| VPS35 |
|---|
|
| Наявні структури |
|---|
| PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB |
|---|
| |
| Ідентифікатори |
|---|
| Символи | VPS35, MEM3, PARK17, VPS35 retromer complex component, retromer complex component |
|---|
| Зовнішні ІД | OMIM: 601501 MGI: 1890467 HomoloGene: 6221 GeneCards: VPS35 |
|---|
| |
| Пов'язані генетичні захворювання |
|---|
| Parkinson disease 17, хвороба Паркінсона[1] |
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція | • GO:0001948, GO:0016582 protein binding
• D1 dopamine receptor binding
|
|---|
| Клітинна компонента | • цитоплазма
• ендосома
• мембрана
• tubular endosome
• retromer complex
• lysosomal membrane
• early endosome
• екзосома
• мітохондрія
• лізосома
• endosome membrane
• GO:0097483, GO:0097481 постсинаптичне ущільнення
• retromer, cargo-selective complex
• mitochondrion-derived vesicle
• neuron projection
• neuronal cell body
• perinuclear region of cytoplasm
• late endosome
• гіалоплазма
• клітинна мембрана
• presynapse
• postsynapse
• glutamatergic synapse
|
|---|
| Біологічний процес | • regulation of protein stability
• positive regulation of canonical Wnt signaling pathway
• positive regulation of Wnt protein secretion
• Цитопемпсис
• negative regulation of late endosome to lysosome transport
• retrograde transport, endosome to Golgi
• protein transport
• regulation of macroautophagy
• Wnt signaling pathway
• regulation of mitochondrion organization
• mitochondrial fragmentation involved in apoptotic process
• positive regulation of dopamine receptor signaling pathway
• positive regulation of mitochondrial fission
• mitochondrion to lysosome transport
• neurotransmitter receptor transport, endosome to plasma membrane
• regulation of dendritic spine maintenance
• regulation of terminal button organization
• lysosome organization
• GO:1901313 positive regulation of gene expression
• negative regulation of gene expression
• protein destabilization
• negative regulation of protein homooligomerization
• protein localization to organelle
• voluntary musculoskeletal movement
• positive regulation of locomotion involved in locomotory behavior
• positive regulation of dopamine biosynthetic process
• negative regulation of protein localization
• negative regulation of lysosomal protein catabolic process
• GO:0015915 транспорт
• GO:0051199 regulation of cellular protein metabolic process
• negative regulation of inflammatory response
• negative regulation of cell death
• negative regulation of neuron death
• regulation of presynapse assembly
• intracellular protein transport
• synapse assembly
• GO:0022415 viral process
• neurotransmitter receptor transport, endosome to postsynaptic membrane
• vesicle-mediated transport in synapse
• protein localization to endosome
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Шаблон експресії |
|---|
 |
| Більше даних |
| Ортологи |
|---|
| Види | Людина | Миша |
|---|
| Entrez | | |
|---|
| Ensembl | | |
|---|
| UniProt | | |
|---|
| RefSeq (мРНК) | | |
|---|
| RefSeq (білок) | | |
|---|
| Локус (UCSC) | Хр. 16: 46.66 – 46.69 Mb | Хр. 8: 85.99 – 86.03 Mb |
|---|
| PubMed search | [2] | [3] |
|---|
| Вікідані |
| Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
VPS35 (англ. VPS35, retromer complex component) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 796 амінокислот, а молекулярна маса — 91 707[5].
Послідовність амінокислот
| 10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
|---|
| MPTTQQSPQD | | EQEKLLDEAI | | QAVKVQSFQM | | KRCLDKNKLM | | DALKHASNML |
| GELRTSMLSP | | KSYYELYMAI | | SDELHYLEVY | | LTDEFAKGRK | | VADLYELVQY |
| AGNIIPRLYL | | LITVGVVYVK | | SFPQSRKDIL | | KDLVEMCRGV | | QHPLRGLFLR |
| NYLLQCTRNI | | LPDEGEPTDE | | ETTGDISDSM | | DFVLLNFAEM | | NKLWVRMQHQ |
| GHSRDREKRE | | RERQELRILV | | GTNLVRLSQL | | EGVNVERYKQ | | IVLTGILEQV |
| VNCRDALAQE | | YLMECIIQVF | | PDEFHLQTLN | | PFLRACAELH | | QNVNVKNIII |
| ALIDRLALFA | | HREDGPGIPA | | DIKLFDIFSQ | | QVATVIQSRQ | | DMPSEDVVSL |
| QVSLINLAMK | | CYPDRVDYVD | | KVLETTVEIF | | NKLNLEHIAT | | SSAVSKELTR |
| LLKIPVDTYN | | NILTVLKLKH | | FHPLFEYFDY | | ESRKSMSCYV | | LSNVLDYNTE |
| IVSQDQVDSI | | MNLVSTLIQD | | QPDQPVEDPD | | PEDFADEQSL | | VGRFIHLLRS |
| EDPDQQYLIL | | NTARKHFGAG | | GNQRIRFTLP | | PLVFAAYQLA | | FRYKENSKVD |
| DKWEKKCQKI | | FSFAHQTISA | | LIKAELAELP | | LRLFLQGALA | | AGEIGFENHE |
| TVAYEFMSQA | | FSLYEDEISD | | SKAQLAAITL | | IIGTFERMKC | | FSEENHEPLR |
| TQCALAASKL | | LKKPDQGRAV | | STCAHLFWSG | | RNTDKNGEEL | | HGGKRVMECL |
| KKALKIANQC | | MDPSLQVQLF | | IEILNRYIYF | | YEKENDAVTI | | QVLNQLIQKI |
| REDLPNLESS | | EETEQINKHF | | HNTLEHLRLR | | RESPESEGPI | | YEGLIL |
Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт, транспорт білків. Локалізований у цитоплазмі, мембрані, ендосомах.
Література
- Edgar A.J., Polak J.M. (2000). Human homologues of yeast vacuolar protein sorting 29 and 35. Biochem. Biophys. Res. Commun. 277: 622—630. PMID 11062004 DOI:10.1006/bbrc.2000.3727
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Arighi C.N., Hartnell L.M., Aguilar R.C., Haft C.R., Bonifacino J.S. (2004). Role of the mammalian retromer in sorting of the cation-independent mannose 6-phosphate receptor. J. Cell Biol. 165: 123—133. PMID 15078903 DOI:10.1083/jcb.200312055
- Gokool S., Tattersall D., Seaman M.N. (2007). EHD1 interacts with retromer to stabilize SNX1 tubules and facilitate endosome-to-Golgi retrieval. Traffic. 8: 1873—1886. PMID 17868075 DOI:10.1111/j.1600-0854.2007.00652.x
- Seaman M.N., Harbour M.E., Tattersall D., Read E., Bright N. (2009). Membrane recruitment of the cargo-selective retromer subcomplex is catalysed by the small GTPase Rab7 and inhibited by the Rab-GAP TBC1D5. J. Cell Sci. 122: 2371—2382. PMID 19531583 DOI:10.1242/jcs.048686
- Tabuchi M., Yanatori I., Kawai Y., Kishi F. (2010). Retromer-mediated direct sorting is required for proper endosomal recycling of the mammalian iron transporter DMT1. J. Cell Sci. 123: 756—766. PMID 20164305 DOI:10.1242/jcs.060574
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з VPS35 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:13487 (англ.) . Архів оригіналу за 12 вересня 2015. Процитовано 28 лютого 2017.
- ↑ UniProt, Q96QK1 (англ.) . Архів оригіналу за 31 грудня 2016. Процитовано 28 лютого 2017.
Див. також
 | Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
 Портал «Біологія»  Портал «Хімія»
|
| На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |
