WIPI1

Ідентифікатори

Символи

WIPI1, ATG18, ATG18A, WIPI49, WD repeat domain, phosphoinositide interacting 1

Зовнішні ІД

OMIM: 609224 MGI: 1261864 HomoloGene: 117983 GeneCards: WIPI1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• phosphatidylinositol-3-phosphate binding • phosphatidylinositol-3,5-bisphosphate binding • androgen receptor binding • signaling receptor binding • estrogen receptor binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • lipid binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • phagophore assembly site membrane • ендосома • комплекс Ґольджі • мембрана • Golgi membrane • trans-Golgi network • autophagosome membrane • endosome membrane • цитоскелет • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • clathrin-coated vesicle • phagophore assembly site • гіалоплазма • extrinsic component of membrane
Біологічний процес	• vesicle targeting, trans-Golgi to endosome • автофагія • IRE1-mediated unfolded protein response • macroautophagy • autophagy of mitochondrion • protein lipidation • protein localization to phagophore assembly site • autophagy of nucleus • autophagosome assembly • cellular response to starvation
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


55062


52639

Ensembl


ENSG00000070540


ENSMUSG00000041895

UniProt


Q5MNZ9


Q8R3E3

RefSeq (мРНК)


NM_017983 NM_001320772


NM_145940

RefSeq (білок)


NP_001307701 NP_060453


NP_666052

Локус (UCSC)

Хр. 17: 68.42 – 68.46 Mb

Хр. 11: 109.46 – 109.5 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

WIPI1 (англ. WD repeat domain, phosphoinositide interacting 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 446 амінокислот, а молекулярна маса — 48 673^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEAEAADAPP	GGVESALSCF	SFNQDCTSLA	TGTKAGYKLF	SLSSVEQLDQ
VHGSNEIPDV	YIVERLFSSS	LVVVVSHTKP	RQMNVYHFKK	GTEICNYSYS
SNILSIRLNR	QRLLVCLEES	IYIHNIKDMK	LLKTLLDIPA	NPTGLCALSI
NHSNSYLAYP	GSLTSGEIVL	YDGNSLKTVC	TIAAHEGTLA	AITFNASGSK
LASASEKGTV	IRVFSVPDGQ	KLYEFRRGMK	RYVTISSLVF	SMDSQFLCAS
SNTETVHIFK	LEQVTNSRPE	EPSTWSGYMG	KMFMAATNYL	PTQVSDMMHQ
DRAFATARLN	FSGQRNICTL	STIQKLPRLL	VASSSGHLYM	YNLDPQDGGE
CVLIKTHSLL	GSGTTEENKE	NDLRPSLPQS	YAATVARPSA	SSASTVPGYS
EDGGALRGEV	IPEHEFATGP	VCLDDENEFP	PIILCRGNQK	GKTKQS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як автофагія, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, мембрані, цитоплазматичних везикулах, апараті гольджі, ендосомах.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Jeffries T.R., Dove S.K., Michell R.H., Parker P.J. (2004). PtdIns-specific MPR pathway association of a novel WD40 repeat protein, WIPI49. Mol. Biol. Cell. 15: 2652—2663. PMID 15020712 DOI:10.1091/mbc.E03-10-0732
Proikas-Cezanne T., Ruckerbauer S., Stierhof Y.D., Berg C., Nordheim A. (2007). Human WIPI-1 puncta-formation: a novel assay to assess mammalian autophagy. FEBS Lett. 581: 3396—3404. PMID 17618624 DOI:10.1016/j.febslet.2007.06.040
Itakura E., Mizushima N. (2010). Characterization of autophagosome formation site by a hierarchical analysis of mammalian Atg proteins. Autophagy. 6: 764—776. PMID 20639694 DOI:10.4161/auto.6.6.12709
Ho H., Kapadia R., Al-Tahan S., Ahmad S., Ganesan A.K. (2011). WIPI1 coordinates melanogenic gene transcription and melanosome formation via TORC1 inhibition. J. Biol. Chem. 286: 12509—12523. PMID 21317285 DOI:10.1074/jbc.M110.200543
Proikas-Cezanne T., Robenek H. (2011). Freeze-fracture replica immunolabelling reveals human WIPI-1 and WIPI-2 as membrane proteins of autophagosomes. J. Cell. Mol. Med. 15: 2007—2010. PMID 21564513 DOI:10.1111/j.1582-4934.2011.01339.x

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:25471 (англ.) . Архів оригіналу за 27 березня 2016. Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, Q5MNZ9 (англ.) . Архів оригіналу за 27 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.