VPS33B |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | VPS33B, late endosome and lysosome associated, VPS33B late endosome and lysosome associated |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 608552 MGI: 2446237 HomoloGene: 10261 GeneCards: VPS33B |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
arthrogryposis–renal dysfunction–cholestasis syndrome[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0001948, GO:0016582 protein binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • HOPS complex • platelet alpha granule • recycling endosome • AP-3 adaptor complex • ендосома • late endosome • early endosome membrane • мембрана • late endosome membrane • Клатрин • lysosomal membrane • early endosome • perinuclear region of cytoplasm • лізосома • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • clathrin-coated vesicle |
---|
Біологічний процес | • megakaryocyte development • endosome to lysosome transport • platelet alpha granule organization • membrane fusion • melanosome localization • endosome organization • vesicle docking involved in exocytosis • GO:0000046 autophagosome maturation • lysosome localization • GO:0015915 транспорт • protein transport • vesicle-mediated transport • regulation of platelet aggregation |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001289148 NM_001289149 NM_018668 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_001276077 NP_001276078 NP_061138 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 15: 91 – 91.02 Mb | Хр. 7: 79.92 – 79.94 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
VPS33B (англ. VPS33B, late endosome and lysosome associated) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 617 амінокислот, а молекулярна маса — 70 585[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MAFPHRPDAP | | ELPDFSMLKR | | LARDQLIYLL | | EQLPGKKDLF | | IEADLMSPLD |
RIANVSILKQ | | HEVDKLYKVE | | NKPALSSNEQ | | LCFLVRPRIK | | NMRYIASLVN |
ADKLAGRTRK | | YKVIFSPQKF | | YACEMVLEEE | | GIYGDVSCDE | | WAFSLLPLDV |
DLLSMELPEF | | FRDYFLEGDQ | | RWINTVAQAL | | HLLSTLYGPF | | PNCYGIGRCA |
KMAYELWRNL | | EEEEDGETKG | | RRPEIGHIFL | | LDRDVDFVTA | | LCSQVVYEGL |
VDDTFRIKCG | | SVDFGPEVTS | | SDKSLKVLLN | | AEDKVFNEIR | | NEHFSNVFGF |
LSQKARNLQA | | QYDRRRGMDI | | KQMKNFVSQE | | LKGLKQEHRL | | LSLHIGACES |
IMKKKTKQDF | | QELIKTEHAL | | LEGFNIREST | | SYIEEHIDRQ | | VSPIESLRLM |
CLLSITENGL | | IPKDYRSLKT | | QYLQSYGPEH | | LLTFSNLRRA | | GLLTEQAPGD |
TLTAVESKVS | | KLVTDKAAGK | | ITDAFSSLAK | | RSNFRAISKK | | LNLIPRVDGE |
YDLKVPRDMA | | YVFGGAYVPL | | SCRIIEQVLE | | RRSWQGLDEV | | VRLLNCSDFA |
FTDMTKEDKA | | SSESLRLILV | | VFLGGCTFSE | | ISALRFLGRE | | KGYRFIFLTT |
AVTNSARLME | | AMSEVKA |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані, цитоплазматичних везикулах, лізосомі, ендосомах.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Bach H., Papavinasasundaram K.G., Wong D., Hmama Z., Av-Gay Y. (2008). Mycobacterium tuberculosis virulence is mediated by PtpA dephosphorylation of human vacuolar protein sorting 33B. Cell Host Microbe. 3: 316—322. PMID 18474358 DOI:10.1016/j.chom.2008.03.008
- Zlatic S.A., Tornieri K., L'Hernault S.W., Faundez V. (2011). Clathrin-dependent mechanisms modulate the subcellular distribution of class C Vps/HOPS tether subunits in polarized and nonpolarized cells. Mol. Biol. Cell. 22: 1699—1715. PMID 21411634 DOI:10.1091/mbc.E10-10-0799
- Carim-Todd L., Sumoy L., Andreu N., Estivill X., Escarceller M. (2000). Cloning, mapping and expression analysis of VPS33B, the human orthologue of rat Vps33b. Cytogenet. Cell Genet. 89: 92—95. PMID 10894945
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з VPS33B переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12712 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 11 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q9H267 (англ.) . Архів оригіналу за 14 липня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |