ZNF106 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | ZNF106, SH3BP3, ZFP106, ZNF474, zinc finger protein 106 |
---|
Зовнішні ІД | MGI: 1270153 HomoloGene: 40787 GeneCards: ZNF106 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • зв'язування з іоном металу • SH3 domain binding • RNA binding • nucleic acid binding |
---|
Клітинна компонента | • клітинне ядро • ядерце • гіалоплазма • мембрана • nuclear speck |
---|
Біологічний процес | • GO:1901047 insulin receptor signaling pathway |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | NM_001284306 NM_001284307 NM_022473 NM_001366844 NM_001366845
| NM_001366846 NM_001381993 NM_001381994 NM_001381995 NM_001381996 NM_001381997 NM_001381998 |
| |
---|
RefSeq (білок) | NP_001271235 NP_001271236 NP_071918 NP_001353773 NP_001353774
| NP_001353775 NP_001368922 NP_001368923 NP_001368924 NP_001368925 NP_001368926 NP_001368927 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 15: 42.41 – 42.49 Mb | Хр. 2: 120.34 – 120.39 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
ZNF106 (англ. Zinc finger protein 106) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 883 амінокислот, а молекулярна маса — 208 883[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MPVGRIECPS | | SPSFPRDISH | | ECRVCGVTEV | | GLSAYAKHIS | | GQLHKDNVDA |
QEREDDGKGE | | EEEEDYFDKE | | LIQLIKQRKE | | QSRQDEPSNS | | NQEINSDDRR |
PQWRREDRIP | | YQDRESYSQP | | AWHHRGPPQR | | DWKWEKDGFN | | NTRKNSFPHS |
LRNGGGPRGR | | SGWHKGVAGG | | SSTWFHNHSN | | SGGGWLSNSG | | AVDWNHNGTG |
RNSSWLSEGT | | GGFSSWHMNN | | SNGNWKSSVR | | STNNWNYSGP | | GDKFQPGRNR |
NSNCQMEDMT | | MLWNKKSNKS | | NKYSHDRYNW | | QRQENDKLGT | | VATYRGPSEG |
FTSDKFPSEG | | LLDFNFEQLE | | SQTTKQADTA | | TSKVSGKNGS | | AAREKPRRWT |
PYPSQKTLDL | | QSGLKDITGN | | KSEMIEKPLF | | DFSLITTGIQ | | EPQTDETRNS |
PTQKTQKEIH | | TGSLNHKASS | | DSAASFEVVR | | QCPTAEKPEQ | | EHTPNKMPSL |
KSPLLPCPAT | | KSLSQKQDPK | | NISKNTKTNF | | FSPGEHSNPS | | NKPTVEDNHG |
PYISKLRSSC | | PHVLKGNKST | | FGSQKQSGDN | | LNDTLRKAKE | | VLQCHESLQN |
PLLSTSKSTR | | NYAKASRNVE | | ESEKGSLKIE | | FQVHALEDES | | DGETSDTEKH |
GTKIGTLGSA | | TTELLSGSTR | | TADEKEEDDR | | ILKTSRELST | | SPCNPIVRQK |
ESELQMTSAA | | SPHPGLLLDL | | KTSLEDAQVD | | DSIKSHVSYE | | TEGFESASLD |
AELQKSDISQ | | PSGPLLPELS | | KLGFPASLQR | | DLTRHISLKS | | KTGVHLPEPN |
LNSARRIRNI | | SGHRKSETEK | | ESGLKPTLRQ | | ILNASRRNVN | | WEQVIQQVTK |
KKQELGKGLP | | RFGIEMVPLV | | QNEQEALDLD | | GEPDLSSLEG | | FQWEGVSISS |
SPGLARKRSL | | SESSVIMDRA | | PSVYSFFSEE | | GTGKENEPQQ | | MVSPSNSLRA |
GQSQKATMHL | | KQEVTPRAAS | | LRTGERAENV | | ATQRRHSAQL | | SSDHIIPLMH |
LAKDLNSQER | | SIPPSENQNS | | QESNGEGNCL | | SSSASSALAI | | SSLADAATDS |
SCTSGAEQND | | GQSIRKKRRA | | TGDGSSPELP | | SLERKNKRRK | | IKGKKERSQV |
DQLLNISLRE | | EELSKSLQCM | | DNNLLQARAA | | LQTAYVEVQR | | LLMLKQQITM |
EMSALRTHRI | | QILQGLQETY | | EPSEHPDQVP | | CSLTRERRNS | | RSQTSIDAAL |
LPTPFFPLFL | | EPPSSHVSPS | | PTGASLQITT | | SPTFQTHGSV | | PAPDSSVQIK |
QEPMSPEQDE | | NVNAVPPSSA | | CNVSKELLEA | | NREISDSCPV | | YPVITARLSL |
PESTESFHEP | | SQELKFSVEQ | | RNTRNRENSP | | SSQSAGLSSI | | NKEGEEPTKG |
NSGSEACTSS | | FLRLSFASET | | PLEKEPHSPA | | DQPEQQAEST | | LTSAETRGSK |
KKKKLRKKKS | | LRAAHVPENS | | DTEQDVLTVK | | PVRKVKAGKL | | IKGGKVTTST |
WEDSRTGREQ | | ESVRDEPDSD | | SSLEVLEIPN | | PQLEVVAIDS | | SESGEEKPDS |
PSKKDIWNST | | EQNPLETSRS | | GCDEVSSTSE | | IGTRYKDGIP | | VSVAETQTVI |
SSIKGSKNSS | | EISSEPGDDD | | EPTEGSFEGH | | QAAVNAIQIF | | GNLLYTCSAD |
KTVRVYNLVS | | RKCIGVFEGH | | TSKVNCLLVT | | QTSGKNAALY | | TGSSDHTIRC |
YNVKSRECVE | | QLQLEDRVLC | | LHSRWRILYA | | GLANGTVVTF | | NIKNNKRLEI |
FECHGPRAVS | | CLATAQEGAR | | KLLVVGSYDC | | TISVRDARNG | | LLLRTLEGHS |
KTILCMKVVN | | DLVFSGSSDQ | | SVHAHNIHTG | | ELVRIYKGHN | | HAVTVVNILG |
KVMVTACLDK | | FVRVYELQSH | | DRLQVYGGHK | | DMIMCMTIHK | | SMIYTGCYDG |
SIQAVRLNLM | | QNYRCWWHGC | | SLIFGVVDHL | | KQHLLTDHTN | | PNFQTLKCRW |
KNCDAFFTAR | | KGSKQDAAGH | | IERHAEDDSK | | IDS |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Impens F., Radoshevich L., Cossart P., Ribet D. (2014). Mapping of SUMO sites and analysis of SUMOylation changes induced by external stimuli. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 111: 12432—12437. PMID 25114211 DOI:10.1073/pnas.1413825111
- Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage. Cell Rep. 10: 1778—1791. PMID 25772364 DOI:10.1016/j.celrep.2015.02.033
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12886 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 11 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q9H2Y7 (англ.) . Архів оригіналу за 15 січня 2018. Процитовано 11 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |