TRPS1
TRPS1 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | TRPS1, GC79, LGCR, transcriptional repressor GATA binding 1 | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 604386 MGI: 1927616 HomoloGene: 8556 GeneCards: TRPS1 | ||||||||||||||||
Пов'язані генетичні захворювання | |||||||||||||||||
великий депресивний розлад, unipolar depression, trichorhinophalangeal syndrome type II, trichorhinophalangeal syndrome type I[1] | |||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 8: 115.41 – 115.81 Mb | Хр. 15: 50.65 – 50.89 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | [2] | [3] | |||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
TRPS1 (англ. Transcriptional repressor GATA binding 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 281 амінокислот, а молекулярна маса — 141 521[5].
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MVRKKNPPLR | NVASEGEGQI | LEPIGTESKV | SGKNKEFSAD | QMSENTDQSD | ||||
AAELNHKEEH | SLHVQDPSSS | SKKDLKSAVL | SEKAGFNYES | PSKGGNFPSF | ||||
PHDEVTDRNM | LAFSSPAAGG | VCEPLKSPQR | AEADDPQDMA | CTPSGDSLET | ||||
KEDQKMSPKA | TEETGQAQSG | QANCQGLSPV | SVASKNPQVP | SDGGVRLNKS | ||||
KTDLLVNDNP | DPAPLSPELQ | DFKCNICGYG | YYGNDPTDLI | KHFRKYHLGL | ||||
HNRTRQDAEL | DSKILALHNM | VQFSHSKDFQ | KVNRSVFSGV | LQDINSSRPV | ||||
LLNGTYDVQV | TSGGTFIGIG | RKTPDCQGNT | KYFRCKFCNF | TYMGNSSTEL | ||||
EQHFLQTHPN | KIKASLPSSE | VAKPSEKNSN | KSIPALQSSD | SGDLGKWQDK | ||||
ITVKAGDDTP | VGYSVPIKPL | DSSRQNGTEA | TSYYWCKFCS | FSCESSSSLK | ||||
LLEHYGKQHG | AVQSGGLNPE | LNDKLSRGSV | INQNDLAKSS | EGETMTKTDK | ||||
SSSGAKKKDF | SSKGAEDNMV | TSYNCQFCDF | RYSKSHGPDV | IVVGPLLRHY | ||||
QQLHNIHKCT | IKHCPFCPRG | LCSPEKHLGE | ITYPFACRKS | NCSHCALLLL | ||||
HLSPGAAGSS | RVKHQCHQCS | FTTPDVDVLL | FHYESVHESQ | ASDVKQEANH | ||||
LQGSDGQQSV | KESKEHSCTK | CDFITQVEEE | ISRHYRRAHS | CYKCRQCSFT | ||||
AADTQSLLEH | FNTVHCQEQD | ITTANGEEDG | HAISTIKEEP | KIDFRVYNLL | ||||
TPDSKMGEPV | SESVVKREKL | EEKDGLKEKV | WTESSSDDLR | NVTWRGADIL | ||||
RGSPSYTQAS | LGLLTPVSGT | QEQTKTLRDS | PNVEAAHLAR | PIYGLAVETK | ||||
GFLQGAPAGG | EKSGALPQQY | PASGENKSKD | ESQSLLRRRR | GSGVFCANCL | ||||
TTKTSLWRKN | ANGGYVCNAC | GLYQKLHSTP | RPLNIIKQNN | GEQIIRRRTR | ||||
KRLNPEALQA | EQLNKQQRGS | NEEQVNGSPL | ERRSEDHLTE | SHQREIPLPS | ||||
LSKYEAQGSL | TKSHSAQQPV | LVSQTLDIHK | RMQPLHIQIK | SPQESTGDPG | ||||
NSSSVSEGKG | SSERGSPIEK | YMRPAKHPNY | SPPGSPIEKY | QYPLFGLPFV | ||||
HNDFQSEADW | LRFWSKYKLS | VPGNPHYLSH | VPGLPNPCQN | YVPYPTFNLP | ||||
PHFSAVGSDN | DIPLDLAIKH | SRPGPTANGA | SKEKTKAPPN | VKNEGPLNVV | ||||
KTEKVDRSTQ | DELSTKCVHC | GIVFLDEVMY | ALHMSCHGDS | GPFQCSICQH | ||||
LCTDKYDFTT | HIQRGLHRNN | AQVEKNGKPK | E |
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Kaiser F.J., Moeroey T., Chang G.T., Horsthemke B., Luedecke H.J. (2003). The RING finger protein RNF4, a co-regulator of transcription, interacts with the TRPS1 transcription factor. J. Biol. Chem. 278: 38780—38785. PMID 12885770 DOI:10.1074/jbc.M306259200
- Kaiser F.J., Ludecke H.J., Weger S. (2007). SUMOylation modulates transcriptional repression by TRPS1. Biol. Chem. 388: 381—390. PMID 17391059 DOI:10.1515/BC.2007.051
- Impens F., Radoshevich L., Cossart P., Ribet D. (2014). Mapping of SUMO sites and analysis of SUMOylation changes induced by external stimuli. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 111: 12432—12437. PMID 25114211 DOI:10.1073/pnas.1413825111
- Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage. Cell Rep. 10: 1778—1791. PMID 25772364 DOI:10.1016/j.celrep.2015.02.033
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з TRPS1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12340 (англ.) . Архів оригіналу за 25 квітня 2016. Процитовано 7 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q9UHF7 (англ.) . Архів оригіналу за 25 вересня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.
Див. також
- Хромосома 8
![]() | Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
|