USF2

Ідентифікатори

Символи

USF2, FIP, bHLHb12, upstream transcription factor 2, c-fos interacting

Зовнішні ІД

OMIM: 600390 MGI: 99961 HomoloGene: 2527 GeneCards: USF2

Онтологія гена
Молекулярна функція	• sequence-specific DNA binding • DNA binding • protein dimerization activity • protein homodimerization activity • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • bHLH transcription factor binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein heterodimerization activity • transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента	• внутрішньоклітинна мембранна органела • клітинне ядро • нуклеоплазма
Біологічний процес	• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter by glucose • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • late viral transcription • transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • regulation of transcription from RNA polymerase II promoter by glucose • lipid homeostasis • лактація • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


7392


22282

Ensembl


ENSG00000105698


ENSMUSG00000058239

UniProt


Q15853


Q64705

RefSeq (мРНК)


NM_003367 NM_207291 NM_001321150


NM_011680

RefSeq (білок)


NP_001308079 NP_003358 NP_997174


NP_035810

Локус (UCSC)

Хр. 19: 35.27 – 35.28 Mb

Хр. 7: 30.64 – 30.66 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

USF2 (англ. Upstream transcription factor 2, c-fos interacting) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 346 амінокислот, а молекулярна маса — 36 955^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MDMLDPGLDP	AASATAAAAA	SHDKGPEAEE	GVELQEGGDG	PGAEEQTAVA
ITSVQQAAFG	DHNIQYQFRT	ETNGGQVTYR	VVQVTDGQLD	GQGDTAGAVS
VVSTAAFAGG	QQAVTQVGVD	GAAQRPGPAA	ASVPPGPAAP	FPLAVIQNPF
SNGGSPAAEA	VSGEARFAYF	PASSVGDTTA	VSVQTTDQSL	QAGGQFYVMM
TPQDVLQTGT	QRTIAPRTHP	YSPKIDGTRT	PRDERRRAQH	NEVERRRRDK
INNWIVQLSK	IIPDCNADNS	KTGASKGGIL	SKACDYIREL	RQTNQRMQET
FKEAERLQMD	NELLRQQIEE	LKNENALLRA	QLQQHNLEMV	GEGTRQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

Yan S., Sloane B.F. (2004). Isolation of a novel USF2 isoform: repressor of cathepsin B expression. Gene. 337: 199—206. PMID 15276216 DOI:10.1016/j.gene.2004.05.005
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Blanar M.A., Rutter W.J. (1992). Interaction cloning: identification of a helix-loop-helix zipper protein that interacts with c-Fos. Science. 256: 1014—1018. PMID 1589769 DOI:10.1126/science.1589769

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12594 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, Q15853 (англ.) . Архів оригіналу за 22 вересня 2016. Процитовано 12 вересня 2017.