TCF12

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2KNH, 4JOL

Ідентифікатори

Символи

TCF12, CRS3, HEB, HTF4, HsT17266, bHLHb20, TCF-12, transcription factor 12, p64, HH26

Зовнішні ІД

OMIM: 600480 MGI: 101877 HomoloGene: 40774 GeneCards: TCF12

Реагує на сполуку

Viroporin 3a^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding • protein dimerization activity • protein homodimerization activity • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • HMG box domain binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • transcription factor binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • bHLH transcription factor binding • E-box binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein heterodimerization activity • SMAD binding • cAMP response element binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента	• цитоплазма • transcription regulator complex • RNA polymerase II transcription regulator complex • клітинне ядро • nuclear speck • внутрішньоклітинна мембранна органела • нуклеоплазма
Біологічний процес	• диференціація клітин • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • muscle organ development • transcription, DNA-templated • нейробіологія розвитку • multicellular organism development • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • GO:1901313 positive regulation of gene expression • positive regulation of neuron differentiation • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • regulation of hematopoietic stem cell differentiation
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


6938


21406

Ensembl


ENSG00000140262


ENSMUSG00000032228

UniProt


Q99081


Q61286

RefSeq (мРНК)

NM_001306219 NM_001306220 NM_003205 NM_207036 NM_207037
NM_207038 NM_207040 NM_001322151 NM_001322152 NM_001322154 NM_001322156 NM_001322157 NM_001322158 NM_001322159 NM_001322161 NM_001322162 NM_001322164 NM_001322165


NM_001253862 NM_001253863 NM_001253864 NM_001253865 NM_011544

RefSeq (білок)

NP_001293148 NP_001293149 NP_001309080 NP_001309081 NP_001309083
NP_001309085 NP_001309086 NP_001309087 NP_001309088 NP_001309090 NP_001309091 NP_001309093 NP_001309094 NP_003196 NP_996919 NP_996920 NP_996921 NP_996923


NP_001240791 NP_001240792 NP_001240793 NP_001240794 NP_035674

Локус (UCSC)

Хр. 15: 56.92 – 57.3 Mb

Хр. 9: 71.75 – 72.02 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

TCF12 (англ. Transcription factor 12) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 682 амінокислот, а молекулярна маса — 72 965^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MNPQQQRMAA	IGTDKELSDL	LDFSAMFSPP	VNSGKTRPTT	LGSSQFSGSG
IDERGGTTSW	GTSGQPSPSY	DSSRGFTDSP	HYSDHLNDSR	LGAHEGLSPT
PFMNSNLMGK	TSERGSFSLY	SRDTGLPGCQ	SSLLRQDLGL	GSPAQLSSSG
KPGTAYYSFS	ATSSRRRPLH	DSAALDPLQA	KKVRKVPPGL	PSSVYAPSPN
SDDFNRESPS	YPSPKPPTSM	FASTFFMQDG	THNSSDLWSS	SNGMSQPGFG
GILGTSTSHM	SQSSSYGNLH	SHDRLSYPPH	SVSPTDINTS	LPPMSSFHRG
STSSSPYVAA	SHTPPINGSD	SILGTRGNAA	GSSQTGDALG	KALASIYSPD
HTSSSFPSNP	STPVGSPSPL	TGTSQWPRPG	GQAPSSPSYE	NSLHSLQSRM
EDRLDRLDDA	IHVLRNHAVG	PSTSLPAGHS	DIHSLLGPSH	NAPIGSLNSN
YGGSSLVASS	RSASMVGTHR	EDSVSLNGNH	SVLSSTVTTS	STDLNHKTQE
NYRGGLQSQS	GTVVTTEIKT	ENKEKDENLH	EPPSSDDMKS	DDESSQKDIK
VSSRGRTSST	NEDEDLNPEQ	KIEREKERRM	ANNARERLRV	RDINEAFKEL
GRMCQLHLKS	EKPQTKLLIL	HQAVAVILSL	EQQVRERNLN	PKAACLKRRE
EEKVSAVSAE	PPTTLPGTHP	GLSETTNPMG	HM

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, диференціація клітин, нейрогенез, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

Zhang Y., Bina M. (1992). The nucleotide sequence of the human transcription factor HTF4a cDNA. DNA Seq. 2: 397—403. PMID 1446075 DOI:10.3109/10425179209020819
Hu J.S., Olson E.N., Kingston R.E. (1992). HEB, a helix-loop-helix protein related to E2A and ITF2 that can modulate the DNA-binding ability of myogenic regulatory factors. Mol. Cell. Biol. 12: 1031—1042. PMID 1312219 DOI:10.1128/MCB.12.3.1031
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240

Примітки

↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Transcription factor 12 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11623 (англ.) . Архів оригіналу за 23 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
↑ UniProt, Q99081 (англ.) . Архів оригіналу за 23 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.