XAB2

Ідентифікатори

Символи

XAB2, HCNP, HCRN, NTC90, SYF1, XPA binding protein 2

Зовнішні ІД

OMIM: 610850 MGI: 1914689 HomoloGene: 5738 GeneCards: XAB2

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
Клітинна компонента	• catalytic step 2 spliceosome • мембрана • нуклеоплазма • spliceosomal complex • клітинне ядро • Prp19 complex • prespliceosome • catalytic step 1 spliceosome • post-mRNA release spliceosomal complex • U2-type catalytic step 2 spliceosome
Біологічний процес	• GO:0033168, GO:0036404, GO:1902360 RNA processing • mRNA processing • transcription, DNA-templated • cellular response to DNA damage stimulus • Сплайсинг РНК • cerebral cortex development • transcription-coupled nucleotide-excision repair • blastocyst development • GO:0100026 Репарація ДНК • mRNA splicing, via spliceosome • generation of catalytic spliceosome for first transesterification step
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


56949


67439

Ensembl


ENSG00000076924


ENSMUSG00000019470

UniProt


Q9HCS7


Q9DCD2

RefSeq (мРНК)


NM_020196


NM_026156

RefSeq (білок)


NP_064581


NP_080432

Локус (UCSC)

Хр. 19: 7.62 – 7.63 Mb

Хр. 8: 3.66 – 3.67 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

XAB2 (англ. XPA binding protein 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 855 амінокислот, а молекулярна маса — 100 010^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MVVMARLSRP	ERPDLVFEEE	DLPYEEEIMR	NQFSVKCWLR	YIEFKQGAPK
PRLNQLYERA	LKLLPCSYKL	WYRYLKARRA	QVKHRCVTDP	AYEDVNNCHE
RAFVFMHKMP	RLWLDYCQFL	MDQGRVTHTR	RTFDRALRAL	PITQHSRIWP
LYLRFLRSHP	LPETAVRGYR	RFLKLSPESA	EEYIEYLKSS	DRLDEAAQRL
ATVVNDERFV	SKAGKSNYQL	WHELCDLISQ	NPDKVQSLNV	DAIIRGGLTR
FTDQLGKLWC	SLADYYIRSG	HFEKARDVYE	EAIRTVMTVR	DFTQVFDSYA
QFEESMIAAK	METASELGRE	EEDDVDLELR	LARFEQLISR	RPLLLNSVLL
RQNPHHVHEW	HKRVALHQGR	PREIINTYTE	AVQTVDPFKA	TGKPHTLWVA
FAKFYEDNGQ	LDDARVILEK	ATKVNFKQVD	DLASVWCQCG	ELELRHENYD
EALRLLRKAT	ALPARRAEYF	DGSEPVQNRV	YKSLKVWSML	ADLEESLGTF
QSTKAVYDRI	LDLRIATPQI	VINYAMFLEE	HKYFEESFKA	YERGISLFKW
PNVSDIWSTY	LTKFIARYGG	RKLERARDLF	EQALDGCPPK	YAKTLYLLYA
QLEEEWGLAR	HAMAVYERAT	RAVEPAQQYD	MFNIYIKRAA	EIYGVTHTRG
IYQKAIEVLS	DEHAREMCLR	FADMECKLGE	IDRARAIYSF	CSQICDPRTT
GAFWQTWKDF	EVRHGNEDTI	KEMLRIRRSV	QATYNTQVNF	MASQMLKVSG
SATGTVSDLA	PGQSGMDDMK	LLEQRAEQLA	AEAERDQPLR	AQSKILFVRS
DASREELAEL	AQQVNPEEIQ	LGEDEDEDEM	DLEPNEVRLE	QQSVPAAVFG
SLKED

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, транскрипція, пошкодження ДНК, репарація ДНК, ацетилювання. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Jurica M.S., Licklider L.J., Gygi S.P., Grigorieff N., Moore M.J. (2002). Purification and characterization of native spliceosomes suitable for three-dimensional structural analysis. RNA. 8: 426—439. PMID 11991638 DOI:10.1017/S1355838202021088

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:14089 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9HCS7 (англ.) . Архів оригіналу за 25 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.