TRAP1 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 4Z1F, 4Z1G, 4Z1H, 4Z1I, 5F3K, 5F5R | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | TRAP1, HSP 75, HSP75, HSP90L, TRAP-1, TNF receptor associated protein 1 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 606219 MGI: 1915265 HomoloGene: 9457 GeneCards: TRAP1 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • nucleotide binding • unfolded protein binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • tumor necrosis factor receptor binding • ATP binding • protein kinase binding • RNA binding |
---|
Клітинна компонента | • мембрана • мітохондріальний міжмембранний простір • lipid droplet • нуклеоплазма • мітохондріальний матрикс • мітохондрія • мітохондріальна внутрішня мембрана • екзосома |
---|
Біологічний процес | • response to stress • negative regulation of cellular respiration • згортання білків • negative regulation of reactive oxygen species biosynthetic process • translational attenuation • chaperone-mediated protein folding • negative regulation of intrinsic apoptotic signaling pathway in response to hydrogen peroxide |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 16: 3.65 – 3.72 Mb | Хр. 16: 3.86 – 3.9 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
TRAP1 (англ. TNF receptor associated protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 704 амінокислот, а молекулярна маса — 80 110[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MARELRALLL | | WGRRLRPLLR | | APALAAVPGG | | KPILCPRRTT | | AQLGPRRNPA |
WSLQAGRLFS | | TQTAEDKEEP | | LHSIISSTES | | VQGSTSKHEF | | QAETKKLLDI |
VARSLYSEKE | | VFIRELISNA | | SDALEKLRHK | | LVSDGQALPE | | MEIHLQTNAE |
KGTITIQDTG | | IGMTQEELVS | | NLGTIARSGS | | KAFLDALQNQ | | AEASSKIIGQ |
FGVGFYSAFM | | VADRVEVYSR | | SAAPGSLGYQ | | WLSDGSGVFE | | IAEASGVRTG |
TKIIIHLKSD | | CKEFSSEARV | | RDVVTKYSNF | | VSFPLYLNGR | | RMNTLQAIWM |
MDPKDVREWQ | | HEEFYRYVAQ | | AHDKPRYTLH | | YKTDAPLNIR | | SIFYVPDMKP |
SMFDVSRELG | | SSVALYSRKV | | LIQTKATDIL | | PKWLRFIRGV | | VDSEDIPLNL |
SRELLQESAL | | IRKLRDVLQQ | | RLIKFFIDQS | | KKDAEKYAKF | | FEDYGLFMRE |
GIVTATEQEV | | KEDIAKLLRY | | ESSALPSGQL | | TSLSEYASRM | | RAGTRNIYYL |
CAPNRHLAEH | | SPYYEAMKKK | | DTEVLFCFEQ | | FDELTLLHLR | | EFDKKKLISV |
ETDIVVDHYK | | EEKFEDRSPA | | AECLSEKETE | | ELMAWMRNVL | | GSRVTNVKVT |
LRLDTHPAMV | | TVLEMGAARH | | FLRMQQLAKT | | QEERAQLLQP | | TLEINPRHAL |
IKKLNQLRAS | | EPGLAQLLVD | | QIYENAMIAA | | GLVDDPRAMV | | GRLNELLVKA |
LERH |
Кодований геном білок за функцією належить до шаперонів. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у мембрані, мітохондрії, внутрішній мембрані мітохондрії.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Song H.Y., Dunbar J.D., Zhang Y.X., Guo D., Donner D.B. (1995). Identification of a protein with homology to hsp90 that binds the type 1 tumor necrosis factor receptor. J. Biol. Chem. 270: 3574—3581. PMID 7876093 DOI:10.1074/jbc.270.28.16630
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:16264 (англ.) . Процитовано 6 лютого 2017.
- ↑ UniProt, Q12931 (англ.) . Архів оригіналу за 10 жовтня 2016. Процитовано 6 лютого 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |