VPS39 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | VPS39, TLP, VAM6, hVam6p, HOPS complex subunit, VPS39 subunit of HOPS complex |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 612188 MGI: 2443189 HomoloGene: 41025 GeneCards: VPS39 |
---|
|
Реагує на сполуку |
---|
Viroporin 3a[1] |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/5/5d/PBB_GE_VPS39_212156_at_fs.png/250px-PBB_GE_VPS39_212156_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | | NM_147153 NM_178851 NM_001363053 NM_001363054 |
|
---|
RefSeq (білок) | | | NP_671495 NP_849182 NP_001349982 NP_001349983 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 15: 42.16 – 42.21 Mb | Хр. 2: 120.15 – 120.18 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
VPS39 (англ. VPS39, HOPS complex subunit) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 886 амінокислот, а молекулярна маса — 101 809[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MHDAFEPVPI | | LEKLPLQIDC | | LAAWEEWLLV | | GTKQGHLLLY | | RIRKDVVPAD |
VASPESGSCN | | RFEVTLEKSN | | KNFSKKIQQI | | HVVSQFKILV | | SLLENNIYVH |
DLLTFQQITT | | VSKAKGASLF | | TCDLQHTETG | | EEVLRMCVAV | | KKKLQLYFWK |
DREFHELQGD | | FSVPDVPKSM | | AWCENSICVG | | FKRDYYLIRV | | DGKGSIKELF |
PTGKQLEPLV | | APLADGKVAV | | GQDDLTVVLN | | EEGICTQKCA | | LNWTDIPVAM |
EHQPPYIIAV | | LPRYVEIRTF | | EPRLLVQSIE | | LQRPRFITSG | | GSNIIYVASN |
HFVWRLIPVP | | MATQIQQLLQ | | DKQFELALQL | | AEMKDDSDSE | | KQQQIHHIKN |
LYAFNLFCQK | | RFDESMQVFA | | KLGTDPTHVM | | GLYPDLLPTD | | YRKQLQYPNP |
LPVLSGAELE | | KAHLALIDYL | | TQKRSQLVKK | | LNDSDHQSST | | SPLMEGTPTI |
KSKKKLLQII | | DTTLLKCYLH | | TNVALVAPLL | | RLENNHCHIE | | ESEHVLKKAH |
KYSELIILYE | | KKGLHEKALQ | | VLVDQSKKAN | | SPLKGHERTV | | QYLQHLGTEN |
LHLIFSYSVW | | VLRDFPEDGL | | KIFTEDLPEV | | ESLPRDRVLG | | FLIENFKGLA |
IPYLEHIIHV | | WEETGSRFHN | | CLIQLYCEKV | | QGLMKEYLLS | | FPAGKTPVPA |
GEEEGELGEY | | RQKLLMFLEI | | SSYYDPGRLI | | CDFPFDGLLE | | ERALLLGRMG |
KHEQALFIYV | | HILKDTRMAE | | EYCHKHYDRN | | KDGNKDVYLS | | LLRMYLSPPS |
IHCLGPIKLE | | LLEPKANLQA | | ALQVLELHHS | | KLDTTKALNL | | LPANTQINDI |
RIFLEKVLEE | | NAQKKRFNQV | | LKNLLHAEFL | | RVQEERILHQ | | QVKCIITEEK |
VCMVCKKKIG | | NSAFARYPNG | | VVVHYFCSKE | | VNPADT |
Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, автофагія, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, мембрані, лізосомі, ендосомах.
Література
- Caplan S., Hartnell L.M., Aguilar R.C., Naslavsky N., Bonifacino J.S. (2001). Human Vam6p promotes lysosome clustering and fusion in vivo. J. Cell Biol. 154: 109—122. PMID 11448994 DOI:10.1083/jcb.200102142
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Solinger J.A., Spang A. (2013). Tethering complexes in the endocytic pathway: CORVET and HOPS. FEBS J. 280: 2743—2757. PMID 23351085 DOI:10.1111/febs.12151
- Pols M.S., ten Brink C., Gosavi P., Oorschot V., Klumperman J. (2013). The HOPS proteins hVps41 and hVps39 are required for homotypic and heterotypic late endosome fusion. Traffic. 14: 219—232. PMID 23167963 DOI:10.1111/tra.12027
- Wartosch L., Guenesdogan U., Graham S.C., Luzio J.P. (2015). Recruitment of VPS33A to HOPS by VPS16 Is Required for Lysosome Fusion with Endosomes and Autophagosomes. Traffic. 16: 727—742. PMID 25783203 DOI:10.1111/tra.12283
Примітки
- ↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з VPS39 subunit of HOPS complex переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:20593 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 11 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q96JC1 (англ.) . Архів оригіналу за 26 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
Див. також
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |