SUGP2

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1X4P

Ідентифікатори

Символи

SUGP2, SFRS14, SURP and G-patch domain containing 2, SRFS14

Зовнішні ІД

OMIM: 607993 MGI: 2678085 HomoloGene: 8923 GeneCards: SUGP2

Онтологія гена
Молекулярна функція	• nucleic acid binding • RNA binding
Клітинна компонента	• клітинне ядро • нуклеоплазма • ядерні тільця
Біологічний процес	• mRNA processing • GO:0033168, GO:0036404, GO:1902360 RNA processing • Сплайсинг РНК
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


10147


234373

Ensembl


ENSG00000064607


ENSMUSG00000036054

UniProt


Q8IX01


Q8CH09

RefSeq (мРНК)

NM_001017392 NM_014884 NM_001321697 NM_001321698 NM_001321699
NM_001352071


NM_001168290 NM_172755

RefSeq (білок)

NP_001017392 NP_001308626 NP_001308627 NP_001308628 NP_055699
NP_001339000


NP_001161762 NP_766343

Локус (UCSC)

Хр. 19: 18.99 – 19.03 Mb

Хр. 8: 70.23 – 70.28 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SUGP2 (англ. SURP and G-patch domain containing 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 082 амінокислот, а молекулярна маса — 120 207^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAARRITQET	FDAVLQEKAK	RYHMDASGEA	VSETLQFKAQ	DLLRAVPRSR
AEMYDDVHSD	GRYSLSGSVA	HSRDAGREGL	RSDVFPGPSF	RSSNPSISDD
SYFRKECGRD	LEFSHSDSRD	QVIGHRKLGH	FRSQDWKFAL	RGSWEQDFGH
PVSQESSWSQ	EYSFGPSAVL	GDFGSSRLIE	KECLEKESRD	YDVDHPGEAD
SVLRGGSQVQ	ARGRALNIVD	QEGSLLGKGE	TQGLLTAKGG	VGKLVTLRNV
STKKIPTVNR	ITPKTQGTNQ	IQKNTPSPDV	TLGTNPGTED	IQFPIQKIPL
GLDLKNLRLP	RRKMSFDIID	KSDVFSRFGI	EIIKWAGFHT	IKDDIKFSQL
FQTLFELETE	TCAKMLASFK	CSLKPEHRDF	CFFTIKFLKH	SALKTPRVDN
EFLNMLLDKG	AVKTKNCFFE	IIKPFDKYIM	RLQDRLLKSV	TPLLMACNAY
ELSVKMKTLS	NPLDLALALE	TTNSLCRKSL	ALLGQTFSLA	SSFRQEKILE
AVGLQDIAPS	PAAFPNFEDS	TLFGREYIDH	LKAWLVSSGC	PLQVKKAEPE
PMREEEKMIP	PTKPEIQAKA	PSSLSDAVPQ	RADHRVVGTI	DQLVKRVIEG
SLSPKERTLL	KEDPAYWFLS	DENSLEYKYY	KLKLAEMQRM	SENLRGADQK
PTSADCAVRA	MLYSRAVRNL	KKKLLPWQRR	GLLRAQGLRG	WKARRATTGT
QTLLSSGTRL	KHHGRQAPGL	SQAKPSLPDR	NDAAKDCPPD	PVGPSPQDPS
LEASGPSPKP	AGVDISEAPQ	TSSPCPSADI	DMKTMETAEK	LARFVAQVGP
EIEQFSIENS	TDNPDLWFLH	DQNSSAFKFY	RKKVFELCPS	ICFTSSPHNL
HTGGGDTTGS	QESPVDLMEG	EAEFEDEPPP	REAELESPEV	MPEEEDEDDE
DGGEEAPAPG	GAGKSEGSTP	ADGLPGEAAE	DDLAGAPALS	QASSGTCFPR
KRISSKSLKV	GMIPAPKRVC	LIQEPKVHEP	VRIAYDRPRG	RPMSKKKKPK
DLDFAQQKLT	DKNLGFQMLQ	KMGWKEGHGL	GSLGKGIREP	VSVGTPSEGE
GLGADGQEHK	EDTFDVFRQR	MMQMYRHKRA	NK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

Sampson N.D., Hewitt J.E. (2003). SF4 and SFRS14, two related putative splicing factors on human chromosome 19p13.11. Gene. 305: 91—100. PMID 12594045 DOI:10.1016/S0378-1119(02)01230-1
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:18641 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, Q8IX01 (англ.) . Архів оригіналу за 8 листопада 2016. Процитовано 12 вересня 2017.