ZNF366 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | ZNF366, DCSCRIPT, zinc finger protein 366, DC-SCRIPT |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 610159 MGI: 2178429 HomoloGene: 17637 GeneCards: ZNF366 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • DNA binding • estrogen receptor binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001106 transcription corepressor activity • зв'язування з іоном металу • nucleic acid binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific |
---|
Клітинна компонента | • клітинне ядро |
---|
Біологічний процес | • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • negative regulation of intracellular estrogen receptor signaling pathway • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • response to estrogen |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 5: 72.44 – 72.51 Mb | Хр. 13: 99.32 – 99.39 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
ZNF366 (англ. Zinc finger protein 366) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 744 амінокислот, а молекулярна маса — 85 107[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MQKEMKMIKD | | EDVHFDLAVK | | KTPSFPHCLQ | | PVASRGKAPQ | | RHPFPEALRG |
PFSQFRYEPP | | PGDLDGFPGV | | FEGAGSRKRK | | SMPTKMPYNH | | PAEEVTLALH |
SEENKNHGLP | | NLPLLFPQPP | | RPKYDSQMID | | LCNVGFQFYR | | SLEHFGGKPV |
KQEPIKPSAV | | WPQPTPTPFL | | PTPYPYYPKV | | HPGLMFPFFV | | PSSSPFPFSR |
HTFLPKQPPE | | PLLPRKAEPQ | | ESEETKQKVE | | RVDVNVQIDD | | SYYVDVGGSQ |
KRWQCPTCEK | | SYTSKYNLVT | | HILGHSGIKP | | HACTHCGKLF | | KQLSHLHTHM |
LTHQGTRPHK | | CQVCHKAFTQ | | TSHLKRHMMQ | | HSEVKPHNCR | | VCGRGFAYPS |
ELKAHEAKHA | | SGRENICVEC | | GLDFPTLAQL | | KRHLTTHRGP | | IQYNCSECDK |
TFQYPSQLQN | | HMMKHKDIRP | | YICSECGMEF | | VQPHHLKQHS | | LTHKGVKEHK |
CGICGREFTL | | LANMKRHVLI | | HTNIRAYQCH | | LCYKSFVQKQ | | TLKAHMIVHS |
DVKPFKCKLC | | GKEFNRMHNL | | MGHMHLHSDS | | KPFKCLYCPS | | KFTLKGNLTR |
HMKVKHGVME | | RGLHSQGLGR | | GRIALAQTAG | | VLRSLEQEEP | | FDLSQKRRAK |
VPVFQSDGES | | AQGSHCHEEE | | EEDNCYEVEP | | YSPGLAPQSQ | | QLCTPEDLST |
KSEHAPEVLE | | EACKEEKEDA | | SKGEWEKRSK | | GDLGAEGGQE | | RDCAGRDECL |
SLRAFQSTRR | | GPSFSDYLYF | | KHRDESLKEL | | LERKMEKQAV | | LLGI |
Кодований геном білок за функцією належить до репресорів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Gilligan P., Brenner S., Venkatesh B. (2002). Fugu and human sequence comparison identifies novel human genes and conserved non-coding sequences. Gene. 294: 35—44. PMID 12234665 DOI:10.1016/S0378-1119(02)00793-X
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:18316 (англ.) . Процитовано 5 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q8N895 (англ.) . Архів оригіналу за 13 квітня 2017. Процитовано 5 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
|
---|
(1) Основні домени |
---|
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
---|
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
---|
(1.4) NF-1 | |
---|
(1.5) RF-X | |
---|
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
---|
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | підродина 1 | |
---|
підродина 2 | |
---|
підродина 3 | - Стероїдні гормони
- Естроген-зв'язувальні
|
---|
підродина 4 | |
---|
підродина 5 | |
---|
підродина 6 | |
---|
підродина 0 | |
---|
|
---|
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
---|
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
---|
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
---|
(2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
---|
(2.6) WRKY | |
---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
---|
(3.1) Гомеобокс | |
---|
(3.2) Парний бокс | |
---|
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
---|
(3.4) Фактори теплового шоку | |
---|
(3.5) Триптофановий кластер | |
---|
(3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
---|
(4.1) RHR | |
---|
(4.2) STAT | |
---|
(4.3) p53 | |
---|
(4.4) MADS | |
---|
(4.6) TATA | |
---|
(4.7) Високомобільна група | |
---|
(4.9) Grainyhead | |
---|
(4.10) Домен холодового шоку | |
---|
(4.11) Runt | |
---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
---|
(0.2) HMGI(Y) | |
---|
(0.3) Pocket домен | |
---|
(0.5) AP2/EREBP-подібні | |
---|
(0.6) Інші | |
---|
|
|