TNFSF15

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2O0O, 2QE3, 2RE9, 2RJK, 2RJL, 3K51, 3MI8

Ідентифікатори

Символи

TNFSF15, TL1, TL1A, VEGI, VEGI192A, Vascular endothelial growth inhibitor, TNLG1B, tumor necrosis factor superfamily member 15, TNF superfamily member 15

Зовнішні ІД

OMIM: 604052 MGI: 2180140 HomoloGene: 3755 GeneCards: TNFSF15

Пов'язані генетичні захворювання

primary biliary cholangitis, проказа, запальні захворювання кишківника, Хвороба Крона^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• tumor necrosis factor receptor binding • cytokine activity • signaling receptor binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding
Клітинна компонента	• integral component of membrane • extracellular region • клітинна мембрана • integral component of plasma membrane • мембрана • внутрішньоклітинний • міжклітинний простір
Біологічний процес	• tumor necrosis factor-mediated signaling pathway • activation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process • activation of NF-kappaB-inducing kinase activity • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • GO:0097285 апоптоз • GO:0072468 сигнальна трансдукція • regulation of signaling receptor activity
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


9966


326623

Ensembl


ENSG00000181634


ENSMUSG00000050395

UniProt


O95150


Q5UBV8

RefSeq (мРНК)


NM_005118 NM_001204344


NM_177371

RefSeq (білок)


NP_001191273 NP_005109


NP_796345

Локус (UCSC)

Хр. 9: 114.78 – 114.81 Mb

Хр. 4: 63.64 – 63.66 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

TNFSF15 (англ. TNF superfamily member 15) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 251 амінокислот, а молекулярна маса — 28 087^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAEDLGLSFG	ETASVEMLPE	HGSCRPKARS	SSARWALTCC	LVLLPFLAGL
TTYLLVSQLR	AQGEACVQFQ	ALKGQEFAPS	HQQVYAPLRA	DGDKPRAHLT
VVRQTPTQHF	KNQFPALHWE	HELGLAFTKN	RMNYTNKFLL	IPESGDYFIY
SQVTFRGMTS	ECSEIRQAGR	PNKPDSITVV	ITKVTDSYPE	PTQLLMGTKS
VCEVGSNWFQ	PIYLGAMFSL	QEGDKLMVNV	SDISLVDYTK	EDKTFFGAFL
L

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до цитокінів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані. Також секретований назовні.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Jin T., Guo F., Kim S., Howard A., Zhang Y.-Z. (2007). X-ray crystal structure of TNF ligand family member TL1A at 2.1A. Biochem. Biophys. Res. Commun. 364: 1—6. PMID 17935696 DOI:10.1016/j.bbrc.2007.09.097

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з TNFSF15 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11931 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
↑ UniProt, O95150 (англ.) . Архів оригіналу за 24 серпня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.