ZBTB33

ZBTB33
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

2LT7, 3FKC, 3M4T, 3M8V, 4F6M, 4F6N

Ідентифікатори
Символи ZBTB33, ZNF-kaiso, ZNF348, zinc finger and BTB domain containing 33
Зовнішні ІД OMIM: 300329 MGI: 1927290 HomoloGene: 4931 GeneCards: ZBTB33
Онтологія гена
Молекулярна функція

methyl-CpG binding
sequence-specific DNA binding
DNA binding
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
зв'язування з іоном металу
nucleic acid binding
GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific

Клітинна компонента

клітинна мембрана
ядерце
клітинне ядро
нуклеоплазма
цитоплазма
гіалоплазма

Біологічний процес

GO:0007243 intracellular signal transduction
GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated
GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
Wnt signaling pathway
transcription, DNA-templated
GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
10009
56805
Ensembl
ENSG00000177485
ENSMUSG00000048047
UniProt
Q86T24
Q8BN78
RefSeq (мРНК)
NM_006777
NM_001184742
NM_001079513
NM_020256
RefSeq (білок)
NP_001171671
NP_006768
NP_001072981
NP_064652
Локус (UCSC) Хр. X: 120.25 – 120.26 Mb Хр. X: 37.28 – 37.29 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

ZBTB33 (англ. Zinc finger and BTB domain containing 33) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на X-хромосомі.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 672 амінокислот, а молекулярна маса — 74 484[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MESRKLISATDIQYSGSLLNSLNEQRGHGLFCDVTVIVEDRKFRAHKNIL
SASSTYFHQLFSVAGQVVELSFIRAEIFAEILNYIYSSKIVRVRSDLLDE
LIKSGQLLGVKFIAELGVPLSQVKSISGTAQDGNTEPLPPDSGDKNLVIQ
KSKDEAQDNGATIMPIITESFSLSAEDYEMKKIIVTDSDDDDDDVIFCSE
ILPTKETLPSNNTVAQVQSNPGPVAISDVAPSASNNSPPLTNITPTQKLP
TPVNQATLSQTQGSEKLLVSSAPTHLTPNIILLNQTPLSTPPNVSSSLPN
HMPSSINLLVQNQQTPNSAILTGNKANEEEEEEIIDDDDDTISSSPDSAV
SNTSLVPQADTSQNTSFDGSLIQKMQIPTLLQEPLSNSLKISDIITRNTN
DPGVGSKHLMEGQKIITLDTATEIEGLSTGCKVYANIGEDTYDIVIPVKD
DPDEGEARLENEIPKTSGSEMANKRMKVKHDDHYELIVDGRVYYICIVCK
RSYVCLTSLRRHFNIHSWEKKYPCRYCEKVFPLAEYRTKHEIHHTGERRY
QCLACGKSFINYQFMSSHIKSVHSQDPSGDSKLYRLHPCRSLQIRQYAYL
SDRSSTIPAMKDDGIGYKVDTGKEPPVGTTTSTQNKPMTWEDIFIQQEND
SIFKQNVTDGSTEFEFIIPESY

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, сигнальний шлях Wnt. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Daniel J.M., Reynolds A.B. (1999). The catenin p120(ctn) interacts with Kaiso, a novel BTB/POZ domain zinc finger transcription factor. Mol. Cell. Biol. 19: 3614—3623. PMID 10207085 DOI:10.1128/MCB.19.5.3614
  • Yoon H.-G., Chan D.W., Reynolds A.B., Qin J., Wong J. (2003). N-CoR mediates DNA methylation-dependent repression through a methyl CpG binding protein Kaiso. Mol. Cell. 12: 723—734. PMID 14527417 DOI:10.1016/j.molcel.2003.08.008
  • Kondapalli J., Flozak A.S., Albuquerque M.L.C. (2004). Laminar shear stress differentially modulates gene expression of p120 catenin, Kaiso transcription factor, and vascular endothelial cadherin in human coronary artery endothelial cells. J. Biol. Chem. 279: 11417—11424. PMID 14699141 DOI:10.1074/jbc.M306057200
  • Kelly K.F., Otchere A.A., Graham M., Daniel J.M. (2004). Nuclear import of the BTB/POZ transcriptional regulator Kaiso. J. Cell Sci. 117: 6143—6152. PMID 15564377 DOI:10.1242/jcs.01541

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:16682 (англ.) . Архів оригіналу за 30 червня 2017. Процитовано 13 вересня 2017.
  4. UniProt, Q86T24 (англ.) . Архів оригіналу за 31 серпня 2017. Процитовано 13 вересня 2017.

Див. також

Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль
/ Лейцинова застібка
(bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4)
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
  • WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
  • AP2
  • EREBP
  • B3
(0.6) Інші