VPS35 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | VPS35, MEM3, PARK17, VPS35 retromer complex component, retromer complex component |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 601501 MGI: 1890467 HomoloGene: 6221 GeneCards: VPS35 |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
Parkinson disease 17, хвороба Паркінсона[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • D1 dopamine receptor binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • ендосома • мембрана • tubular endosome • retromer complex • lysosomal membrane • early endosome • екзосома • мітохондрія • лізосома • endosome membrane • GO:0097483, GO:0097481 постсинаптичне ущільнення • retromer, cargo-selective complex • mitochondrion-derived vesicle • neuron projection • neuronal cell body • perinuclear region of cytoplasm • late endosome • гіалоплазма • клітинна мембрана • presynapse • postsynapse • glutamatergic synapse |
---|
Біологічний процес | • regulation of protein stability • positive regulation of canonical Wnt signaling pathway • positive regulation of Wnt protein secretion • Цитопемпсис • negative regulation of late endosome to lysosome transport • retrograde transport, endosome to Golgi • protein transport • regulation of macroautophagy • Wnt signaling pathway • regulation of mitochondrion organization • mitochondrial fragmentation involved in apoptotic process • positive regulation of dopamine receptor signaling pathway • positive regulation of mitochondrial fission • mitochondrion to lysosome transport • neurotransmitter receptor transport, endosome to plasma membrane • regulation of dendritic spine maintenance • regulation of terminal button organization • lysosome organization • GO:1901313 positive regulation of gene expression • negative regulation of gene expression • protein destabilization • negative regulation of protein homooligomerization • protein localization to organelle • voluntary musculoskeletal movement • positive regulation of locomotion involved in locomotory behavior • positive regulation of dopamine biosynthetic process • negative regulation of protein localization • negative regulation of lysosomal protein catabolic process • GO:0015915 транспорт • GO:0051199 regulation of cellular protein metabolic process • negative regulation of inflammatory response • negative regulation of cell death • negative regulation of neuron death • regulation of presynapse assembly • intracellular protein transport • synapse assembly • GO:0022415 viral process • neurotransmitter receptor transport, endosome to postsynaptic membrane • vesicle-mediated transport in synapse • protein localization to endosome |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/f/f5/PBB_GE_VPS35_217727_x_at_fs.png/250px-PBB_GE_VPS35_217727_x_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 16: 46.66 – 46.69 Mb | Хр. 8: 85.99 – 86.03 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
VPS35 (англ. VPS35, retromer complex component) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 796 амінокислот, а молекулярна маса — 91 707[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MPTTQQSPQD | | EQEKLLDEAI | | QAVKVQSFQM | | KRCLDKNKLM | | DALKHASNML |
GELRTSMLSP | | KSYYELYMAI | | SDELHYLEVY | | LTDEFAKGRK | | VADLYELVQY |
AGNIIPRLYL | | LITVGVVYVK | | SFPQSRKDIL | | KDLVEMCRGV | | QHPLRGLFLR |
NYLLQCTRNI | | LPDEGEPTDE | | ETTGDISDSM | | DFVLLNFAEM | | NKLWVRMQHQ |
GHSRDREKRE | | RERQELRILV | | GTNLVRLSQL | | EGVNVERYKQ | | IVLTGILEQV |
VNCRDALAQE | | YLMECIIQVF | | PDEFHLQTLN | | PFLRACAELH | | QNVNVKNIII |
ALIDRLALFA | | HREDGPGIPA | | DIKLFDIFSQ | | QVATVIQSRQ | | DMPSEDVVSL |
QVSLINLAMK | | CYPDRVDYVD | | KVLETTVEIF | | NKLNLEHIAT | | SSAVSKELTR |
LLKIPVDTYN | | NILTVLKLKH | | FHPLFEYFDY | | ESRKSMSCYV | | LSNVLDYNTE |
IVSQDQVDSI | | MNLVSTLIQD | | QPDQPVEDPD | | PEDFADEQSL | | VGRFIHLLRS |
EDPDQQYLIL | | NTARKHFGAG | | GNQRIRFTLP | | PLVFAAYQLA | | FRYKENSKVD |
DKWEKKCQKI | | FSFAHQTISA | | LIKAELAELP | | LRLFLQGALA | | AGEIGFENHE |
TVAYEFMSQA | | FSLYEDEISD | | SKAQLAAITL | | IIGTFERMKC | | FSEENHEPLR |
TQCALAASKL | | LKKPDQGRAV | | STCAHLFWSG | | RNTDKNGEEL | | HGGKRVMECL |
KKALKIANQC | | MDPSLQVQLF | | IEILNRYIYF | | YEKENDAVTI | | QVLNQLIQKI |
REDLPNLESS | | EETEQINKHF | | HNTLEHLRLR | | RESPESEGPI | | YEGLIL |
Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт, транспорт білків. Локалізований у цитоплазмі, мембрані, ендосомах.
Література
- Edgar A.J., Polak J.M. (2000). Human homologues of yeast vacuolar protein sorting 29 and 35. Biochem. Biophys. Res. Commun. 277: 622—630. PMID 11062004 DOI:10.1006/bbrc.2000.3727
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Arighi C.N., Hartnell L.M., Aguilar R.C., Haft C.R., Bonifacino J.S. (2004). Role of the mammalian retromer in sorting of the cation-independent mannose 6-phosphate receptor. J. Cell Biol. 165: 123—133. PMID 15078903 DOI:10.1083/jcb.200312055
- Gokool S., Tattersall D., Seaman M.N. (2007). EHD1 interacts with retromer to stabilize SNX1 tubules and facilitate endosome-to-Golgi retrieval. Traffic. 8: 1873—1886. PMID 17868075 DOI:10.1111/j.1600-0854.2007.00652.x
- Seaman M.N., Harbour M.E., Tattersall D., Read E., Bright N. (2009). Membrane recruitment of the cargo-selective retromer subcomplex is catalysed by the small GTPase Rab7 and inhibited by the Rab-GAP TBC1D5. J. Cell Sci. 122: 2371—2382. PMID 19531583 DOI:10.1242/jcs.048686
- Tabuchi M., Yanatori I., Kawai Y., Kishi F. (2010). Retromer-mediated direct sorting is required for proper endosomal recycling of the mammalian iron transporter DMT1. J. Cell Sci. 123: 756—766. PMID 20164305 DOI:10.1242/jcs.060574
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з VPS35 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:13487 (англ.) . Архів оригіналу за 12 вересня 2015. Процитовано 28 лютого 2017.
- ↑ UniProt, Q96QK1 (англ.) . Архів оригіналу за 31 грудня 2016. Процитовано 28 лютого 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |