TIMP2 |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/9/95/Protein_TIMP2_PDB_1bqq.png/250px-Protein_TIMP2_PDB_1bqq.png) |
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 1BR9, 1GXD, 2TMP, 4ILW | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | TIMP2, CSC-21K, DDC8, TIMP metallopeptidase inhibitor 2 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 188825 MGI: 98753 HomoloGene: 2444 GeneCards: TIMP2 |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
періодонтит, ожиріння[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • peptidase inhibitor activity • GO:0048551 enzyme inhibitor activity • зв'язування з іоном металу • integrin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protease binding • metalloendopeptidase inhibitor activity • zinc ion binding |
---|
Клітинна компонента | • growth cone • extracellular region • cell surface • neuronal cell body • neuron projection • екзосома • GO:0005578 Позаклітинна матриця • міжклітинний простір • specific granule lumen • tertiary granule lumen • ficolin-1-rich granule lumen • collagen-containing extracellular matrix |
---|
Біологічний процес | • negative regulation of proteolysis • response to cytokine • negative regulation of peptidase activity • positive regulation of adenylate cyclase activity • GO:0010260 старіння людини • extracellular matrix disassembly • negative regulation of Ras protein signal transduction • central nervous system development • positive regulation of neuron differentiation • response to hormone • negative regulation of membrane protein ectodomain proteolysis • positive regulation of MAPK cascade • negative regulation of cell population proliferation • negative regulation of mitotic cell cycle • regulation of Rap protein signal transduction • negative regulation of endopeptidase activity • neutrophil degranulation • negative regulation of metallopeptidase activity • response to organic substance |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/2/27/PBB_GE_TIMP2_203167_at_fs.png/250px-PBB_GE_TIMP2_203167_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 17: 78.85 – 78.93 Mb | Хр. 11: 118.19 – 118.25 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
TIMP2 (англ. TIMP metallopeptidase inhibitor 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 220 амінокислот, а молекулярна маса — 24 399[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MGAAARTLRL | | ALGLLLLATL | | LRPADACSCS | | PVHPQQAFCN | | ADVVIRAKAV |
SEKEVDSGND | | IYGNPIKRIQ | | YEIKQIKMFK | | GPEKDIEFIY | | TAPSSAVCGV |
SLDVGGKKEY | | LIAGKAEGDG | | KMHITLCDFI | | VPWDTLSTTQ | | KKSLNHRYQM |
GCECKITRCP | | MIPCYISSPD | | ECLWMDWVTE | | KNINGHQAKF | | FACIKRSDGS |
CAWYRGAAPP | | KQEFLDIEDP |
Кодований геном білок за функціями належить до інгібіторів протеаз, інгібіторів металоферментів. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Секретований назовні.
Література
- Boone T.C., Johnson M.J., de Clerck Y.A., Langley K.E. (1990). cDNA cloning and expression of a metalloproteinase inhibitor related to tissue inhibitor of metalloproteinases. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 87: 2800—2804. PMID 2157214 DOI:10.1073/pnas.87.7.2800
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Osthues A., Knaueper V., Oberhoff R., Reinke H., Tschesche H. (1992). Isolation and characterization of tissue inhibitors of metalloproteinases (TIMP-1 and TIMP-2) from human rheumatoid synovial fluid. FEBS Lett. 296: 16—20. PMID 1730286 DOI:10.1016/0014-5793(92)80393-U
- de Clerck Y.A., Darville M.I., Eeckhout Y., Rousseau G.G. (1994). Characterization of the promoter of the gene encoding human tissue inhibitor of metalloproteinases-2 (TIMP-2). Gene. 139: 185—191. PMID 8112602 DOI:10.1016/0378-1119(94)90753-6
- Chattopadhyay N., Mitra A., Frei E., Chatterjee A. (2001). Human cervical tumor cell (SiHa) surface alphavbeta3 integrin receptor has associated matrix metalloproteinase (MMP-2) activity. J. Cancer Res. Clin. Oncol. 127: 653—658. PMID 11710594 DOI:10.1007/s004320100271
- Morgunova E., Tuuttila A., Bergmann U., Tryggvason K. (2002). Structural insight into the complex formation of latent matrix metalloproteinase 2 with tissue inhibitor of metalloproteinase 2. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99: 7414—7419. PMID 12032297 DOI:10.1073/pnas.102185399
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з TIMP2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11821 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
- ↑ UniProt, P16035 (англ.) . Архів оригіналу за 23 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |