TRIM69 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | TRIM69, HSD-34, HSD34, RNF36, Trif, tripartite motif containing 69 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 616017 MGI: 1918178 HomoloGene: 18827 GeneCards: TRIM69 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • transferase activity |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • nuclear speck • клітинне ядро • гіалоплазма |
---|
Біологічний процес | • Убіквітин-залежний протеоліз • GO:0097285 апоптоз • protein polyubiquitination |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | ENSG00000278211 ENSG00000185880 |
| |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_182985 NM_001301144 NM_001301145 NM_001301146 NM_080745 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_001288073 NP_001288074 NP_001288075 NP_542783 NP_892030 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 15: 44.73 – 44.77 Mb | Хр. 2: 121.99 – 122.01 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
TRIM69 (англ. Tripartite motif containing 69) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 500 амінокислот, а молекулярна маса — 57 419[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MEVSTNPSSN | | IDPGDYVEMN | | DSITHLPSKV | | VIQDITMELH | | CPLCNDWFRD |
PLMLSCGHNF | | CEACIQDFWR | | LQAKETFCPE | | CKMLCQYNNC | | TFNPVLDKLV |
EKIKKLPLLK | | GHPQCPEHGE | | NLKLFSKPDG | | KLICFQCKDA | | RLSVGQSKEF |
LQISDAVHFF | | TEELAIQQGQ | | LETTLKELQT | | LRNMQKEAIA | | AHKENKLHLQ |
QHVSMEFLKL | | HQFLHSKEKD | | ILTELREEGK | | ALNEEMELNL | | SQLQEQCLLA |
KDMLVSIQAK | | TEQQNSFDFL | | KDITTLLHSL | | EQGMKVLATR | | ELISRKLNLG |
QYKGPIQYMV | | WREMQDTLCP | | GLSPLTLDPK | | TAHPNLVLSK | | SQTSVWHGDI |
KKIMPDDPER | | FDSSVAVLGS | | RGFTSGKWYW | | EVEVAKKTKW | | TVGVVRESII |
RKGSCPLTPE | | QGFWLLRLRN | | QTDLKALDLP | | SFSLTLTNNL | | DKVGIYLDYE |
GGQLSFYNAK | | TMTHIYTFSN | | TFMEKLYPYF | | CPCLNDGGEN | | KEPLHILHPQ |
|
Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як апоптоз, убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Han Y., Li R., Gao J., Miao S., Wang L. (2012). Characterisation of human RING finger protein TRIM69, a novel testis E3 ubiquitin ligase and its subcellular localisation. Biochem. Biophys. Res. Commun. 429: 6—11. PMID 23131556 DOI:10.1016/j.bbrc.2012.10.109
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17857 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q86WT6 (англ.) . Архів оригіналу за 18 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |