs.png)
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/d/de/PBB_GE_SFRS14_214092_x_at_fs.png/250px-PBB_GE_SFRS14_214092_x_at_fs.png)
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/e/eb/PBB_GE_SFRS14_213505_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_SFRS14_213505_s_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | NM_001017392 NM_014884 NM_001321697 NM_001321698 NM_001321699
| NM_001352071 |
| |
---|
RefSeq (білок) | NP_001017392 NP_001308626 NP_001308627 NP_001308628 NP_055699
| NP_001339000 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 19: 18.99 – 19.03 Mb | Хр. 8: 70.23 – 70.28 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
SUGP2 (англ. SURP and G-patch domain containing 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 082 амінокислот, а молекулярна маса — 120 207[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MAARRITQET | | FDAVLQEKAK | | RYHMDASGEA | | VSETLQFKAQ | | DLLRAVPRSR |
AEMYDDVHSD | | GRYSLSGSVA | | HSRDAGREGL | | RSDVFPGPSF | | RSSNPSISDD |
SYFRKECGRD | | LEFSHSDSRD | | QVIGHRKLGH | | FRSQDWKFAL | | RGSWEQDFGH |
PVSQESSWSQ | | EYSFGPSAVL | | GDFGSSRLIE | | KECLEKESRD | | YDVDHPGEAD |
SVLRGGSQVQ | | ARGRALNIVD | | QEGSLLGKGE | | TQGLLTAKGG | | VGKLVTLRNV |
STKKIPTVNR | | ITPKTQGTNQ | | IQKNTPSPDV | | TLGTNPGTED | | IQFPIQKIPL |
GLDLKNLRLP | | RRKMSFDIID | | KSDVFSRFGI | | EIIKWAGFHT | | IKDDIKFSQL |
FQTLFELETE | | TCAKMLASFK | | CSLKPEHRDF | | CFFTIKFLKH | | SALKTPRVDN |
EFLNMLLDKG | | AVKTKNCFFE | | IIKPFDKYIM | | RLQDRLLKSV | | TPLLMACNAY |
ELSVKMKTLS | | NPLDLALALE | | TTNSLCRKSL | | ALLGQTFSLA | | SSFRQEKILE |
AVGLQDIAPS | | PAAFPNFEDS | | TLFGREYIDH | | LKAWLVSSGC | | PLQVKKAEPE |
PMREEEKMIP | | PTKPEIQAKA | | PSSLSDAVPQ | | RADHRVVGTI | | DQLVKRVIEG |
SLSPKERTLL | | KEDPAYWFLS | | DENSLEYKYY | | KLKLAEMQRM | | SENLRGADQK |
PTSADCAVRA | | MLYSRAVRNL | | KKKLLPWQRR | | GLLRAQGLRG | | WKARRATTGT |
QTLLSSGTRL | | KHHGRQAPGL | | SQAKPSLPDR | | NDAAKDCPPD | | PVGPSPQDPS |
LEASGPSPKP | | AGVDISEAPQ | | TSSPCPSADI | | DMKTMETAEK | | LARFVAQVGP |
EIEQFSIENS | | TDNPDLWFLH | | DQNSSAFKFY | | RKKVFELCPS | | ICFTSSPHNL |
HTGGGDTTGS | | QESPVDLMEG | | EAEFEDEPPP | | REAELESPEV | | MPEEEDEDDE |
DGGEEAPAPG | | GAGKSEGSTP | | ADGLPGEAAE | | DDLAGAPALS | | QASSGTCFPR |
KRISSKSLKV | | GMIPAPKRVC | | LIQEPKVHEP | | VRIAYDRPRG | | RPMSKKKKPK |
DLDFAQQKLT | | DKNLGFQMLQ | | KMGWKEGHGL | | GSLGKGIREP | | VSVGTPSEGE |
GLGADGQEHK | | EDTFDVFRQR | | MMQMYRHKRA | | NK |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.
Література
- Sampson N.D., Hewitt J.E. (2003). SF4 and SFRS14, two related putative splicing factors on human chromosome 19p13.11. Gene. 305: 91—100. PMID 12594045 DOI:10.1016/S0378-1119(02)01230-1
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:18641 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q8IX01 (англ.) . Архів оригіналу за 8 листопада 2016. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |