TOB1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2D5R, 2Z15, 5CI8, 5CI9

Ідентифікатори

Символи

TOB1, APRO6, PIG49, TOB, TROB, TROB1, transducer of ERBB2, 1, APRO5

Зовнішні ІД

OMIM: 605523 MGI: 1349721 HomoloGene: 31334 GeneCards: TOB1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• receptor tyrosine kinase binding • SMAD binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001106 transcription corepressor activity
Клітинна компонента	• CCR4-NOT complex • цитоплазма • клітинне ядро
Біологічний процес	• positive regulation of nuclear-transcribed mRNA catabolic process, deadenylation-dependent decay • negative regulation of osteoblast differentiation • negative regulation of nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening • negative regulation of nucleic acid-templated transcription • negative regulation of BMP signaling pathway • negative regulation of translation • positive regulation of nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening • BMP signaling pathway • negative regulation of cell population proliferation • positive regulation of signal transduction • regulation of SMAD protein signal transduction • регуляція експресії генів
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


10140


22057

Ensembl


ENSG00000141232


ENSMUSG00000037573

UniProt


P50616


Q61471

RefSeq (мРНК)


NM_005749 NM_001243877 NM_001243885


NM_009427

RefSeq (білок)


NP_001230806 NP_001230814 NP_005740


NP_033453

Локус (UCSC)

Хр. 17: 50.86 – 50.87 Mb

Хр. 11: 94.1 – 94.11 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

TOB1 (англ. Transducer of ERBB2, 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 345 амінокислот, а молекулярна маса — 38 155^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MQLEIQVALN	FIISYLYNKL	PRRRVNIFGE	ELERLLKKKY	EGHWYPEKPY
KGSGFRCIHI	GEKVDPVIEQ	ASKESGLDID	DVRGNLPQDL	SVWIDPFEVS
YQIGEKGPVK	VLYVDDNNEN	GCELDKEIKN	SFNPEAQVFM	PISDPASSVS
SSPSPPFGHS	AAVSPTFMPR	STQPLTFTTA	TFAATKFGST	KMKNSGRSNK
VARTSPINLG	LNVNDLLKQK	AISSSMHSLY	GLGLGSQQQP	QQQQQPAQPP
PPPPPPQQQQ	QQKTSALSPN	AKEFIFPNMQ	GQGSSTNGMF	PGDSPLNLSP
LQYSNAFDVF	AAYGGLNEKS	FVDGLNFSLN	NMQYSNQQFQ	PVMAN

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Doidge R., Mittal S., Aslam A., Winkler G.S. (2012). The anti-proliferative activity of BTG/TOB proteins is mediated via the Caf1a (CNOT7) and Caf1b (CNOT8) deadenylase subunits of the Ccr4-not complex. PLoS ONE. 7: E51331—E51331. PMID 23236473 DOI:10.1371/journal.pone.0051331

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11979 (англ.) . Архів оригіналу за 28 березня 2016. Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, P50616 (англ.) . Архів оригіналу за 24 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.