THOC1 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | THOC1, HPR1, P84, P84N5, THO complex 1 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 606930 MGI: 1919668 HomoloGene: 38012 GeneCards: THOC1 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • transcription export complex • nuclear matrix • intercellular bridge • THO complex • THO complex part of transcription export complex • клітинне ядро • нуклеоплазма • гіалоплазма • nuclear speck |
---|
Біологічний процес | • regulation of DNA recombination • mRNA transport • GO:0033168, GO:0036404, GO:1902360 RNA processing • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • negative regulation of DNA damage checkpoint • mRNA processing • regulation of DNA-templated transcription, elongation • viral mRNA export from host cell nucleus • transcription, DNA-templated • positive regulation of DNA-templated transcription, elongation • negative regulation of isotype switching to IgA isotypes • Сплайсинг РНК • replication fork processing • GO:0072468 сигнальна трансдукція • GO:0097285 апоптоз • RNA export from nucleus • mRNA export from nucleus • mRNA 3'-end processing |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 18: 0.21 – 0.27 Mb | Хр. 18: 9.96 – 10 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
THOC1 (англ. THO complex 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 18-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 657 амінокислот, а молекулярна маса — 75 666[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MSPTPPLFSL | | PEARTRFTKS | | TREALNNKNI | | KPLLSTFSQV | | PGSENEKKCT |
LDQAFRGILE | | EEIINHSSCE | | NVLAIISLAI | | GGVTEGICTA | | STPFVLLGDV |
LDCLPLDQCD | | TIFTFVEKNV | | ATWKSNTFYS | | AGKNYLLRMC | | NDLLRRLSKS |
QNTVFCGRIQ | | LFLARLFPLS | | EKSGLNLQSQ | | FNLENVTVFN | | TNEQESTLGQ |
KHTEDREEGM | | DVEEGEMGDE | | EAPTTCSIPI | | DYNLYRKFWS | | LQDYFRNPVQ |
CYEKISWKTF | | LKYSEEVLAV | | FKSYKLDDTQ | | ASRKKMEELK | | TGGEHVYFAK |
FLTSEKLMDL | | QLSDSNFRRH | | ILLQYLILFQ | | YLKGQVKFKS | | SNYVLTDEQS |
LWIEDTTKSV | | YQLLSENPPD | | GERFSKMVEH | | ILNTEENWNS | | WKNEGCPSFV |
KERTSDTKPT | | RIIRKRTAPE | | DFLGKGPTKK | | ILMGNEELTR | | LWNLCPDNME |
ACKSETREHM | | PTLEEFFEEA | | IEQADPENMV | | ENEYKAVNNS | | NYGWRALRLL |
ARRSPHFFQP | | TNQQFKSLPE | | YLENMVIKLA | | KELPPPSEEI | | KTGEDEDEED |
NDALLKENES | | PDVRRDKPVT | | GEQIEVFANK | | LGEQWKILAP | | YLEMKDSEIR |
QIECDSEDMK | | MRAKQLLVAW | | QDQEGVHATP | | ENLINALNKS | | GLSDLAESLT |
NDNETNS |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як апоптоз, процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, транскрипція, регуляція транскрипції, транспорт, транспорт мРНК, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК, РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.
Література
- Durfee T., Mancini M.A., Jones D., Elledge S.J., Lee W.H. (1994). The amino-terminal region of the retinoblastoma gene product binds a novel nuclear matrix protein that co-localizes to centers for RNA processing. J. Cell Biol. 127: 609—622. PMID 7525595 DOI:10.1083/jcb.127.3.609
- Gasparri F., Sola F., Locatelli G., Muzio M. (2004). The death domain protein p84N5, but not the short isoform p84N5s, is cell cycle-regulated and shuttles between the nucleus and the cytoplasm. FEBS Lett. 574: 13—19. PMID 15358532 DOI:10.1016/j.febslet.2004.07.074
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Doostzadeh-Cizeron J., Evans R., Yin S., Goodrich D.W. (1999). Apoptosis induced by the nuclear death domain protein p84N5 is inhibited by association with Rb protein. Mol. Biol. Cell. 10: 3251—3261. PMID 10512864 DOI:10.1091/mbc.10.10.3251
- Doostzadeh-Cizeron J., Yin S., Goodrich D.W. (2000). Apoptosis induced by the nuclear death domain protein p84N5 is associated with caspase-6 and NF-kappa B activation. J. Biol. Chem. 275: 25336—25341. PMID 10840029 DOI:10.1074/jbc.M000793200
- Doostzadeh-Cizeron J., Terry N.H., Goodrich D.W. (2001). The nuclear death domain protein p84N5 activates a G2/M cell cycle checkpoint prior to the onset of apoptosis. J. Biol. Chem. 276: 1127—1132. PMID 11050087 DOI:10.1074/jbc.M006944200
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:19070 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q96FV9 (англ.) . Архів оригіналу за 7 листопада 2016. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |