SYT5

Ідентифікатори

Символи

SYT5, synaptotagmin 5

Зовнішні ІД

OMIM: 600782 MGI: 1926368 HomoloGene: 55722 GeneCards: SYT5

Онтологія гена
Молекулярна функція	• clathrin binding • зв'язування з іоном металу • protein heterodimerization activity • calcium-dependent phospholipid binding • syntaxin binding • SNARE binding • phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate binding • phosphatidylserine binding • calcium ion binding
Клітинна компонента	• integral component of membrane • ендосома • мембрана • синапс • synaptic vesicle membrane • міжклітинні контакти • neuronal cell body • recycling endosome membrane • perinuclear region of cytoplasm • neuron projection • dense core granule • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • клітинна мембрана • proximal neuron projection • integral component of neuronal dense core vesicle membrane • аксон • exocytic vesicle
Біологічний процес	• synaptic vesicle endocytosis • chemical synaptic transmission • vesicle fusion • regulation of calcium ion-dependent exocytosis • calcium ion-regulated exocytosis of neurotransmitter • regulation of dopamine secretion • synaptic vesicle exocytosis • vesicle-mediated transport • calcium-ion regulated exocytosis • cellular response to calcium ion
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


6861


53420

Ensembl


ENSG00000129990


ENSMUSG00000004961

UniProt


O00445


Q9R0N5

RefSeq (мРНК)


NM_001297774 NM_003180


NM_016908 NM_001360421 NM_001360422

RefSeq (білок)


NP_001284703 NP_003171


NP_001347350 NP_001347351

Локус (UCSC)

Хр. 19: 55.17 – 55.18 Mb

Хр. 7: 4.54 – 4.55 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SYT5 (англ. Synaptotagmin 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 386 амінокислот, а молекулярна маса — 42 900^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MFPEPPTPGP	PSPDTPPDSS	RISHGPVPPW	ALATIVLVSG	LLIFSCCFCL
YRKSCRRRTG	KKSQAQAQVH	LQEVKGLGQS	YIDKVQPEVE	ELEPAPSGPG
QQVADKHELG	RLQYSLDYDF	QSGQLLVGIL	QAMGLAALDL	GGSSDPYVRV
YLLPDKRRRY	ETKVHRQTLN	PHFGETFAFK	VPYVELGGRV	LVMAVYDFDR
FSRNDAIGEV	RVPMSSVDLG	RPVQAWRELQ	AAPREEQEKL	GDICFSLRYV
PTAGKLTVIV	LEAKNLKKMD	VGGLSDPYVK	VHLLQGGKKV	RKKKTTIKKN
TLNPYYNEAF	SFEVPCDQVQ	KVQVELTVLD	YDKLGKNEAI	GRVAVGAAAG
GAGLRHWADM	LANPRRPIAQ	WHSLRPPDRV	RLLPAP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у мембрані, клітинних контактах, цитоплазматичних везикулах, синапсах, ендосомах.

Література

Craxton M.A., Olsen A., Goedert M. (1997). Human synaptotagmin V (SYT5): sequence, genomic structure, and chromosomal location. Genomics. 42: 165—169. PMID 9177789 DOI:10.1006/geno.1997.4722
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Qiu X., Ge J., Gao Y., Teng M., Niu L. (2017). Structural analysis of Ca2+-binding pocket of synaptotagmin 5 C2A domain. Int. J. Biol. Macromol. 95: 946—953. PMID 27793683 DOI:10.1016/j.ijbiomac.2016.10.083

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11513 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, O00445 (англ.) . Архів оригіналу за 3 лютого 2017. Процитовано 12 вересня 2017.