SUPT6H
SUPT6H | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | SUPT6H, SPT6, SPT6H, emb-5, SPT6 homolog, histone chaperone, SPT6 homolog, histone chaperone and transcription elongation factor | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 601333 MGI: 107726 HomoloGene: 40661 GeneCards: SUPT6H | ||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
![]() ![]() | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 17: 28.66 – 28.7 Mb | Хр. 11: 78.1 – 78.14 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | [1] | [2] | |||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
SUPT6H (англ. SPT6 homolog, histone chaperone) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 726 амінокислот, а молекулярна маса — 199 073[4].
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MSDFVESEAE | ESEEEYNDEG | EVVPRVTKKF | VEEEDDDEEE | EEENLDDQDE | ||||
QGNLKGFIND | DDDEDEGEED | EGSDSGDSED | DVGHKKRKRT | SFDDRLEDDD | ||||
FDLIEENLGV | KVKRGQKYRR | VKKMSDDEDD | DEEEYGKEEH | EKEAIAEEIF | ||||
QDGEGEEGQE | AMEAPMAPPE | EEEEDDEESD | IDDFIVDDDG | QPLKKPKWRK | ||||
KLPGYTDAAL | QEAQEIFGVD | FDYDEFEKYN | EYDEELEEEY | EYEDDEAEGE | ||||
IRVRPKKTTK | KRVSRRSIFE | MYEPSELESS | HLTDQDNEIR | ATDLPERFQL | ||||
RSIPVKGAED | DELEEEADWI | YRNAFATPTI | SLQESCDYLD | RGQPASSFSR | ||||
KGPSTIQKIK | EALGFMRNQH | FEVPFIAFYR | KEYVEPELHI | NDLWRVWQWD | ||||
EKWTQLRIRK | ENLTRLFEKM | QAYQYEQISA | DPDKPLADGI | RALDTTDMER | ||||
LKDVQSMDEL | KDVYNHFLLY | YGRDIPKMQN | AAKASRKKLK | RVREEGDEEG | ||||
EGDEAEDEEQ | RGPELKQASR | RDMYTICQSA | GLDGLAKKFG | LTPEQFGENL | ||||
RDSYQRHETE | QFPAEPLELA | KDYVCSQFPT | PEAVLEGARY | MVALQIAREP | ||||
LVRQVLRQTF | QERAKLNITP | TKKGRKDVDE | AHYAYSFKYL | KNKPVKELRD | ||||
DQFLKICLAE | DEGLLTTDIS | IDLKGVEGYG | NDQTYFEEIK | QFYYRDEFSH | ||||
QVQEWNRQRT | MAIERALQQF | LYVQMAKELK | NKLLAEAKEY | VIKACSRKLY | ||||
NWLRVAPYRP | DQQVEEDDDF | MDENQGKGIR | VLGIAFSSAR | DHPVFCALVN | ||||
GEGEVTDFLR | LPHFTKRRTA | WREEEREKKA | QDIETLKKFL | LNKKPHVVTV | ||||
AGENRDAQML | IEDVKRIVHE | LDQGQQLSSI | GVELVDNELA | ILYMNSKKSE | ||||
AEFRDYPPVL | RQAVSLARRI | QDPLIEFAQV | CSSDEDILCL | KFHPLQEHVV | ||||
KEELLNALYC | EFINRVNEVG | VDVNRAIAHP | YSQALIQYVC | GLGPRKGTHL | ||||
LKILKQNNTR | LESRTQLVTM | CHMGPKVFMN | CAGFLKIDTA | SLGDSTDSYI | ||||
EVLDGSRVHP | ETYEWARKMA | VDALEYDESA | EDANPAGALE | EILENPERLK | ||||
DLDLDAFAEE | LERQGYGDKH | ITLYDIRAEL | SCRYKDLRTA | YRSPNTEEIF | ||||
NMLTKETPET | FYIGKLIICN | VTGIAHRRPQ | GESYDQAIRN | DETGLWQCPF | ||||
CQQDNFPELS | EVWNHFDSGS | CPGQAIGVKT | RLDNGVTGFI | PTKFLSDKVV | ||||
KRPEERVKVG | MTVHCRIMKI | DIEKFSADLT | CRTSDLMDRN | NEWKLPKDTY | ||||
YDFDAEAADH | KQEEDMKRKQ | QRTTYIKRVI | AHPSFHNINF | KQAEKMMETM | ||||
DQGDVIIRPS | SKGENHLTVT | WKVSDGIYQH | VDVREEGKEN | AFSLGATLWI | ||||
NSEEFEDLDE | IVARYVQPMA | SFARDLLNHK | YYQDCSGGDR | KKLEELLIKT | ||||
KKEKPTFIPY | FICACKELPG | KFLLGYQPRG | KPRIEYVTVT | PEGFRYRGQI | ||||
FPTVNGLFRW | FKDHYQDPVP | GITPSSSSRT | RTPASINATP | ANINLADLTR | ||||
AVNALPQNMT | SQMFSAIAAV | TGQGQNPNAT | PAQWASSQYG | YGGSGGGSSA | ||||
YHVFPTPAQQ | PVATPLMTPS | YSYTTPSQPI | TTPQYHQLQA | STTPQSAQAQ | ||||
PQPSSSSRQR | QQQPKSNSHA | AIDWGKMAEQ | WLQEKEAERR | KQKQRLTPRP | ||||
SPSPMIESTP | MSIAGDATPL | LDEMDR |
Кодований геном білок за функціями належить до шаперонів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, транскрипція, регуляція транскрипції, транспорт, транспорт мРНК, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.
Література
- Nagase T., Seki N., Ishikawa K., Tanaka A., Nomura N. (1996). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. V. The coding sequences of 40 new genes (KIAA0161-KIAA0200) deduced by analysis of cDNA clones from human cell line KG-1. DNA Res. 3: 17—24. PMID 8724849 DOI:10.1093/dnares/3.1.17
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Wu-Baer F., Lane W.S., Gaynor R.B. (1998). Role of the human homolog of the yeast transcription factor SPT5 in HIV-1 Tat-activation. J. Mol. Biol. 277: 179—197. PMID 9514752 DOI:10.1006/jmbi.1997.1601
- Winkler M., aus Dem Siepen T., Stamminger T. (2000). Functional interaction between pleiotropic transactivator pUL69 of human cytomegalovirus and the human homolog of yeast chromatin regulatory protein SPT6. J. Virol. 74: 8053—8064. PMID 10933715 DOI:10.1128/JVI.74.17.8053-8064.2000
- Yoh S.M., Cho H., Pickle L., Evans R.M., Jones K.A. (2007). The Spt6 SH2 domain binds Ser2-P RNAPII to direct Iws1-dependent mRNA splicing and export. Genes Dev. 21: 160—174. PMID 17234882 DOI:10.1101/gad.1503107
- Yoh S.M., Lucas J.S., Jones K.A. (2008). The Iws1:Spt6:CTD complex controls cotranscriptional mRNA biosynthesis and HYPB/Setd2-mediated histone H3K36 methylation. Genes Dev. 22: 3422—3434. PMID 19141475 DOI:10.1101/gad.1720008
Примітки
Див. також
- Хромосома 17
![]() | Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
|
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |