TRIM37

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
3LRQ

Ідентифікатори

Символи

TRIM37, MUL, POB1, TEF3, tripartite motif containing 37

Зовнішні ІД

OMIM: 605073 MGI: 2153072 HomoloGene: 9084 GeneCards: TRIM37

Пов'язані генетичні захворювання

mulibrey nanism^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• protein homodimerization activity • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity • zinc ion binding • chromatin binding • зв'язування з іоном металу • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • tumor necrosis factor receptor binding • ubiquitin protein ligase binding • transferase activity
Клітинна компонента	• гіалоплазма • ESC/E(Z) complex • внутрішньоклітинний • aggresome • perinuclear region of cytoplasm • пероксисома • цитоплазма
Біологічний процес	• negative regulation of centriole replication • positive regulation of DNA-binding transcription factor activity • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity • Убіквітин-залежний протеоліз • negative regulation of NF-kappaB transcription factor activity • aggresome assembly • protein autoubiquitination • histone H2A monoubiquitination • histone H2A-K119 monoubiquitination
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


4591


68729

Ensembl


ENSG00000108395


ENSMUSG00000018548

UniProt


O94972


Q6PCX9

RefSeq (мРНК)

NM_001005207 NM_015294 NM_001320987 NM_001320988 NM_001320989
NM_001320990 NM_001353082 NM_001353083 NM_001353084 NM_001353085 NM_001353086


NM_197987 NM_001363025 NM_001363026 NM_001363027 NM_001363028

RefSeq (білок)

NP_001005207 NP_001307916 NP_001307917 NP_001307918 NP_001307919
NP_056109 NP_001340011 NP_001340012 NP_001340013 NP_001340014 NP_001340015


NP_932104 NP_001349954 NP_001349955 NP_001349956 NP_001349957

Локус (UCSC)

Хр. 17: 58.98 – 59.11 Mb

Хр. 11: 87.02 – 87.11 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

TRIM37 (англ. Tripartite motif containing 37) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 964 амінокислот, а молекулярна маса — 107 906^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MDEQSVESIA	EVFRCFICME	KLRDARLCPH	CSKLCCFSCI	RRWLTEQRAQ
CPHCRAPLQL	RELVNCRWAE	EVTQQLDTLQ	LCSLTKHEEN	EKDKCENHHE
KLSVFCWTCK	KCICHQCALW	GGMHGGHTFK	PLAEIYEQHV	TKVNEEVAKL
RRRLMELISL	VQEVERNVEA	VRNAKDERVR	EIRNAVEMMI	ARLDTQLKNK
LITLMGQKTS	LTQETELLES	LLQEVEHQLR	SCSKSELISK	SSEILMMFQQ
VHRKPMASFV	TTPVPPDFTS	ELVPSYDSAT	FVLENFSTLR	QRADPVYSPP
LQVSGLCWRL	KVYPDGNGVV	RGYYLSVFLE	LSAGLPETSK	YEYRVEMVHQ
SCNDPTKNII	REFASDFEVG	ECWGYNRFFR	LDLLANEGYL	NPQNDTVILR
FQVRSPTFFQ	KSRDQHWYIT	QLEAAQTSYI	QQINNLKERL	TIELSRTQKS
RDLSPPDNHL	SPQNDDALET	RAKKSACSDM	LLEGGPTTAS	VREAKEDEED
EEKIQNEDYH	HELSDGDLDL	DLVYEDEVNQ	LDGSSSSASS	TATSNTEEND
IDEETMSGEN	DVEYNNMELE	EGELMEDAAA	AGPAGSSHGY	VGSSSRISRR
THLCSAATSS	LLDIDPLILI	HLLDLKDRSS	IENLWGLQPR	PPASLLQPTA
SYSRKDKDQR	KQQAMWRVPS	DLKMLKRLKT	QMAEVRCMKT	DVKNTLSEIK
SSSAASGDMQ	TSLFSADQAA	LAACGTENSG	RLQDLGMELL	AKSSVANCYI
RNSTNKKSNS	PKPARSSVAG	SLSLRRAVDP	GENSRSKGDC	QTLSEGSPGS
SQSGSRHSSP	RALIHGSIGD	ILPKTEDRQC	KALDSDAVVV	AVFSGLPAVE
KRRKMVTLGA	NAKGGHLEGL	QMTDLENNSE	TGELQPVLPE	GASAAPEEGM
SSDSDIECDT	ENEEQEEHTS	VGGFHDSFMV	MTQPPDEDTH	SSFPDGEQIG
PEDLSFNTDE	NSGR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, репресорів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, убіквітинування білків, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, пероксисомах.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Kallijarvi J., Avela K., Lipsanen-Nyman M., Ulmanen I., Lehesjoki A.E. (2002). The TRIM37 gene encodes a peroxisomal RING-B-box-coiled-coil protein: classification of mulibrey nanism as a new peroxisomal disorder. Am. J. Hum. Genet. 70: 1215—1228. PMID 11938494 DOI:10.1086/340256
Hamalainen R.H., Joensuu T., Kallijarvi J., Lehesjoki A.E. (2006). Characterisation of the mulibrey nanism-associated TRIM37 gene: transcription initiation, promoter region and alternative splicing. Gene. 366: 180—188. PMID 16310976 DOI:10.1016/j.gene.2005.08.008
Balestra F.R., Strnad P., Fluckiger I., Gonczy P. (2013). Discovering regulators of centriole biogenesis through siRNA-based functional genomics in human cells. Dev. Cell. 25: 555—571. PMID 23769972 DOI:10.1016/j.devcel.2013.05.016
Kumpf M., Hamalainen R.H., Hofbeck M., Baden W. (2013). Refractory congestive heart failure following delayed pericardectomy in a 12-year-old child with Mulibrey nanism due to a novel mutation in TRIM37. Eur. J. Pediatr. 172: 1415—1418. PMID 23385855 DOI:10.1007/s00431-013-1962-2
Tabah A.A., Tardif K., Mansky L.M. (2014). Anti-HIV-1 activity of Trim 37. J. Gen. Virol. 95: 960—967. PMID 24317724 DOI:10.1099/vir.0.057653-0

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з TRIM37 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7523 (англ.) . Архів оригіналу за 25 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, O94972 (англ.) . Архів оригіналу за 27 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.