TXNL4A

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1PQN, 1QGV, 1SYX, 4BWQ, 4BWS, 4CDO, 3JCR

Ідентифікатори

Символи

TXNL4A, DIB1, DIM1, HsT161, SNRNP15, TXNL4, U5-15kD, BMKS, thioredoxin like 4A

Зовнішні ІД

OMIM: 611595 MGI: 1351613 HomoloGene: 7150 GeneCards: TXNL4A

Пов'язані генетичні захворювання

choanal atresia-hearing loss-cardiac defects-craniofacial dysmorphism syndrome^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
Клітинна компонента	• U5 snRNP • spliceosomal complex • нуклеоплазма • клітинне ядро • гіалоплазма • ядерна мембрана • U4/U6 x U5 tri-snRNP complex • U2-type precatalytic spliceosome
Біологічний процес	• RNA splicing, via transesterification reactions • mRNA splicing, via spliceosome • клітинний цикл • mRNA processing • spliceosomal complex assembly • поділ клітини • Сплайсинг РНК
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


10907


27366

Ensembl


ENSG00000141759


ENSMUSG00000057130

UniProt


P83876


P83877

RefSeq (мРНК)


NM_001303471 NM_001305557 NM_001305563 NM_001305564 NM_006701


NM_001038608 NM_001042408 NM_001042409 NM_025299 NM_178604

RefSeq (білок)


NP_001290400 NP_001292486 NP_001292492 NP_001292493 NP_006692

NP_001033697 NP_001035867 NP_079575 NP_848719 NP_001371102
NP_001371103 NP_001371104 NP_001371105 NP_001371106

Локус (UCSC)

Хр. 18: 79.97 – 80.03 Mb

н/д

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

TXNL4A (англ. Thioredoxin like 4A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 18-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 142 амінокислот, а молекулярна маса — 16 786^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSYMLPHLHN	GWQVDQAILS	EEDRVVVIRF	GHDWDPTCMK	MDEVLYSIAE
KVKNFAVIYL	VDITEVPDFN	KMYELYDPCT	VMFFFRNKHI	MIDLGTGNNN
KINWAMEDKQ	EMVDIIETVY	RGARKGRGLV	VSPKDYSTKY	RY

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, клітинний цикл, поділ клітини, мітоз. Локалізований у ядрі.

Література

Reuter K., Nottrott S., Fabrizio P., Luehrmann R., Ficner R. (1999). Identification, characterization and crystal structure analysis of the human spliceosomal U5 snRNP-specific 15kD protein. J. Mol. Biol. 294: 515—525. PMID 10610776 DOI:10.1006/jmbi.1999.3258
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Liu S., Rauhut R., Vornlocher H.-P., Luehrmann R. (2006). The network of protein-protein interactions within the human U4/U6.U5 tri-snRNP. RNA. 12: 1418—1430. PMID 16723661 DOI:10.1261/rna.55406
Gilmore-Hebert M., Ramabhadran R., Stern D.F. (2010). Interactions of ErbB4 and Kap1 connect the growth factor and DNA damage response pathways. Mol. Cancer Res. 8: 1388—1398. PMID 20858735 DOI:10.1158/1541-7786.MCR-10-0042
Zhang Y.Z., Cheng H., Gould K.L., Golemis E.A., Roder H. (2003). Structure, stability, and function of hDim1 investigated by NMR, circular dichroism, and mutational analysis. Biochemistry. 42: 9609—9618. PMID 12911302 DOI:10.1021/bi034486i
Nielsen T.K., Liu S., Luhrmann R., Ficner R. (2007). Structural basis for the bifunctionality of the U5 snRNP 52K protein (CD2BP2). J. Mol. Biol. 369: 902—908. PMID 17467737 DOI:10.1016/j.jmb.2007.03.077

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з TXNL4A переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:30551 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, P83876 (англ.) . Архів оригіналу за 24 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.