XAF1 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | XAF1, BIRC4BP, HSXIAPAF1, XIAPAF1, XIAP associated factor 1 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 606717 MGI: 3772572 HomoloGene: 49488 GeneCards: XAF1 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • зв'язування з іоном металу • zinc ion binding |
---|
Клітинна компонента | • гіалоплазма • цитоплазма • клітинне ядро • мітохондрія |
---|
Біологічний процес | • GO:0097285 апоптоз • type I interferon signaling pathway • response to interferon-beta |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/4b/PBB_GE_XAF1_206133_at_fs.png/250px-PBB_GE_XAF1_206133_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | NM_017523 NM_199139 NM_001353134 NM_001353135 NM_001353136
| NM_001353137 NM_001353138 NM_001353139 NM_001353140 |
| |
---|
RefSeq (білок) | NP_059993 NP_954590 NP_001340063 NP_001340064 NP_001340065
| NP_001340066 NP_001340067 NP_001340068 NP_001340069 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 17: 6.76 – 6.78 Mb | Хр. 11: 72.19 – 72.2 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
XAF1 (англ. XIAP associated factor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 301 амінокислот, а молекулярна маса — 34 626[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MEGDFSVCRN | | CKRHVVSANF | | TLHEAYCLRF | | LVLCPECEEP | | VPKETMEEHC |
KLEHQQVGCT | | MCQQSMQKSS | | LEFHKANECQ | | ERPVECKFCK | | LDMQLSKLEL |
HESYCGSRTE | | LCQGCGQFIM | | HRMLAQHRDV | | CRSEQAQLGK | | GERISAPERE |
IYCHYCNQMI | | PENKYFHHMG | | KCCPDSEFKK | | HFPVGNPEIL | | PSSLPSQAAE |
NQTSTMEKDV | | RPKTRSINRF | | PLHSESSSKK | | APRSKNKTLD | | PLLMSEPKPR |
TSSPRGDKAA | | YDILRRCSQC | | GILLPLPILN | | QHQEKCRWLA | | SSKGKQVRNF |
S |
Задіяний у таких біологічних процесах, як апоптоз, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, мітохондрії.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Yin W., Cheepala S., Clifford J.L. (2006). Identification of a novel splice variant of X-linked inhibitor of apoptosis-associated factor 1. Biochem. Biophys. Res. Commun. 339: 1148—1154. PMID 16343440 DOI:10.1016/j.bbrc.2005.11.128
- Xia Y., Novak R., Lewis J., Duckett C.S., Phillips A.C. (2006). Xaf1 can cooperate with TNFalpha in the induction of apoptosis, independently of interaction with XIAP. Mol. Cell. Biochem. 286: 67—76. PMID 16432762 DOI:10.1007/s11010-005-9094-2
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:30932 (англ.) . Архів оригіналу за 13 червня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q6GPH4 (англ.) . Архів оригіналу за 1 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |