UPK1A : Література, Примітки, Див. також Вікіпедія

UPK1A

Ідентифікатори

Символи

UPK1A, TSPAN21, UP1A, UPIA, UPKA, uroplakin 1A

Зовнішні ІД

OMIM: 611557 MGI: 98911 HomoloGene: 21383 GeneCards: UPK1A

Онтологія гена
Молекулярна функція	• protein homodimerization activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding
Клітинна компонента	• integral component of membrane • клітинна мембрана • integral component of plasma membrane • екзосома • apical plasma membrane • ендоплазматичний ретикулум • мембрана • cell surface • apical plasma membrane urothelial plaque
Біологічний процес	• cell surface receptor signaling pathway • epithelial cell differentiation • protein complex oligomerization
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


11045


109637

Ensembl


ENSG00000105668


ENSMUSG00000006313

UniProt


O00322


Q9D132

RefSeq (мРНК)


NM_007000 NM_001281443


NM_026815

RefSeq (білок)


NP_001268372 NP_008931


NP_081091

Локус (UCSC)

Хр. 19: 35.67 – 35.68 Mb

Хр. 7: 30.3 – 30.31 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

UPK1A (англ. Uroplakin 1A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 258 амінокислот, а молекулярна маса — 28 879^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MASAAAAEAE	KGSPVVVGLL	VVGNIIILLS	GLSLFAETIW	VTADQYRVYP
LMGVSGKDDV	FAGAWIAIFC	GFSFFMVASF	GVGAALCRRR	SMVLTYLVLM
LIVYIFECAS	CITSYTHRDY	MVSNPSLITK	QMLTFYSADT	DQGQELTRLW
DRVMIEQECC	GTSGPMDWVN	FTSAFRAATP	EVVFPWPPLC	CRRTGNFIPL
NEEGCRLGHM	DYLFTKGCFE	HIGHAIDSYT	WGISWFGFAI	LMWTLPVMLI
AMYFYTML

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12577 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, O00322 (англ.) . Архів оригіналу за 26 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.