TBCD

Ідентифікатори

Символи

TBCD, SSD-1, tfcD, tubulin folding cofactor D, PEBAT

Зовнішні ІД

OMIM: 604649 MGI: 1919686 HomoloGene: 4368 GeneCards: TBCD

Онтологія гена
Молекулярна функція	• chaperone binding • GO:0005097, GO:0005099, GO:0005100 GTPase activator activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • beta-tubulin binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • lateral plasma membrane • мембрана • bicellular tight junction • Адгезивні контакти • клітинна мембрана • міжклітинні контакти • мікротрубочка • центросома • центр організації мікротрубочок • цитоскелет
Біологічний процес	• negative regulation of cell-substrate adhesion • negative regulation of microtubule polymerization • adherens junction assembly • згортання білків • bicellular tight junction assembly • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity • post-chaperonin tubulin folding pathway • GO:0007067 мітоз • cell morphogenesis involved in neuron differentiation • tubulin complex assembly • microtubule cytoskeleton organization
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


6904


108903

Ensembl


ENSG00000278759 ENSG00000141556


ENSMUSG00000039230

UniProt


Q9BTW9


Q8BYA0

RefSeq (мРНК)


NM_001033052 NM_005993


NM_029878

RefSeq (білок)


NP_005984


NP_084154

Локус (UCSC)

Хр. 17: 82.75 – 82.95 Mb

Хр. 11: 121.34 – 121.51 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

TBCD (англ. Tubulin folding cofactor D) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 192 амінокислот, а молекулярна маса — 132 600^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MALSDEPAAG	GPEEEAEDET	LAFGAALEAF	GESAETRALL	GRLREVHGGG
AEREVALERF	RVIMDKYQEQ	PHLLDPHLEW	MMNLLLDIVQ	DQTSPASLVH
LAFKFLYIIT	KVRGYKTFLR	LFPHEVADVE	PVLDLVTIQN	PKDHEAWETR
YMLLLWLSVT	CLIPFDFSRL	DGNLLTQPGQ	ARMSIMDRIL	QIAESYLIVS
DKARDAAAVL	VSRFITRPDV	KQSKMAEFLD	WSLCNLARSS	FQTMQGVITM
DGTLQALAQI	FKHGKREDCL	PYAATVLRCL	DGCRLPESNQ	TLLRKLGVKL
VQRLGLTFLK	PKVAAWRYQR	GCRSLAANLQ	LLTQGQSEQK	PLILTEDDDE
DDDVPEGVER	VIEQLLVGLK	DKDTVVRWSA	AKGIGRMAGR	LPRALADDVV
GSVLDCFSFQ	ETDKAWHGGC	LALAELGRRG	LLLPSRLVDV	VAVILKALTY
DEKRGACSVG	TNVRDAACYV	CWAFARAYEP	QELKPFVTAI	SSALVIAAVF
DRDINCRRAA	SAAFQENVGR	QGTFPHGIDI	LTTADYFAVG	NRSNCFLVIS
VFIAGFPEYT	QPMIDHLVTM	KISHWDGVIR	ELAARALHNL	AQQAPEFSAT
QVFPRLLSMT	LSPDLHMRHG	SILACAEVAY	ALYKLAAQEN	RPVTDHLDEQ
AVQGLKQIHQ	QLYDRQLYRG	LGGQLMRQAV	CVLIEKLSLS	KMPFRGDTVI
DGWQWLINDT	LRHLHLISSH	SRQQMKDAAV	SALAALCSEY	YMKEPGEADP
AIQEELITQY	LAELRNPEEM	TRCGFSLALG	ALPGFLLKGR	LQQVLTGLRA
VTHTSPEDVS	FAESRRDGLK	AIARICQTVG	VKAGAPDEAV	CGENVSQIYC
ALLGCMDDYT	TDSRGDVGTW	VRKAAMTSLM	DLTLLLARSQ	PELIEAHTCE
RIMCCVAQQA	SEKIDRFRAH	AASVFLTLLH	FDSPPIPHVP	HRGELEKLFP
RSDVASVNWS	APSQAFPRIT	QLLGLPTYRY	HVLLGLVVSL	GGLTESTIRH
STQSLFEYMK	GIQSDPQALG	SFSGTLLQIF	EDNLLNERVS	VPLLKTLDHV
LTHGCFDIFT	TEEDHPFAVK	LLALCKKEIK	NSKDIQKLLS	GIAVFCEMVQ
FPGDVRRQAL	LQLCLLLCHR	FPLIRKTTAS	QVYETLLTYS	DVVGADVLDE
VVTVLSDTAW	DAELAVVREQ	RNRLCDLLGV	PRPQLVPQPG	AC

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до шаперонів, активаторів гтфаз. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, цитоскелеті, мембрані, клітинних контактах, щільних контактах.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Martin L., Fanarraga M.L., Aloria K., Zabala J.C. (2000). Tubulin folding cofactor D is a microtubule destabilizing protein. FEBS Lett. 470: 93—95. PMID 10722852 DOI:10.1016/S0014-5793(00)01293-X
Bhamidipati A., Lewis S.A., Cowan N.J. (2000). ADP ribosylation factor-like protein 2 (Arl2) regulates the interaction of tubulin-folding cofactor D with native tubulin. J. Cell Biol. 149: 1087—1096. PMID 10831612 DOI:10.1083/jcb.149.5.1087
Tian G., Thomas S., Cowan N.J. (2010). Effect of TBCD and its regulatory interactor Arl2 on tubulin and microtubule integrity. Cytoskeleton. 67: 706—714. PMID 20740604 DOI:10.1002/cm.20480

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11581 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9BTW9 (англ.) . Архів оригіналу за 24 липня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.