TRIM69

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
4NQJ

Ідентифікатори

Символи

TRIM69, HSD-34, HSD34, RNF36, Trif, tripartite motif containing 69

Зовнішні ІД

OMIM: 616017 MGI: 1918178 HomoloGene: 18827 GeneCards: TRIM69

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • transferase activity
Клітинна компонента	• цитоплазма • nuclear speck • клітинне ядро • гіалоплазма
Біологічний процес	• Убіквітин-залежний протеоліз • GO:0097285 апоптоз • protein polyubiquitination
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


140691


70928

Ensembl


ENSG00000278211 ENSG00000185880


ENSMUSG00000033368

UniProt


Q86WT6


Q80X56

RefSeq (мРНК)


NM_182985 NM_001301144 NM_001301145 NM_001301146 NM_080745


NM_080510 NM_001379369

RefSeq (білок)


NP_001288073 NP_001288074 NP_001288075 NP_542783 NP_892030


NP_536771 NP_001366298

Локус (UCSC)

Хр. 15: 44.73 – 44.77 Mb

Хр. 2: 121.99 – 122.01 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

TRIM69 (англ. Tripartite motif containing 69) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 500 амінокислот, а молекулярна маса — 57 419^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEVSTNPSSN	IDPGDYVEMN	DSITHLPSKV	VIQDITMELH	CPLCNDWFRD
PLMLSCGHNF	CEACIQDFWR	LQAKETFCPE	CKMLCQYNNC	TFNPVLDKLV
EKIKKLPLLK	GHPQCPEHGE	NLKLFSKPDG	KLICFQCKDA	RLSVGQSKEF
LQISDAVHFF	TEELAIQQGQ	LETTLKELQT	LRNMQKEAIA	AHKENKLHLQ
QHVSMEFLKL	HQFLHSKEKD	ILTELREEGK	ALNEEMELNL	SQLQEQCLLA
KDMLVSIQAK	TEQQNSFDFL	KDITTLLHSL	EQGMKVLATR	ELISRKLNLG
QYKGPIQYMV	WREMQDTLCP	GLSPLTLDPK	TAHPNLVLSK	SQTSVWHGDI
KKIMPDDPER	FDSSVAVLGS	RGFTSGKWYW	EVEVAKKTKW	TVGVVRESII
RKGSCPLTPE	QGFWLLRLRN	QTDLKALDLP	SFSLTLTNNL	DKVGIYLDYE
GGQLSFYNAK	TMTHIYTFSN	TFMEKLYPYF	CPCLNDGGEN	KEPLHILHPQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як апоптоз, убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Han Y., Li R., Gao J., Miao S., Wang L. (2012). Characterisation of human RING finger protein TRIM69, a novel testis E3 ubiquitin ligase and its subcellular localisation. Biochem. Biophys. Res. Commun. 429: 6—11. PMID 23131556 DOI:10.1016/j.bbrc.2012.10.109

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17857 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
↑ UniProt, Q86WT6 (англ.) . Архів оригіналу за 18 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.