XAF1 : Література, Примітки, Див. також Вікіпедія

XAF1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2LXW

Ідентифікатори

Символи

XAF1, BIRC4BP, HSXIAPAF1, XIAPAF1, XIAP associated factor 1

Зовнішні ІД

OMIM: 606717 MGI: 3772572 HomoloGene: 49488 GeneCards: XAF1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• зв'язування з іоном металу • zinc ion binding
Клітинна компонента	• гіалоплазма • цитоплазма • клітинне ядро • мітохондрія
Біологічний процес	• GO:0097285 апоптоз • type I interferon signaling pathway • response to interferon-beta
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


54739


327959

Ensembl


ENSG00000132530


ENSMUSG00000040483

UniProt


Q6GPH4


Q5NBU8

RefSeq (мРНК)

NM_017523 NM_199139 NM_001353134 NM_001353135 NM_001353136
NM_001353137 NM_001353138 NM_001353139 NM_001353140


NM_001037713 NM_001291153

RefSeq (білок)

NP_059993 NP_954590 NP_001340063 NP_001340064 NP_001340065
NP_001340066 NP_001340067 NP_001340068 NP_001340069


NP_001032802 NP_001278082

Локус (UCSC)

Хр. 17: 6.76 – 6.78 Mb

Хр. 11: 72.19 – 72.2 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

XAF1 (англ. XIAP associated factor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 301 амінокислот, а молекулярна маса — 34 626^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEGDFSVCRN	CKRHVVSANF	TLHEAYCLRF	LVLCPECEEP	VPKETMEEHC
KLEHQQVGCT	MCQQSMQKSS	LEFHKANECQ	ERPVECKFCK	LDMQLSKLEL
HESYCGSRTE	LCQGCGQFIM	HRMLAQHRDV	CRSEQAQLGK	GERISAPERE
IYCHYCNQMI	PENKYFHHMG	KCCPDSEFKK	HFPVGNPEIL	PSSLPSQAAE
NQTSTMEKDV	RPKTRSINRF	PLHSESSSKK	APRSKNKTLD	PLLMSEPKPR
TSSPRGDKAA	YDILRRCSQC	GILLPLPILN	QHQEKCRWLA	SSKGKQVRNF
S

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як апоптоз, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, мітохондрії.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Yin W., Cheepala S., Clifford J.L. (2006). Identification of a novel splice variant of X-linked inhibitor of apoptosis-associated factor 1. Biochem. Biophys. Res. Commun. 339: 1148—1154. PMID 16343440 DOI:10.1016/j.bbrc.2005.11.128
Xia Y., Novak R., Lewis J., Duckett C.S., Phillips A.C. (2006). Xaf1 can cooperate with TNFalpha in the induction of apoptosis, independently of interaction with XIAP. Mol. Cell. Biochem. 286: 67—76. PMID 16432762 DOI:10.1007/s11010-005-9094-2

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:30932 (англ.) . Архів оригіналу за 13 червня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, Q6GPH4 (англ.) . Архів оригіналу за 1 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.