SYT5 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | SYT5, synaptotagmin 5 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 600782 MGI: 1926368 HomoloGene: 55722 GeneCards: SYT5 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • clathrin binding • зв'язування з іоном металу • protein heterodimerization activity • calcium-dependent phospholipid binding • syntaxin binding • SNARE binding • phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate binding • phosphatidylserine binding • calcium ion binding |
---|
Клітинна компонента | • integral component of membrane • ендосома • мембрана • синапс • synaptic vesicle membrane • міжклітинні контакти • neuronal cell body • recycling endosome membrane • perinuclear region of cytoplasm • neuron projection • dense core granule • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • клітинна мембрана • proximal neuron projection • integral component of neuronal dense core vesicle membrane • аксон • exocytic vesicle |
---|
Біологічний процес | • synaptic vesicle endocytosis • chemical synaptic transmission • vesicle fusion • regulation of calcium ion-dependent exocytosis • calcium ion-regulated exocytosis of neurotransmitter • regulation of dopamine secretion • synaptic vesicle exocytosis • vesicle-mediated transport • calcium-ion regulated exocytosis • cellular response to calcium ion |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/8/86/PBB_GE_SYT5_206161_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_SYT5_206161_s_at_fs.png)
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/f/fe/PBB_GE_SYT5_206162_x_at_fs.png/250px-PBB_GE_SYT5_206162_x_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | | NM_016908 NM_001360421 NM_001360422 |
|
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 19: 55.17 – 55.18 Mb | Хр. 7: 4.54 – 4.55 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
SYT5 (англ. Synaptotagmin 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 386 амінокислот, а молекулярна маса — 42 900[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MFPEPPTPGP | | PSPDTPPDSS | | RISHGPVPPW | | ALATIVLVSG | | LLIFSCCFCL |
YRKSCRRRTG | | KKSQAQAQVH | | LQEVKGLGQS | | YIDKVQPEVE | | ELEPAPSGPG |
QQVADKHELG | | RLQYSLDYDF | | QSGQLLVGIL | | QAMGLAALDL | | GGSSDPYVRV |
YLLPDKRRRY | | ETKVHRQTLN | | PHFGETFAFK | | VPYVELGGRV | | LVMAVYDFDR |
FSRNDAIGEV | | RVPMSSVDLG | | RPVQAWRELQ | | AAPREEQEKL | | GDICFSLRYV |
PTAGKLTVIV | | LEAKNLKKMD | | VGGLSDPYVK | | VHLLQGGKKV | | RKKKTTIKKN |
TLNPYYNEAF | | SFEVPCDQVQ | | KVQVELTVLD | | YDKLGKNEAI | | GRVAVGAAAG |
GAGLRHWADM | | LANPRRPIAQ | | WHSLRPPDRV | | RLLPAP |
Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у мембрані, клітинних контактах, цитоплазматичних везикулах, синапсах, ендосомах.
Література
- Craxton M.A., Olsen A., Goedert M. (1997). Human synaptotagmin V (SYT5): sequence, genomic structure, and chromosomal location. Genomics. 42: 165—169. PMID 9177789 DOI:10.1006/geno.1997.4722
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Qiu X., Ge J., Gao Y., Teng M., Niu L. (2017). Structural analysis of Ca2+-binding pocket of synaptotagmin 5 C2A domain. Int. J. Biol. Macromol. 95: 946—953. PMID 27793683 DOI:10.1016/j.ijbiomac.2016.10.083
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11513 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
- ↑ UniProt, O00445 (англ.) . Архів оригіналу за 3 лютого 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |