VPS4B |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/d/d1/Protein_VPS4B_PDB_1wr0.png/250px-Protein_VPS4B_PDB_1wr0.png) |
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 1WR0, 1XWI, 2CPT, 2JQH, 2JQK, 4U7Y | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | VPS4B, SKD1, SKD1B, VPS4-2, MIG1, vacuolar protein sorting 4 homolog B |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 609983 MGI: 1100499 HomoloGene: 37976 GeneCards: VPS4B |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • nucleotide binding • protein homodimerization activity • ATPase activity • protein C-terminus binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • identical protein binding • hydrolase activity • ATP binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • гіалоплазма • ендосома • центросома • spindle pole • мембрана • late endosome membrane • Flemming body • endosome membrane • екзосома • клітинне ядро |
---|
Біологічний процес | • late endosomal microautophagy • regulation of centrosome duplication • protein depolymerization • viral budding via host ESCRT complex • GO:0019067 viral life cycle • nucleus organization • cholesterol transport • negative regulation of exosomal secretion • multivesicular body assembly • negative regulation of cell death • regulation of mitotic spindle assembly • endosome organization • поділ клітини • positive regulation of centriole elongation • endosomal transport • potassium ion transport • response to lipid • ubiquitin-independent protein catabolic process via the multivesicular body sorting pathway • protein transport • ubiquitin-dependent protein catabolic process via the multivesicular body sorting pathway • positive regulation of G2/M transition of mitotic cell cycle • positive regulation of exosomal secretion • septum digestion after cytokinesis • mitotic metaphase plate congression • endosome to lysosome transport via multivesicular body sorting pathway • клітинний цикл • ESCRT III complex disassembly • macroautophagy • GO:0015915 транспорт • positive regulation of viral process • vacuole organization • midbody abscission |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/40/PBB_GE_VPS4B_218171_at_fs.png/250px-PBB_GE_VPS4B_218171_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 18: 63.39 – 63.42 Mb | Хр. 1: 106.69 – 106.72 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
VPS4B (англ. Vacuolar protein sorting 4 homolog B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 18-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 444 амінокислот, а молекулярна маса — 49 302[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MSSTSPNLQK | | AIDLASKAAQ | | EDKAGNYEEA | | LQLYQHAVQY | | FLHVVKYEAQ |
GDKAKQSIRA | | KCTEYLDRAE | | KLKEYLKNKE | | KKAQKPVKEG | | QPSPADEKGN |
DSDGEGESDD | | PEKKKLQNQL | | QGAIVIERPN | | VKWSDVAGLE | | GAKEALKEAV |
ILPIKFPHLF | | TGKRTPWRGI | | LLFGPPGTGK | | SYLAKAVATE | | ANNSTFFSIS |
SSDLVSKWLG | | ESEKLVKNLF | | QLARENKPSI | | IFIDEIDSLC | | GSRSENESEA |
ARRIKTEFLV | | QMQGVGVDND | | GILVLGATNI | | PWVLDSAIRR | | RFEKRIYIPL |
PEPHARAAMF | | KLHLGTTQNS | | LTEADFRELG | | RKTDGYSGAD | | ISIIVRDALM |
QPVRKVQSAT | | HFKKVRGPSR | | ADPNHLVDDL | | LTPCSPGDPG | | AIEMTWMDVP |
GDKLLEPVVS | | MSDMLRSLSN | | TKPTVNEHDL | | LKLKKFTEDF | | GQEG |
Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, клітинний цикл, поділ клітини, ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у мембрані, ендосомах.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Shim S., Merrill S.A., Hanson P.I. (2008). Novel interactions of ESCRT-III with LIP5 and VPS4 and their implications for ESCRT-III disassembly. Mol. Biol. Cell. 19: 2661—2672. PMID 18385515 DOI:10.1091/mbc.E07-12-1263
- Howard T.L., Stauffer D.R., Degnin C.R., Hollenberg S.M. (2001). CHMP1 functions as a member of a newly defined family of vesicle trafficking proteins. J. Cell Sci. 114: 2395—2404. PMID 11559748
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10895 (англ.) . Архів оригіналу за 4 липня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
- ↑ UniProt, O75351 (англ.) . Архів оригіналу за 2 липня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |