UBXN6

Ідентифікатори

Символи

UBXN6, UBXD1, UBXDC2, UBX domain protein 6

Зовнішні ІД

OMIM: 611946 MGI: 1913780 HomoloGene: 11538 GeneCards: UBXN6

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
Клітинна компонента	• екзосома • цитоскелет • клітинне ядро • центр організації мікротрубочок • цитоплазма • extrinsic component of membrane • лізосома • lysosomal membrane • ендосома • гіалоплазма • мембрана • early endosome membrane • late endosome membrane • GO:0009327 protein-containing complex
Біологічний процес	• macroautophagy • endosome to lysosome transport via multivesicular body sorting pathway • ERAD pathway
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


80700


66530

Ensembl


ENSG00000167671


ENSMUSG00000019578

UniProt


Q9BZV1


Q99PL6

RefSeq (мРНК)


NM_001171091 NM_025241


NM_024432 NM_001379361 NM_001379362

RefSeq (білок)


NP_001164562 NP_079517


NP_077752 NP_001366290 NP_001366291

Локус (UCSC)

Хр. 19: 4.44 – 4.46 Mb

Хр. 17: 56.37 – 56.38 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

UBXN6 (англ. UBX domain protein 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 441 амінокислот, а молекулярна маса — 49 754^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MKKFFQEFKA	DIKFKSAGPG	QKLKESVGEK	AHKEKPNQPA	PRPPRQGPTN
EAQMAAAAAL	ARLEQKQSRA	WGPTSQDTIR	NQVRKELQAE	ATVSGSPEAP
GTNVVSEPRE	EGSAHLAVPG	VYFTCPLTGA	TLRKDQRDAC	IKEAILLHFS
TDPVAASIMK	IYTFNKDQDR	VKLGVDTIAK	YLDNIHLHPE	EEKYRKIKLQ
NKVFQERINC	LEGTHEFFEA	IGFQKVLLPA	QDQEDPEEFY	VLSETTLAQP
QSLERHKEQL	LAAEPVRAKL	DRQRRVFQPS	PLASQFELPG	DFFNLTAEEI
KREQRLRSEA	VERLSVLRTK	AMREKEEQRG	LRKYNYTLLR	VRLPDGCLLQ
GTFYARERLG	AVYGFVREAL	QSDWLPFELL	ASGGQKLSED	ENLALNECGL
VPSALLTFSW	DMAVLEDIKA	AGAEPDSILK	PELLSAIEKL	L

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі, мембрані, лізосомі, ендосомах.

Література

Carim-Todd L., Escarceller M., Estivill X., Sumoy L. (2001). Identification and characterization of UBXD1, a novel UBX domain-containing gene on human chromosome 19p13, and its mouse ortholog. Biochim. Biophys. Acta. 1517: 298—301. PMID 11342112 DOI:10.1016/S0167-4781(00)00248-7
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Zweitzig D.R., Shcherbik N., Haines D.S. (2008). AAA ATPase p97 and adaptor UBXD1 suppress MDM2 ubiquitination and degradation and promote constitutive p53 turnover. Mol. Biol. Cell. 19: 5029—5029. PMID 18768758 DOI:10.1091/mbc.E08-01-0067
Kern M., Fernandez-Saiz V., Schaefer Z., Buchberger A. (2009). UBXD1 binds p97 through two independent binding sites. Biochem. Biophys. Res. Commun. 380: 303—307. PMID 19174149 DOI:10.1016/j.bbrc.2009.01.076
Stapf C., Cartwright E., Bycroft M., Hofmann K., Buchberger A. (2011). The general definition of the p97/valosin-containing protein (VCP)-interacting motif (VIM) delineates a new family of p97 cofactors. J. Biol. Chem. 286: 38670—38678. PMID 21896481 DOI:10.1074/jbc.M111.274472
Kirchner P., Bug M., Meyer H. (2013). Ubiquitination of the N-terminal region of caveolin-1 regulates endosomal sorting by the VCP/p97 AAA-ATPase. J. Biol. Chem. 288: 7363—7372. PMID 23335559 DOI:10.1074/jbc.M112.429076

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:14928 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9BZV1 (англ.) . Архів оригіналу за 11 березня 2018. Процитовано 12 вересня 2017.