ZNF160

Ідентифікатори

Символи

ZNF160, F11, HKr18, HZF5, KR18, zinc finger protein 160

Зовнішні ІД

OMIM: 600398 HomoloGene: 131121 GeneCards: ZNF160

Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding • зв'язування з іоном металу • nucleic acid binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента	• внутрішньоклітинний • клітинне ядро
Біологічний процес	• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • кровотворення
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


90338


н/д

Ensembl


ENSG00000170949


н/д

UniProt


Q9HCG1


н/д

RefSeq (мРНК)

NM_001102603 NM_033288 NM_198893 NM_001322125 NM_001322126
NM_001322128 NM_001322129 NM_001322130 NM_001322131 NM_001322132 NM_001322133 NM_001322134 NM_001322135 NM_001322136 NM_001322137 NM_001322138 NM_001322139


н/д

RefSeq (білок)

NP_001096073 NP_001309054 NP_001309055 NP_001309057 NP_001309058
NP_001309059 NP_001309060 NP_001309061 NP_001309062 NP_001309063 NP_001309064 NP_001309065 NP_001309066 NP_001309067 NP_001309068 NP_150630 NP_942596


н/д

Локус (UCSC)

Хр. 19: 53.07 – 53.1 Mb

н/д

PubMed search

^[1]

н/д

Вікідані

Див./Ред. для людей

ZNF160 (англ. Zinc finger protein 160) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.^[2] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 818 амінокислот, а молекулярна маса — 94 112^[3].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MALTQVRLTF	RDVAIEFSQE	EWKCLDPAQR	ILYRDVMLEN	YWNLVSLGLC
HFDMNIISML	EEGKEPWTVK	SCVKIARKPR	TPECVKGVVT	DIPPKCTIKD
LLPKEKSSTE	AVFHTVVLER	HESPDIEDFS	FKEPQKNVHD	FECQWRDDTG
NYKGVLMAQK	EGKRDQRDRR	DIENKLMNNQ	LGVSFHSHLP	ELQLFQGEGK
MYECNQVEKS	TNNGSSVSPL	QQIPSSVQTH	RSKKYHELNH	FSLLTQRRKA
NSCGKPYKCN	ECGKAFTQNS	NLTSHRRIHS	GEKPYKCSEC	GKTFTVRSNL
TIHQVIHTGE	KPYKCHECGK	VFRHNSYLAT	HRRIHTGEKP	YKCNECGKAF
RGHSNLTTHQ	LIHTGEKPFK	CNECGKLFTQ	NSHLISHWRI	HTGEKPYKCN
ECGKAFSVRS	SLAIHQTIHT	GEKPYKCNEC	GKVFRYNSYL	GRHRRVHTGE
KPYKCNECGK	AFSMHSNLAT	HQVIHTGTKP	FKCNECSKVF	TQNSQLANHR
RIHTGEKPYK	CNECGKAFSV	RSSLTTHQAI	HSGEKPYKCI	ECGKSFTQKS
HLRSHRGIHS	GEKPYKCNEC	GKVFAQTSQL	ARHWRVHTGE	KPYKCNDCGR
AFSDRSSLTF	HQAIHTGEKP	YKCHECGKVF	RHNSYLATHR	RIHTGEKPYK
CNECGKAFSM	HSNLTTHKVI	HTGEKPYKCN	QCGKVFTQNS	HLANHQRTHT
GEKPYRCNEC	GKAFSVRSSL	TTHQAIHTGK	KPYKCNECGK	VFTQNAHLAN
HRRIHTGEKP	YRCTECGKAF	RVRSSLTTHM	AIHTGEKRYK	CNECGKVFRQ
SSNLASHHRM	HTGEKPYK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Mark C., Looman C., Abrink M., Hellman L. (2001). Molecular cloning and preliminary functional analysis of two novel human KRAB zinc finger proteins, HKr18 and HKr19. DNA Cell Biol. 20: 275—286. PMID 11410164 DOI:10.1089/104454901750232472
Nagase T., Kikuno R., Nakayama M., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVIII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 273—281. PMID 10997877 DOI:10.1093/dnares/7.4.271
Abrink M., Aveskogh M., Hellman L. (1995). Isolation of cDNA clones for 42 different Kruppel-related zinc finger proteins expressed in the human monoblast cell line U-937. DNA Cell Biol. 14: 125—136. PMID 7865130 DOI:10.1089/dna.1995.14.125

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12948 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9HCG1 (англ.) . Архів оригіналу за 12 жовтня 2016. Процитовано 12 вересня 2017.