VPS4B

VPS4B
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

1WR0, 1XWI, 2CPT, 2JQH, 2JQK, 4U7Y

Ідентифікатори
Символи VPS4B, SKD1, SKD1B, VPS4-2, MIG1, vacuolar protein sorting 4 homolog B
Зовнішні ІД OMIM: 609983 MGI: 1100499 HomoloGene: 37976 GeneCards: VPS4B
Онтологія гена
Молекулярна функція

• nucleotide binding
• protein homodimerization activity
• ATPase activity
• protein C-terminus binding
• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
• identical protein binding
• hydrolase activity
• ATP binding

Клітинна компонента

• цитоплазма
• гіалоплазма
• ендосома
• центросома
• spindle pole
• мембрана
• late endosome membrane
• Flemming body
• endosome membrane
• екзосома
• клітинне ядро

Біологічний процес

• late endosomal microautophagy
• regulation of centrosome duplication
• protein depolymerization
• viral budding via host ESCRT complex
• GO:0019067 viral life cycle
• nucleus organization
• cholesterol transport
• negative regulation of exosomal secretion
• multivesicular body assembly
• negative regulation of cell death
• regulation of mitotic spindle assembly
• endosome organization
• поділ клітини
• positive regulation of centriole elongation
• endosomal transport
• potassium ion transport
• response to lipid
• ubiquitin-independent protein catabolic process via the multivesicular body sorting pathway
• protein transport
• ubiquitin-dependent protein catabolic process via the multivesicular body sorting pathway
• positive regulation of G2/M transition of mitotic cell cycle
• positive regulation of exosomal secretion
• septum digestion after cytokinesis
• mitotic metaphase plate congression
• endosome to lysosome transport via multivesicular body sorting pathway
• клітинний цикл
• ESCRT III complex disassembly
• macroautophagy
• GO:0015915 транспорт
• positive regulation of viral process
• vacuole organization
• midbody abscission

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
9525
20479
Ensembl
ENSG00000119541
ENSMUSG00000009907
UniProt
O75351
P46467
RefSeq (мРНК)
NM_004869
NM_009190
RefSeq (білок)
NP_004860
NP_004860.2
NP_033216
Локус (UCSC) Хр. 18: 63.39 – 63.42 Mb Хр. 1: 106.69 – 106.72 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

VPS4B (англ. Vacuolar protein sorting 4 homolog B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 18-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 444 амінокислот, а молекулярна маса — 49 302[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MSSTSPNLQKAIDLASKAAQEDKAGNYEEALQLYQHAVQYFLHVVKYEAQ
GDKAKQSIRAKCTEYLDRAEKLKEYLKNKEKKAQKPVKEGQPSPADEKGN
DSDGEGESDDPEKKKLQNQLQGAIVIERPNVKWSDVAGLEGAKEALKEAV
ILPIKFPHLFTGKRTPWRGILLFGPPGTGKSYLAKAVATEANNSTFFSIS
SSDLVSKWLGESEKLVKNLFQLARENKPSIIFIDEIDSLCGSRSENESEA
ARRIKTEFLVQMQGVGVDNDGILVLGATNIPWVLDSAIRRRFEKRIYIPL
PEPHARAAMFKLHLGTTQNSLTEADFRELGRKTDGYSGADISIIVRDALM
QPVRKVQSATHFKKVRGPSRADPNHLVDDLLTPCSPGDPGAIEMTWMDVP
GDKLLEPVVSMSDMLRSLSNTKPTVNEHDLLKLKKFTEDFGQEG

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, клітинний цикл, поділ клітини, ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у мембрані, ендосомах.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Shim S., Merrill S.A., Hanson P.I. (2008). Novel interactions of ESCRT-III with LIP5 and VPS4 and their implications for ESCRT-III disassembly. Mol. Biol. Cell. 19: 2661—2672. PMID 18385515 DOI:10.1091/mbc.E07-12-1263
  • Howard T.L., Stauffer D.R., Degnin C.R., Hollenberg S.M. (2001). CHMP1 functions as a member of a newly defined family of vesicle trafficking proteins. J. Cell Sci. 114: 2395—2404. PMID 11559748

Примітки

  1. ↑ Human PubMed Reference:.
  2. ↑ Mouse PubMed Reference:.
  3. ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10895 (англ.) . Архів оригіналу за 4 липня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
  4. ↑ UniProt, O75351 (англ.) . Архів оригіналу за 2 липня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 18
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії.
Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій.