UBXN6 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | UBXN6, UBXD1, UBXDC2, UBX domain protein 6 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 611946 MGI: 1913780 HomoloGene: 11538 GeneCards: UBXN6 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0001948, GO:0016582 protein binding |
---|
Клітинна компонента | • екзосома • цитоскелет • клітинне ядро • центр організації мікротрубочок • цитоплазма • extrinsic component of membrane • лізосома • lysosomal membrane • ендосома • гіалоплазма • мембрана • early endosome membrane • late endosome membrane • GO:0009327 protein-containing complex |
---|
Біологічний процес | • macroautophagy • endosome to lysosome transport via multivesicular body sorting pathway • ERAD pathway |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | | NM_024432 NM_001379361 NM_001379362 |
|
---|
RefSeq (білок) | | | NP_077752 NP_001366290 NP_001366291 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 19: 4.44 – 4.46 Mb | Хр. 17: 56.37 – 56.38 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
UBXN6 (англ. UBX domain protein 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 441 амінокислот, а молекулярна маса — 49 754[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MKKFFQEFKA | | DIKFKSAGPG | | QKLKESVGEK | | AHKEKPNQPA | | PRPPRQGPTN |
EAQMAAAAAL | | ARLEQKQSRA | | WGPTSQDTIR | | NQVRKELQAE | | ATVSGSPEAP |
GTNVVSEPRE | | EGSAHLAVPG | | VYFTCPLTGA | | TLRKDQRDAC | | IKEAILLHFS |
TDPVAASIMK | | IYTFNKDQDR | | VKLGVDTIAK | | YLDNIHLHPE | | EEKYRKIKLQ |
NKVFQERINC | | LEGTHEFFEA | | IGFQKVLLPA | | QDQEDPEEFY | | VLSETTLAQP |
QSLERHKEQL | | LAAEPVRAKL | | DRQRRVFQPS | | PLASQFELPG | | DFFNLTAEEI |
KREQRLRSEA | | VERLSVLRTK | | AMREKEEQRG | | LRKYNYTLLR | | VRLPDGCLLQ |
GTFYARERLG | | AVYGFVREAL | | QSDWLPFELL | | ASGGQKLSED | | ENLALNECGL |
VPSALLTFSW | | DMAVLEDIKA | | AGAEPDSILK | | PELLSAIEKL | | L |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі, мембрані, лізосомі, ендосомах.
Література
- Carim-Todd L., Escarceller M., Estivill X., Sumoy L. (2001). Identification and characterization of UBXD1, a novel UBX domain-containing gene on human chromosome 19p13, and its mouse ortholog. Biochim. Biophys. Acta. 1517: 298—301. PMID 11342112 DOI:10.1016/S0167-4781(00)00248-7
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Zweitzig D.R., Shcherbik N., Haines D.S. (2008). AAA ATPase p97 and adaptor UBXD1 suppress MDM2 ubiquitination and degradation and promote constitutive p53 turnover. Mol. Biol. Cell. 19: 5029—5029. PMID 18768758 DOI:10.1091/mbc.E08-01-0067
- Kern M., Fernandez-Saiz V., Schaefer Z., Buchberger A. (2009). UBXD1 binds p97 through two independent binding sites. Biochem. Biophys. Res. Commun. 380: 303—307. PMID 19174149 DOI:10.1016/j.bbrc.2009.01.076
- Stapf C., Cartwright E., Bycroft M., Hofmann K., Buchberger A. (2011). The general definition of the p97/valosin-containing protein (VCP)-interacting motif (VIM) delineates a new family of p97 cofactors. J. Biol. Chem. 286: 38670—38678. PMID 21896481 DOI:10.1074/jbc.M111.274472
- Kirchner P., Bug M., Meyer H. (2013). Ubiquitination of the N-terminal region of caveolin-1 regulates endosomal sorting by the VCP/p97 AAA-ATPase. J. Biol. Chem. 288: 7363—7372. PMID 23335559 DOI:10.1074/jbc.M112.429076
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:14928 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q9BZV1 (англ.) . Архів оригіналу за 11 березня 2018. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |