TIMP2

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1BR9, 1GXD, 2TMP, 4ILW

Ідентифікатори

Символи

TIMP2, CSC-21K, DDC8, TIMP metallopeptidase inhibitor 2

Зовнішні ІД

OMIM: 188825 MGI: 98753 HomoloGene: 2444 GeneCards: TIMP2

Пов'язані генетичні захворювання

періодонтит, ожиріння^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• peptidase inhibitor activity • GO:0048551 enzyme inhibitor activity • зв'язування з іоном металу • integrin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protease binding • metalloendopeptidase inhibitor activity • zinc ion binding
Клітинна компонента	• growth cone • extracellular region • cell surface • neuronal cell body • neuron projection • екзосома • GO:0005578 Позаклітинна матриця • міжклітинний простір • specific granule lumen • tertiary granule lumen • ficolin-1-rich granule lumen • collagen-containing extracellular matrix
Біологічний процес	• negative regulation of proteolysis • response to cytokine • negative regulation of peptidase activity • positive regulation of adenylate cyclase activity • GO:0010260 старіння людини • extracellular matrix disassembly • negative regulation of Ras protein signal transduction • central nervous system development • positive regulation of neuron differentiation • response to hormone • negative regulation of membrane protein ectodomain proteolysis • positive regulation of MAPK cascade • negative regulation of cell population proliferation • negative regulation of mitotic cell cycle • regulation of Rap protein signal transduction • negative regulation of endopeptidase activity • neutrophil degranulation • negative regulation of metallopeptidase activity • response to organic substance
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


7077


21858

Ensembl


ENSG00000035862


ENSMUSG00000017466

UniProt


P16035


P25785

RefSeq (мРНК)


NM_003255


NM_011594

RefSeq (білок)


NP_003246


н/д

Локус (UCSC)

Хр. 17: 78.85 – 78.93 Mb

Хр. 11: 118.19 – 118.25 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

TIMP2 (англ. TIMP metallopeptidase inhibitor 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 220 амінокислот, а молекулярна маса — 24 399^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGAAARTLRL	ALGLLLLATL	LRPADACSCS	PVHPQQAFCN	ADVVIRAKAV
SEKEVDSGND	IYGNPIKRIQ	YEIKQIKMFK	GPEKDIEFIY	TAPSSAVCGV
SLDVGGKKEY	LIAGKAEGDG	KMHITLCDFI	VPWDTLSTTQ	KKSLNHRYQM
GCECKITRCP	MIPCYISSPD	ECLWMDWVTE	KNINGHQAKF	FACIKRSDGS
CAWYRGAAPP	KQEFLDIEDP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до інгібіторів протеаз, інгібіторів металоферментів. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Секретований назовні.

Література

Boone T.C., Johnson M.J., de Clerck Y.A., Langley K.E. (1990). cDNA cloning and expression of a metalloproteinase inhibitor related to tissue inhibitor of metalloproteinases. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 87: 2800—2804. PMID 2157214 DOI:10.1073/pnas.87.7.2800
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Osthues A., Knaueper V., Oberhoff R., Reinke H., Tschesche H. (1992). Isolation and characterization of tissue inhibitors of metalloproteinases (TIMP-1 and TIMP-2) from human rheumatoid synovial fluid. FEBS Lett. 296: 16—20. PMID 1730286 DOI:10.1016/0014-5793(92)80393-U
de Clerck Y.A., Darville M.I., Eeckhout Y., Rousseau G.G. (1994). Characterization of the promoter of the gene encoding human tissue inhibitor of metalloproteinases-2 (TIMP-2). Gene. 139: 185—191. PMID 8112602 DOI:10.1016/0378-1119(94)90753-6
Chattopadhyay N., Mitra A., Frei E., Chatterjee A. (2001). Human cervical tumor cell (SiHa) surface alphavbeta3 integrin receptor has associated matrix metalloproteinase (MMP-2) activity. J. Cancer Res. Clin. Oncol. 127: 653—658. PMID 11710594 DOI:10.1007/s004320100271
Morgunova E., Tuuttila A., Bergmann U., Tryggvason K. (2002). Structural insight into the complex formation of latent matrix metalloproteinase 2 with tissue inhibitor of metalloproteinase 2. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99: 7414—7419. PMID 12032297 DOI:10.1073/pnas.102185399

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з TIMP2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11821 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, P16035 (англ.) . Архів оригіналу за 23 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.