TRAF4

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2EOD, 2YUC, 3ZJB, 4K8U, 4M4E

Ідентифікатори

Символи

TRAF4, CART1, MLN62, RNF83, TNF receptor associated factor 4

Зовнішні ІД

OMIM: 602464 MGI: 1202880 HomoloGene: 3173 GeneCards: TRAF4

Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding • zinc ion binding • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • WW domain binding • thioesterase binding • tumor necrosis factor receptor binding • protein kinase binding • ubiquitin protein ligase binding • identical protein binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • мембрана • bicellular tight junction • клітинна мембрана • міжклітинні контакти • perinuclear region of cytoplasm • цитоскелет • клітинне ядро • GO:0009327 protein-containing complex • внутрішньоклітинний
Біологічний процес	• regulation of apoptotic process • activation of NF-kappaB-inducing kinase activity • positive regulation of JNK cascade • positive regulation of protein homodimerization activity • respiratory gaseous exchange by respiratory system • multicellular organism development • respiratory tube development • GO:0072468 сигнальна трансдукція • positive regulation of protein kinase activity • GO:0097285 апоптоз
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


9618


22032

Ensembl


ENSG00000076604


ENSMUSG00000017386

UniProt


Q9BUZ4


Q61382

RefSeq (мРНК)


NM_004295 NM_145751


NM_009423

RefSeq (білок)


NP_004286


NP_033449

Локус (UCSC)

Хр. 17: 28.74 – 28.75 Mb

Хр. 11: 78.05 – 78.06 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

TRAF4 (англ. TNF receptor associated factor 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 470 амінокислот, а молекулярна маса — 53 543^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MPGFDYKFLE	KPKRRLLCPL	CGKPMREPVQ	VSTCGHRFCD	TCLQEFLSEG
VFKCPEDQLP	LDYAKIYPDP	ELEVQVLGLP	IRCIHSEEGC	RWSGPLRHLQ
GHLNTCSFNV	IPCPNRCPMK	LSRRDLPAHL	QHDCPKRRLK	CEFCGCDFSG
EAYESHEGMC	PQESVYCENK	CGARMMRRLL	AQHATSECPK	RTQPCTYCTK
EFVFDTIQSH	QYQCPRLPVA	CPNQCGVGTV	AREDLPGHLK	DSCNTALVLC
PFKDSGCKHR	CPKLAMARHV	EESVKPHLAM	MCALVSRQRQ	ELQELRRELE
ELSVGSDGVL	IWKIGSYGRR	LQEAKAKPNL	ECFSPAFYTH	KYGYKLQVSA
FLNGNGSGEG	THLSLYIRVL	PGAFDNLLEW	PFARRVTFSL	LDQSDPGLAK
PQHVTETFHP	DPNWKNFQKP	GTWRGSLDES	SLGFGYPKFI	SHQDIRKRNY
VRDDAVFIRA	AVELPRKILS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як апоптоз, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі, мембрані, клітинних контактах, щільних контактах.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Fleckenstein D.S., Dirks W.G., Drexler H.G., Quentmeier H. (2003). Tumor necrosis factor receptor-associated factor (TRAF) 4 is a new binding partner for the p70S6 serine/threonine kinase. Leuk. Res. 27: 687—694. PMID 12801526 DOI:10.1016/S0145-2126(02)00325-9
Abell A.N., Johnson G.L. (2005). MEKK4 is an effector of the embryonic TRAF4 for JNK activation. J. Biol. Chem. 280: 35793—35796. PMID 16157600 DOI:10.1074/jbc.C500260200

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12034 (англ.) . Архів оригіналу за 16 березня 2016. Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9BUZ4 (англ.) . Архів оригіналу за 24 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.