TFPT

Ідентифікатори

Символи

TFPT, FB1, INO80F, amida, TCF3 (E2A) fusion partner (in childhood Leukemia), TCF3 fusion partner

Зовнішні ІД

OMIM: 609519 MGI: 1916964 HomoloGene: 8349 GeneCards: TFPT

Пов'язані генетичні захворювання

Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • ядерна мембрана • Ino80 complex • клітинне ядро • нуклеоплазма
Біологічний процес	• apoptotic signaling pathway • GO:0097285 апоптоз • DNA recombination • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:0100026 Репарація ДНК • transcription, DNA-templated • cellular response to DNA damage stimulus • protein deubiquitination
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


29844


69714

Ensembl

ENSG00000275086 ENSG00000276504 ENSG00000274073 ENSG00000276022 ENSG00000276263
ENSG00000278161 ENSG00000105619 ENSG00000276296 ENSG00000276323 ENSG00000273833


ENSMUSG00000006335

UniProt


P0C1Z6


Q3U1J1

RefSeq (мРНК)


NM_013342 NM_001321792


NM_001290381 NM_023524

RefSeq (білок)


NP_001308721 NP_037474 NP_001308721.1


NP_001277310 NP_076013

Локус (UCSC)

Хр. 19: 54.11 – 54.12 Mb

Хр. 7: 3.62 – 3.63 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

TFPT (англ. TCF3 fusion partner) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 253 амінокислот, а молекулярна маса — 28 278^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MELEQREGTM	AAVGFEEFSA	PPGSELALPP	LFGGHILESE	LETEVEFVSG
GLGGSGLRER	DEEEEAARGR	RRRQRELNRR	KYQALGRRCR	EIEQVNERVL
NRLHQVQRIT	RRLQQERRFL	MRVLDSYGDD	YRASQFTIVL	EDEGSQGTDA
PTPGNAENEP	PEKETLSPPR	RTPAPPEPGS	PAPGEGPSGR	KRRRVPRDGR
RAGNALTPEL	APVQIKVEED	FGFEADEALD	SSWVSRGPDK	LLPYPTLASP
ASD

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як апоптоз, транскрипція, регуляція транскрипції, пошкодження ДНК, репарація ДНК, рекомбінація ДНК, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Franchini C., Fontana F., Minuzzo M., Babbio F., Privitera E. (2006). Apoptosis promoted by up-regulation of TFPT (TCF3 fusion partner) appears p53 independent, cell type restricted and cell density influenced. Apoptosis. 11: 2217—2224. PMID 17041757 DOI:10.1007/s10495-006-0195-5

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з TFPT переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:13630 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, P0C1Z6 (англ.) . Архів оригіналу за 24 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.