VPS18 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | VPS18, PEP3, CORVET/HOPS core subunit, VPS18 core subunit of CORVET and HOPS complexes |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 608551 MGI: 2443626 HomoloGene: 13302 GeneCards: VPS18 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • protein-macromolecule adaptor activity • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • actin binding • syntaxin binding |
---|
Клітинна компонента | • HOPS complex • AP-3 adaptor complex • ендосома • late endosome • мембрана • late endosome membrane • autophagosome • lysosomal membrane • early endosome • мікрофіламент • CORVET complex • лізосома • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • clathrin-coated vesicle • presynapse • glutamatergic synapse |
---|
Біологічний процес | • endosome to lysosome transport • endosome organization • автофагія • protein transport • viral entry into host cell • intracellular protein transport • lysosome organization • vesicle-mediated transport • vesicle docking involved in exocytosis • regulation of SNARE complex assembly • GO:0015915 транспорт • regulation of synaptic vesicle exocytosis • vacuole organization |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/f/f0/PBB_GE_VPS18_gnf1h08666_at_fs.png/250px-PBB_GE_VPS18_gnf1h08666_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 15: 40.89 – 40.9 Mb | Хр. 2: 119.12 – 119.13 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
VPS18 (англ. VPS18, CORVET/HOPS core subunit) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 973 амінокислот, а молекулярна маса — 110 186[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MASILDEYEN | | SLSRSAVLQP | | GCPSVGIPHS | | GYVNAQLEKE | | VPIFTKQRID |
FTPSERITSL | | VVSSNQLCMS | | LGKDTLLRID | | LGKANEPNHV | | ELGRKDDAKV |
HKMFLDHTGS | | HLLIALSSTE | | VLYVNRNGQK | | VRPLARWKGQ | | LVESVGWNKA |
LGTESSTGPI | | LVGTAQGHIF | | EAELSASEGG | | LFGPAPDLYF | | RPLYVLNEEG |
GPAPVCSLEA | | ERGPDGRSFV | | IATTRQRLFQ | | FIGRAAEGAE | | AQGFSGLFAA |
YTDHPPPFRE | | FPSNLGYSEL | | AFYTPKLRSA | | PRAFAWMMGD | | GVLYGALDCG |
RPDSLLSEER | | VWEYPEGVGP | | GASPPLAIVL | | TQFHFLLLLA | | DRVEAVCTLT |
GQVVLRDHFL | | EKFGPLKHMV | | KDSSTGQLWA | | YTERAVFRYH | | VQREARDVWR |
TYLDMNRFDL | | AKEYCRERPD | | CLDTVLAREA | | DFCFRQRRYL | | ESARCYALTQ |
SYFEEIALKF | | LEARQEEALA | | EFLQRKLASL | | KPAERTQATL | | LTTWLTELYL |
SRLGALQGDP | | EALTLYRETK | | ECFRTFLSSP | | RHKEWLFASR | | ASIHELLASH |
GDTEHMVYFA | | VIMQDYERVV | | AYHCQHEAYE | | EALAVLARHR | | DPQLFYKFSP |
ILIRHIPRQL | | VDAWIEMGSR | | LDARQLIPAL | | VNYSQGGEVQ | | QVSQAIRYME |
FCVNVLGETE | | QAIHNYLLSL | | YARGRPDSLL | | AYLEQAGASP | | HRVHYDLKYA |
LRLCAEHGHH | | RACVHVYKVL | | ELYEEAVDLA | | LQVDVDLAKQ | | CADLPEEDEE |
LRKKLWLKIA | | RHVVQEEEDV | | QTAMACLASC | | PLLKIEDVLP | | FFPDFVTIDH |
FKEAICSSLK | | AYNHHIQELQ | | REMEEATASA | | QRIRRDLQEL | | RGRYGTVEPQ |
DKCATCDFPL | | LNRPFYLFLC | | GHMFHADCLL | | QAVRPGLPAY | | KQARLEELQR |
KLGAAPPPAK | | GSARAKEAEG | | GAATAGPSRE | | QLKADLDELV | | AAECVYCGEL |
MIRSIDRPFI | | DPQRYEEEQL | | SWL |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, автофагія, ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у мембрані, цитоплазматичних везикулах, лізосомі, ендосомах.
Література
- Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 143—150. PMID 10819331 DOI:10.1093/dnares/7.2.143
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Poteryaev D., Datta S., Ackema K., Zerial M., Spang A. (2010). Identification of the switch in early-to-late endosome transition. Cell. 141: 497—508. PMID 20434987 DOI:10.1016/j.cell.2010.03.011
- Solinger J.A., Spang A. (2013). Tethering complexes in the endocytic pathway: CORVET and HOPS. FEBS J. 280: 2743—2757. PMID 23351085 DOI:10.1111/febs.12151
- Wartosch L., Guenesdogan U., Graham S.C., Luzio J.P. (2015). Recruitment of VPS33A to HOPS by VPS16 Is Required for Lysosome Fusion with Endosomes and Autophagosomes. Traffic. 16: 727—742. PMID 25783203 DOI:10.1111/tra.12283
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:15972 (англ.) . Архів оригіналу за 23 липня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q9P253 (англ.) . Архів оригіналу за 17 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
Див. також
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |