THOC1

THOC1
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

1WXP

Ідентифікатори
Символи THOC1, HPR1, P84, P84N5, THO complex 1
Зовнішні ІД OMIM: 606930 MGI: 1919668 HomoloGene: 38012 GeneCards: THOC1
Онтологія гена
Молекулярна функція

DNA binding
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
RNA binding

Клітинна компонента

цитоплазма
transcription export complex
nuclear matrix
intercellular bridge
THO complex
THO complex part of transcription export complex
клітинне ядро
нуклеоплазма
гіалоплазма
nuclear speck

Біологічний процес

regulation of DNA recombination
mRNA transport
GO:0033168, GO:0036404, GO:1902360 RNA processing
GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
negative regulation of DNA damage checkpoint
mRNA processing
regulation of DNA-templated transcription, elongation
viral mRNA export from host cell nucleus
transcription, DNA-templated
positive regulation of DNA-templated transcription, elongation
negative regulation of isotype switching to IgA isotypes
Сплайсинг РНК
replication fork processing
GO:0072468 сигнальна трансдукція
GO:0097285 апоптоз
RNA export from nucleus
mRNA export from nucleus
mRNA 3'-end processing

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
9984
225160
Ensembl
ENSG00000079134
ENSMUSG00000024287
UniProt
Q96FV9
Q8R3N6
RefSeq (мРНК)
NM_005131
NM_153552
RefSeq (білок)
NP_005122
NP_705780
Локус (UCSC) Хр. 18: 0.21 – 0.27 Mb Хр. 18: 9.96 – 10 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

THOC1 (англ. THO complex 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 18-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 657 амінокислот, а молекулярна маса — 75 666[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MSPTPPLFSLPEARTRFTKSTREALNNKNIKPLLSTFSQVPGSENEKKCT
LDQAFRGILEEEIINHSSCENVLAIISLAIGGVTEGICTASTPFVLLGDV
LDCLPLDQCDTIFTFVEKNVATWKSNTFYSAGKNYLLRMCNDLLRRLSKS
QNTVFCGRIQLFLARLFPLSEKSGLNLQSQFNLENVTVFNTNEQESTLGQ
KHTEDREEGMDVEEGEMGDEEAPTTCSIPIDYNLYRKFWSLQDYFRNPVQ
CYEKISWKTFLKYSEEVLAVFKSYKLDDTQASRKKMEELKTGGEHVYFAK
FLTSEKLMDLQLSDSNFRRHILLQYLILFQYLKGQVKFKSSNYVLTDEQS
LWIEDTTKSVYQLLSENPPDGERFSKMVEHILNTEENWNSWKNEGCPSFV
KERTSDTKPTRIIRKRTAPEDFLGKGPTKKILMGNEELTRLWNLCPDNME
ACKSETREHMPTLEEFFEEAIEQADPENMVENEYKAVNNSNYGWRALRLL
ARRSPHFFQPTNQQFKSLPEYLENMVIKLAKELPPPSEEIKTGEDEDEED
NDALLKENESPDVRRDKPVTGEQIEVFANKLGEQWKILAPYLEMKDSEIR
QIECDSEDMKMRAKQLLVAWQDQEGVHATPENLINALNKSGLSDLAESLT
NDNETNS

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як апоптоз, процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, транскрипція, регуляція транскрипції, транспорт, транспорт мРНК, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК, РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

  • Durfee T., Mancini M.A., Jones D., Elledge S.J., Lee W.H. (1994). The amino-terminal region of the retinoblastoma gene product binds a novel nuclear matrix protein that co-localizes to centers for RNA processing. J. Cell Biol. 127: 609—622. PMID 7525595 DOI:10.1083/jcb.127.3.609
  • Gasparri F., Sola F., Locatelli G., Muzio M. (2004). The death domain protein p84N5, but not the short isoform p84N5s, is cell cycle-regulated and shuttles between the nucleus and the cytoplasm. FEBS Lett. 574: 13—19. PMID 15358532 DOI:10.1016/j.febslet.2004.07.074
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Doostzadeh-Cizeron J., Evans R., Yin S., Goodrich D.W. (1999). Apoptosis induced by the nuclear death domain protein p84N5 is inhibited by association with Rb protein. Mol. Biol. Cell. 10: 3251—3261. PMID 10512864 DOI:10.1091/mbc.10.10.3251
  • Doostzadeh-Cizeron J., Yin S., Goodrich D.W. (2000). Apoptosis induced by the nuclear death domain protein p84N5 is associated with caspase-6 and NF-kappa B activation. J. Biol. Chem. 275: 25336—25341. PMID 10840029 DOI:10.1074/jbc.M000793200
  • Doostzadeh-Cizeron J., Terry N.H., Goodrich D.W. (2001). The nuclear death domain protein p84N5 activates a G2/M cell cycle checkpoint prior to the onset of apoptosis. J. Biol. Chem. 276: 1127—1132. PMID 11050087 DOI:10.1074/jbc.M006944200

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:19070 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
  4. UniProt, Q96FV9 (англ.) . Архів оригіналу за 7 листопада 2016. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 18
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії.
Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій.