ZFPM1

ZFPM1
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

2XU7

Ідентифікатори
Символи ZFPM1, FOG, FOG1, ZC2HC11A, ZNF408, ZNF89A, zinc finger protein, FOG family member 1
Зовнішні ІД OMIM: 601950 MGI: 1095400 HomoloGene: 7606 GeneCards: ZFPM1
Онтологія гена
Молекулярна функція

DNA binding
transcription factor binding
зв'язування з іоном металу
GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
nucleic acid binding
GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific

Клітинна компонента

цитоплазма
transcription regulator complex
transcription repressor complex
нуклеоплазма
клітинне ядро

Біологічний процес

megakaryocyte development
megakaryocyte differentiation
negative regulation of mast cell differentiation
negative regulation of fat cell differentiation
GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
homeostasis of number of cells
ventricular septum morphogenesis
outflow tract morphogenesis
Тромбоцитопоез
зсідання крові
cardiac muscle tissue morphogenesis
GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II
negative regulation of protein binding
transcription, DNA-templated
regulation of chemokine production
atrial septum morphogenesis
heart development
atrioventricular valve morphogenesis
granulocyte differentiation
embryonic hemopoiesis
regulation of definitive erythrocyte differentiation
T-helper cell lineage commitment
primitive erythrocyte differentiation
mitral valve formation
tricuspid valve formation
definitive erythrocyte differentiation
GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
erythrocyte differentiation
regulation of megakaryocyte differentiation
GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
161882
22761
Ensembl
ENSG00000179588
ENSMUSG00000049577
UniProt
Q8IX07
O35615
RefSeq (мРНК)
NM_153813
NM_009569
RefSeq (білок)
NP_722520
NP_033595
Локус (UCSC) Хр. 16: 88.45 – 88.54 Mb Хр. 8: 123.01 – 123.06 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

ZFPM1 (англ. Zinc finger protein, FOG family member 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 006 амінокислот, а молекулярна маса — 104 888[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MSRRKQSNPRQIKRSLGDMEAREEVQLVGASHMEQKATAPEAPSPPSADV
NSPPPLPPPTSPGGPKELEGQEPEPRPTEEEPGSPWSGPDELEPVVQDGQ
RRIRARLSLATGLSWGPFHGSVQTRASSPRQAEPSPALTLLLVDEACWLR
TLPQALTEAEANTEIHRKDDALWCRVTKPVPAGGLLSVLLTAEPHSTPGH
PVKKEPAEPTCPAPAHDLQLLPQQAGMASILATAVINKDVFPCKDCGIWY
RSERNLQAHLLYYCASRQGTGSPAAAATDEKPKETYPNERVCPFPQCRKS
CPSASSLEIHMRSHSGERPFVCLICLSAFTTKANCERHLKVHTDTLSGVC
HSCGFISTTRDILYSHLVTNHMVCQPGSKGEIYSPGAGHPATKLPPDSLG
SFQQQHTALQGPLASADLGLAPTPSPGLDRKALAEATNGEARAEPLAQNG
GSSEPPAAPRSIKVEAVEEPEAAPILGPGEPGPQAPSRTPSPRSPAPARV
KAELSSPTPGSSPVPGELGLAGALFLPQYVFGPDAAPPASEILAKMSELV
HSRLQQGAGAGAGGAQTGLFPGAPKGATCFECEITFSNVNNYYVHKRLYC
SGRRAPEDAPAARRPKAPPGPARAPPGQPAEPDAPRSSPGPGAREEGAGG
AATPEDGAGGRGSEGSQSPGSSVDDAEDDPSRTLCEACNIRFSRHETYTV
HKRYYCASRHDPPPRRPAAPPGPPGPAAPPAPSPAAPVRTRRRRKLYELH
AAGAPPPPPPGHAPAPESPRPGSGSGSGPGLAPARSPGPAADGPIDLSKK
PRRPLPGAPAPALADYHECTACRVSFHSLEAYLAHKKYSCPAAPPPGALG
LPAAACPYCPPNGPVRGDLLEHFRLAHGLLLGAPLAGPGVEARTPADRGP
SPAPAPAASPQPGSRGPRDGLGPEPQEPPPGPPPSPAAAPEAVPPPPAPP
SYSDKGVQTPSKGTPAPLPNGNHRYCRLCNIKFSSLSTFIAHKKYYCSSH
AAEHVK

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

  • Giorgianni F., Zhao Y., Desiderio D.M., Beranova-Giorgianni S. (2007). Toward a global characterization of the phosphoproteome in prostate cancer cells: identification of phosphoproteins in the LNCaP cell line. Electrophoresis. 28: 2027—2034. PMID 17487921 DOI:10.1002/elps.200600782

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:19762 (англ.) . Архів оригіналу за 26 березня 2016. Процитовано 11 вересня 2017.
  4. UniProt, Q8IX07 (англ.) . Архів оригіналу за 20 липня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 16
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії.
Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій.