VPS4A

VPS4A
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

1YXR, 2JQ9, 2K3W

Ідентифікатори
Символи VPS4A, SKD1, SKD1A, SKD2, VPS4, VPS4-1, vacuolar protein sorting 4 homolog A, CIMDAG
Зовнішні ІД OMIM: 609982 MGI: 1890520 HomoloGene: 69132 GeneCards: VPS4A
Онтологія гена
Молекулярна функція

• nucleotide binding
• protein domain specific binding
• microtubule-severing ATPase activity
• protein C-terminus binding
• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
• hydrolase activity
• ATP binding
• ATPase activity
• GO:0032403 protein-containing complex binding

Клітинна компонента

• цитоплазма
• ESCRT III complex
• гіалоплазма
• ендосома
• late endosome
• центросома
• spindle pole
• vacuolar membrane
• late endosome membrane
• Flemming body
• мембрана
• клітинна мембрана
• midbody
• early endosome
• perinuclear region of cytoplasm
• лізосома
• екзосома
• клітинне ядро
• endosome membrane

Біологічний процес

• late endosomal microautophagy
• endosomal vesicle fusion
• viral release from host cell
• Листопад (фенологія)
• viral budding via host ESCRT complex
• nucleus organization
• GO:0019067 viral life cycle
• multivesicular body assembly
• vacuole organization
• vesicle uncoating
• regulation of protein localization
• поділ клітини
• intracellular cholesterol transport
• ESCRT complex disassembly
• vesicle budding from membrane
• ubiquitin-independent protein catabolic process via the multivesicular body sorting pathway
• GO:0015915 транспорт
• protein transport
• positive regulation of viral life cycle
• ubiquitin-dependent protein catabolic process via the multivesicular body sorting pathway
• клітинний цикл
• negative regulation of cytokinesis
• septum digestion after cytokinesis
• mitotic metaphase plate congression
• positive regulation of exosomal secretion
• vesicle-mediated transport
• regulation of protein localization to plasma membrane
• ESCRT III complex disassembly
• cytoplasmic microtubule organization
• endosomal transport
• macroautophagy
• positive regulation of viral budding via host ESCRT complex
• actomyosin contractile ring contraction
• protein targeting to lysosome
• nuclear envelope organization
• nuclear membrane reassembly
• mitotic cytokinesis checkpoint signaling
• cytoskeleton-dependent cytokinesis
• midbody abscission

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
27183
116733
Ensembl
ENSG00000132612
ENSMUSG00000031913
UniProt
Q9UN37
Q8VEJ9
RefSeq (мРНК)
NM_013245
NM_126165
RefSeq (білок)
NP_037377
NP_037377.1
NP_569053
Локус (UCSC) Хр. 16: 69.31 – 69.33 Mb Хр. 8: 107.76 – 107.77 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

VPS4A (англ. Vacuolar protein sorting 4 homolog A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 437 амінокислот, а молекулярна маса — 48 898[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MTTSTLQKAIDLVTKATEEDKAKNYEEALRLYQHAVEYFLHAIKYEAHSD
KAKESIRAKCVQYLDRAEKLKDYLRSKEKHGKKPVKENQSEGKGSDSDSE
GDNPEKKKLQEQLMGAVVMEKPNIRWNDVAGLEGAKEALKEAVILPIKFP
HLFTGKRTPWRGILLFGPPGTGKSYLAKAVATEANNSTFFSVSSSDLMSK
WLGESEKLVKNLFELARQHKPSIIFIDEVDSLCGSRNENESEAARRIKTE
FLVQMQGVGNNNDGTLVLGATNIPWVLDSAIRRRFEKRIYIPLPEEAARA
QMFRLHLGSTPHNLTDANIHELARKTEGYSGADISIIVRDSLMQPVRKVQ
SATHFKKVCGPSRTNPSMMIDDLLTPCSPGDPGAMEMTWMDVPGDKLLEP
VVCMSDMLRSLATTRPTVNADDLLKVKKFSEDFGQES

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, клітинний цикл, поділ клітини, ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у мембрані, ендосомах.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Bishop N., Woodman P. (2000). ATPase-defective mammalian VPS4 localizes to aberrant endosomes and impairs cholesterol trafficking. Mol. Biol. Cell. 11: 227—239. PMID 10637304 DOI:10.1091/mbc.11.1.227
  • Martin-Serrano J., Yarovoy A., Perez-Caballero D., Bieniasz P.D. (2003). Divergent retroviral late-budding domains recruit vacuolar protein sorting factors by using alternative adaptor proteins. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 100: 12414—12419. PMID 14519844 DOI:10.1073/pnas.2133846100
  • Sachse M., Strous G.J., Klumperman J. (2004). ATPase-deficient hVPS4 impairs formation of internal endosomal vesicles and stabilizes bilayered clathrin coats on endosomal vacuoles. J. Cell Sci. 117: 1699—1708. PMID 15075231 DOI:10.1242/jcs.00998
  • Kuang Z., Seo E.J., Leis J. (2011). Mechanism of inhibition of retrovirus release from cells by interferon-induced gene ISG15. J. Virol. 85: 7153—7161. PMID 21543490 DOI:10.1128/JVI.02610-10
  • Howard T.L., Stauffer D.R., Degnin C.R., Hollenberg S.M. (2001). CHMP1 functions as a member of a newly defined family of vesicle trafficking proteins. J. Cell Sci. 114: 2395—2404. PMID 11559748

Примітки

  1. ↑ Human PubMed Reference:.
  2. ↑ Mouse PubMed Reference:.
  3. ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:13488 (англ.) . Архів оригіналу за 4 липня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
  4. ↑ UniProt, Q9UN37 (англ.) . Архів оригіналу за 27 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 16
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії.
Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій.