ZNF473

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2EMB, 2EMC, 2EME, 2EOU, 2EOX, 2EOY, 2EOZ, 2YRH, 2YRJ, 2YSV, 2YTD, 2YTE, 2YTT, 2YU5

Ідентифікатори

Символи

ZNF473, HZFP100, ZN473, zinc finger protein 473, ZFP100

Зовнішні ІД

OMIM: 617908 MGI: 2442697 HomoloGene: 18698 GeneCards: ZNF473

Онтологія гена
Молекулярна функція	• зв'язування з іоном металу • DNA binding • nucleic acid binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding
Клітинна компонента	• Тільце Кахаля • клітинне ядро • внутрішньоклітинний • нуклеоплазма
Біологічний процес	• termination of RNA polymerase II transcription • mRNA 3'-end processing by stem-loop binding and cleavage • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • histone mRNA metabolic process
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


25888


243963

Ensembl


ENSG00000142528


ENSMUSG00000048012

UniProt


Q8WTR7


Q8BI67

RefSeq (мРНК)


NM_001006656 NM_001308424 NM_015428


NM_001289836 NM_001289837 NM_001289838 NM_001289839 NM_178734

RefSeq (білок)


NP_001006657 NP_001295353 NP_056243


NP_001276765 NP_001276766 NP_001276767 NP_001276768 NP_848849

Локус (UCSC)

Хр. 19: 50.03 – 50.05 Mb

Хр. 7: 44.38 – 44.4 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

ZNF473 (англ. Zinc finger protein 473) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 871 амінокислот, а молекулярна маса — 100 182^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAEEFVTLKD	VGMDFTLGDW	EQLGLEQGDT	FWDTALDNCQ	DLFLLDPPRP
NLTSHPDGSE	DLEPLAGGSP	EATSPDVTET	KNSPLMEDFF	EEGFSQEIIE
MLSKDGFWNS	NFGEACIEDT	WLDSLLGDPE	SLLRSDIATN	GESPTECKSH
ELKRGLSPVS	TVSTGEDSMV	HNVSEKTLTP	AKSKEYRGEF	FSYSDHSQQD
SVQEGEKPYQ	CSECGKSFSG	SYRLTQHWIT	HTREKPTVHQ	ECEQGFDRNA
SLSVYPKTHT	GYKFYVCNEY	GTTFSQSTYL	WHQKTHTGEK	PCKSQDSDHP
PSHDTQPGEH	QKTHTDSKSY	NCNECGKAFT	RIFHLTRHQK	IHTRKRYECS
KCQATFNLRK	HLIQHQKTHA	AKTTSECQEC	GKIFRHSSLL	IEHQALHAGE
EPYKCNERGK	SFRHNSTLKI	HQRVHSGEKP	YKCSECGKAF	HRHTHLNEHR
RIHTGYRPHK	CQECVRSFSR	PSHLMRHQAI	HTAEKPYSCA	ECKETFSDNN
RLVQHQKMHT	VKTPYECQEC	GERFICGSTL	KCHESVHARE	KQGFFVSGKI
LDQNPEQKEK	CFKCNKCEKT	FSCSKYLTQH	ERIHTRGVKP	FECDQCGKAF
GQSTRLIHHQ	RIHSRVRLYK	WGEQGKAISS	ASLIKLQSFH	TKEHPFKCNE
CGKTFSHSAH	LSKHQLIHAG	ENPFKCSKCD	RVFTQRNYLV	QHERTHARKK
PLVCNECGKT	FRQSSCLSKH	QRIHSGEKPY	VCDYCGKAFG	LSAELVRHQR
IHTGEKPYVC	QECGKAFTQS	SCLSIHRRVH	TGEKPYRCGE	CGKAFAQKAN
LTQHQRIHTG	EKPYSCNVCG	KAFVLSAHLN	QHLRVHTQET	LYQCQRCQKA
FRCHSSLSRH	QRVHNKQQYC	L

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

Dominski Z., Erkmann J.A., Yang X., Sanchez R., Marzluff W.F. (2002). A novel zinc finger protein is associated with U7 snRNP and interacts with the stem-loop binding protein in the histone pre-mRNP to stimulate 3'-end processing. Genes Dev. 16: 58—71. PMID 11782445 DOI:10.1101/gad.932302
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Azzouz T.N., Gruber A., Schuemperli D. (2005). U7 snRNP-specific Lsm11 protein: dual binding contacts with the 100 kDa zinc finger processing factor (ZFP100) and a ZFP100-independent function in histone RNA 3'-end processing. Nucleic Acids Res. 33: 2106—2117. PMID 15824063 DOI:10.1093/nar/gki516
Wagner E.J., Marzluff W.F. (2006). ZFP100, a component of the active U7 snRNP limiting for histone pre-mRNA processing, is required for entry into S phase. Mol. Cell. Biol. 26: 6702—6712. PMID 16914750 DOI:10.1128/MCB.00391-06

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:23239 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, Q8WTR7 (англ.) . Архів оригіналу за 11 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.