TPH1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1MLW, 3HF6, 3HF8, 3HFB, 5J6D

Ідентифікатори

Символи

TPH1, TPRH, TRPH, tryptophan hydroxylase 1

Зовнішні ІД

OMIM: 191060 MGI: 98796 HomoloGene: 121565 GeneCards: TPH1

Реагує на сполуку

fenclonine, (RS)-fenfluramine^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• iron ion binding • зв'язування з іоном металу • monooxygenase activity • tryptophan 5-monooxygenase activity • oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen, reduced pteridine as one donor, and incorporation of one atom of oxygen • oxidoreductase activity
Клітинна компонента	• цитоплазма • гіалоплазма • neuron projection
Біологічний процес	• response to immobilization stress • mammary gland alveolus development • serotonin biosynthetic process • negative regulation of ossification • aromatic amino acid family metabolic process • bone remodeling • циркадний ритм • positive regulation of fat cell differentiation • indolalkylamine biosynthetic process
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


7166


21990

Ensembl


ENSG00000129167


ENSMUSG00000040046

UniProt


P17752


P17532

RefSeq (мРНК)


NM_004179


NM_001136084 NM_001276372 NM_009414

RefSeq (білок)


NP_004170


NP_001129556 NP_001263301 NP_033440

Локус (UCSC)

Хр. 11: 18.02 – 18.05 Mb

Хр. 7: 46.29 – 46.32 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

TPH1 (англ. Tryptophan hydroxylase 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 444 амінокислот, а молекулярна маса — 50 985^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MIEDNKENKD	HSLERGRASL	IFSLKNEVGG	LIKALKIFQE	KHVNLLHIES
RKSKRRNSEF	EIFVDCDINR	EQLNDIFHLL	KSHTNVLSVN	LPDNFTLKED
GMETVPWFPK	KISDLDHCAN	RVLMYGSELD	ADHPGFKDNV	YRKRRKYFAD
LAMNYKHGDP	IPKVEFTEEE	IKTWGTVFQE	LNKLYPTHAC	REYLKNLPLL
SKYCGYREDN	IPQLEDVSNF	LKERTGFSIR	PVAGYLSPRD	FLSGLAFRVF
HCTQYVRHSS	DPFYTPEPDT	CHELLGHVPL	LAEPSFAQFS	QEIGLASLGA
SEEAVQKLAT	CYFFTVEFGL	CKQDGQLRVF	GAGLLSSISE	LKHALSGHAK
VKPFDPKITC	KQECLITTFQ	DVYFVSESFE	DAKEKMREFT	KTIKRPFGVK
YNPYTRSIQI	LKDTKSITSA	MNELQHDLDV	VSDALAKVSR	KPSI

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до оксидоредуктаз, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном заліза.

Література

Boulalard S., Darmon M.C., Ganem Y., Launay J.-M., Mallet J. (1990). Complete coding sequence of human tryptophan hydroxylase. Nucleic Acids Res. 18: 4257—4257. PMID 2377472 DOI:10.1093/nar/18.14.4257
Tipper J.P., Citron B.A., Ribeiro P., Kaufman S. (1994). Cloning and expression of rabbit and human brain tryptophan hydroxylase cDNA in Escherichia coli. Arch. Biochem. Biophys. 315: 445—453. PMID 7986090 DOI:10.1006/abbi.1994.1523
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Wang L., Erlandsen H., Haavik J., Knappskog P.M., Stevens R.C. (2002). Three-dimensional structure of human tryptophan hydroxylase and its implications for the biosynthesis of the neurotransmitters serotonin and melatonin. Biochemistry. 41: 12569—12574. PMID 12379098 DOI:10.1021/bi026561f
Wang G.A., Coon S.L., Kaufman S. (1998). Alternative splicing at the 3'-cDNA of human tryptophan hydroxylase. J. Neurochem. 71: 1769—1772. PMID 9751214

Примітки

↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Tryptophan hydroxylase 1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12008 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, P17752 (англ.) . Архів оригіналу за 23 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.