TAF11 |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/8/8c/Protein_TAF11_PDB_1bh8.png/250px-Protein_TAF11_PDB_1bh8.png) |
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 1BH8, 1BH9 | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | TAF11, MGC:15243, TAF2I, TAFII28, PRO2134, TATA-box binding protein associated factor 11 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 600772 MGI: 1916026 HomoloGene: 55918 GeneCards: TAF11 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • protein heterodimerization activity • GO:0001105 transcription coactivator activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • vitamin D receptor binding • protein N-terminus binding • thyroid hormone receptor binding • DNA binding • transcription factor binding |
---|
Клітинна компонента | • комплекс Ґольджі • transcription factor TFIID complex • клітинне ядро • нуклеоплазма |
---|
Біологічний процес | • RNA polymerase II preinitiation complex assembly • transcription initiation from RNA polymerase II promoter • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription by RNA polymerase II • positive regulation by host of viral transcription • transcription, DNA-templated • snRNA transcription by RNA polymerase II • regulation of signal transduction by p53 class mediator • positive regulation of nucleic acid-templated transcription |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/f/f8/PBB_GE_TAF11_209358_at_fs.png/250px-PBB_GE_TAF11_209358_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 6: 34.88 – 34.89 Mb | Хр. 17: 28.12 – 28.13 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
TAF11 (англ. TATA-box binding protein associated factor 11) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 211 амінокислот, а молекулярна маса — 23 307[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MDDAHESPSD | | KGGETGESDE | | TAAVPGDPGA | | TDTDGIPEET | | DGDADVDLKE |
AAAEEGELES | | QDVSDLTTVE | | REDSSLLNPA | | AKKLKIDTKE | | KKEKKQKVDE |
DEIQKMQILV | | SSFSEEQLNR | | YEMYRRSAFP | | KAAIKRLIQS | | ITGTSVSQNV |
VIAMSGISKV | | FVGEVVEEAL | | DVCEKWGEMP | | PLQPKHMREA | | VRRLKSKGQI |
PNSKHKKIIF | | F |
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.
Література
- Kuzuhara T., Horikoshi M. (1996). Isolation and characterization of a cDNA encoding a human TFIID subunit containing a variety of putative structural motifs including direct repeats. Biol. Pharm. Bull. 19: 122—126. PMID 8820923 DOI:10.1248/bpb.19.122
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11544 (англ.) . Процитовано 6 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q15544 (англ.) . Архів оригіналу за 24 жовтня 2016. Процитовано 6 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
|
---|
(1) Основні домени |
---|
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
---|
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
---|
(1.4) NF-1 | |
---|
(1.5) RF-X | |
---|
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
---|
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | підродина 1 | |
---|
підродина 2 | |
---|
підродина 3 | - Стероїдні гормони
- Естроген-зв'язувальні
|
---|
підродина 4 | |
---|
підродина 5 | |
---|
підродина 6 | |
---|
підродина 0 | |
---|
|
---|
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
---|
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
---|
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
---|
(2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
---|
(2.6) WRKY | |
---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
---|
(3.1) Гомеобокс | |
---|
(3.2) Парний бокс | |
---|
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
---|
(3.4) Фактори теплового шоку | |
---|
(3.5) Триптофановий кластер | |
---|
(3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
---|
(4.1) RHR | |
---|
(4.2) STAT | |
---|
(4.3) p53 | |
---|
(4.4) MADS | |
---|
(4.6) TATA | |
---|
(4.7) Високомобільна група | |
---|
(4.9) Grainyhead | |
---|
(4.10) Домен холодового шоку | |
---|
(4.11) Runt | |
---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
---|
(0.2) HMGI(Y) | |
---|
(0.3) Pocket домен | |
---|
(0.5) AP2/EREBP-подібні | |
---|
(0.6) Інші | |
---|
|
|