TMC3

Ідентифікатори

Символи

TMC3, transmembrane channel like 3

Зовнішні ІД

OMIM: 617196 MGI: 2669033 HomoloGene: 45588 GeneCards: TMC3

Онтологія гена
Молекулярна функція	• ion channel activity • mechanosensitive ion channel activity
Клітинна компонента	• мембрана • integral component of membrane • integral component of plasma membrane
Біологічний процес	• ion transport • ion transmembrane transport • трансмембранний транспорт
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


342125


233424

Ensembl


ENSG00000188869


ENSMUSG00000038540

UniProt


Q7Z5M5


Q7TQ69

RefSeq (мРНК)


NM_001080532 NM_181841


NM_177695

RefSeq (білок)


NP_001074001


NP_808363

Локус (UCSC)

Хр. 15: 81.33 – 81.37 Mb

Хр. 7: 83.23 – 83.27 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

TMC3 (англ. Transmembrane channel like 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 100 амінокислот, а молекулярна маса — 125 685^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MKTSKASQRY	RGIRRNASQC	YLYQESLLLS	NLDDSFSADE	TGDSNDPEQI
FQNIQFQKDL	MANIRCRPWT	MGQKLRALRQ	AKNIVLKFEG	RLTRTRGYQA
AGAELWRKFA	RLACNFVVIF	IPWEMRIKKI	ESHFGSGVAS	YFIFLRWLFG
INIVLTIMTG	AFIVIPELIA	GQPFGSTARK	TIPKEQVSSA	QDLDTVWSLG
GYLQYSVLFY	GYYGRERKIG	RAGYRLPLAY	FLVGMAVFAY	SFIILLKKMA
KNSRTSLASA	SNENYTFCWR	VFCAWDYLIG	NPEAAESKTA	AIVNSIREAI
LEEQEKKKSK	NLAVTICLRI	IANILVLLSL	AGSIYLIYFV	VDRSQKLEQS
KKELTLWEKN	EVSVVVSLVT	MIAPSAFDLI	AALEMYHPRT	TLRFQLARVL
VLYLGNLYSL	IIALLDKVNS	MSIEEMATKN	NTSHWIDSTT	FFATRTAPEE
EKWSTSRPGM	GLRRNNTWAL	EETSISAYTM	PLIKANKTSL	HTQSPQDQCW
ETYVGQEMLK	LSIIDMLFTV	ASILLIDFFR	GLFVRYLSDY	WCWDLESKFP
EYGEFKIAEN	VLHLVYNQGM	IWMGAFFSPC	LPAFNVLKLI	GLMYLRSWAV
LTCNVPHQQV	FRASRSNNFY	LAMLLFMLFL	CMLPTIFAIV	RYKPSLNCGP
FSGQEKIYDI	VSETIEKDFP	VWFGSVVGHI	SSPVVILPAV	LLLFMLIYYL
QSIARSLKLS	NHQLKMQIQN	ARSEDKKKVA	QMVEARIQTQ	EESTKKLPND
SDLTSQLSSA	HSGTPQNNGN	VAHFDSGSSK	SGRIETVAQS	MPQSPRPGDR
APSSPLPGVP	KSRLEHETNR	YLHGLCASTS	DLHRNRSRTP	MTFTTHIEDV
HSEPLFRKDF	QQINPPHRGP	QASTLLAQGP	RPHAPRYYVI	NECDSYKKKH
LNVWPERHFK	IDASGDIVEL	YPRNVRQYAS	RVPRQPPSPQ	LSEEEEETPS
RDWIKRSLPP	RSLIDLRRAP	HFYIGERSES	QTRDPEHQGR	VHYKSWNEDF
EGHLERPAYV	PRKPRSRNFQ	YPQPPLKPRG	KPRFEPSLTE	SDSVSAASSS
DQQNSSADQY	LQVTHSQGRF	PRSVGQPSRR	KAKSGQELTV	DLDDLICSDV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до іонних каналів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт іонів, транспорт, альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані.

Література

Keresztes G., Mutai H., Heller S. (2003). TMC and EVER genes belong to a larger novel family, the TMC gene family encoding transmembrane proteins. BMC Genomics. 4: 24—24. PMID 12812529 DOI:10.1186/1471-2164-4-24
Kurima K., Yang Y., Sorber K., Griffith A.J. (2003). Characterization of the transmembrane channel-like (TMC) gene family: functional clues from hearing loss and epidermodysplasia verruciformis. Genomics. 82: 300—308. PMID 12906855 DOI:10.1016/S0888-7543(03)00154-X
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:22995 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
↑ UniProt, Q7Z5M5 (англ.) . Архів оригіналу за 26 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.