ZPR1 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | ZPR1, ZNF259, ZPR1 zinc finger, GKAF |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 603901 MGI: 1330262 HomoloGene: 2900 GeneCards: ZPR1 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • receptor tyrosine kinase binding • zinc ion binding • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • translation initiation factor binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • перикаріон • Тільце Кахаля • cell projection • growth cone • нуклеоплазма • SMN complex • аксон • neuronal cell body • ядерце • perinuclear region of cytoplasm • клітинне ядро • gemini of coiled bodies |
---|
Біологічний процес | • диференціація клітин • axon development • pre-mRNA catabolic process • Cajal body organization • mRNA processing • apoptotic process involved in development • positive regulation of growth • inner cell mass cell proliferation • cellular response to epidermal growth factor stimulus • GO:1901313 positive regulation of gene expression • regulation of myelination • positive regulation of transcription involved in G1/S transition of mitotic cell cycle • Сплайсинг РНК • spinal cord development • positive regulation of RNA splicing • positive regulation of protein import into nucleus • проліферація • DNA endoreduplication • microtubule cytoskeleton organization • trophectodermal cell proliferation • GO:0072468 сигнальна трансдукція • negative regulation of motor neuron apoptotic process |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 11: 116.77 – 116.79 Mb | Хр. 9: 46.18 – 46.19 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
ZPR1 (англ. ZPR1 zinc finger) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 459 амінокислот, а молекулярна маса — 50 925[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MAASGAVEPG | | PPGAAVAPSP | | APAPPPAPDH | | LFRPISAEDE | | EQQPTEIESL |
CMNCYCNGMT | | RLLLTKIPFF | | REIIVSSFSC | | EHCGWNNTEI | | QSAGRIQDQG |
VRYTLSVRAL | | EDMNREVVKT | | DSAATRIPEL | | DFEIPAFSQK | | GALTTVEGLI |
TRAISGLEQD | | QPARRANKDA | | TAERIDEFIV | | KLKELKQVAS | | PFTLIIDDPS |
GNSFVENPHA | | PQKDDALVIT | | HYNRTRQQEE | | MLGLQEEAPA | | EKPEEEDLRN |
EVLQFSTNCP | | ECNAPAQTNM | | KLVQIPHFKE | | VIIMATNCEN | | CGHRTNEVKS |
GGAVEPLGTR | | ITLHITDASD | | MTRDLLKSET | | CSVEIPELEF | | ELGMAVLGGK |
FTTLEGLLKD | | IRELVTKNPF | | TLGDSSNPGQ | | TERLQEFSQK | | MDQIIEGNMK |
AHFIMDDPAG | | NSYLQNVYAP | | EDDPEMKVER | | YKRTFDQNEE | | LGLNDMKTEG |
YEAGLAPQR |
Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, диференціація клітин. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, клітинних відростках.
Література
- Gangwani L., Mikrut M., Galcheva-Gargova Z., Davis R.J. (1998). Interaction of ZPR1 with translation elongation factor-1alpha in proliferating cells. J. Cell Biol. 143: 1471—1484. PMID 9852145 DOI:10.1083/jcb.143.6.1471
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Gangwani L., Mikrut M., Theroux S., Sharma M., Davis R.J. (2001). Spinal muscular atrophy disrupts the interaction of ZPR1 with the SMN protein. Nat. Cell Biol. 3: 376—383. PMID 11283611 DOI:10.1038/35070059
- Narayanan U., Ospina J.K., Frey M.R., Hebert M.D., Matera A.G. (2002). SMN, the spinal muscular atrophy protein, forms a pre-import snRNP complex with snurportin1 and importin beta. Hum. Mol. Genet. 11: 1785—1795. PMID 12095920 DOI:10.1093/hmg/11.15.1785
- Gangwani L. (2006). Deficiency of the zinc finger protein ZPR1 causes defects in transcription and cell cycle progression. J. Biol. Chem. 281: 40330—40340. PMID 17068332 DOI:10.1074/jbc.M608165200
- Ahmad S., Wang Y., Shaik G.M., Burghes A.H., Gangwani L. (2012). The zinc finger protein ZPR1 is a potential modifier of spinal muscular atrophy. Hum. Mol. Genet. 21: 2745—2758. PMID 22422766 DOI:10.1093/hmg/dds102
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:13051 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
- ↑ UniProt, O75312 (англ.) . Архів оригіналу за 9 листопада 2017. Процитовано 8 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
|
---|
(1) Основні домени |
---|
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
---|
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
---|
(1.4) NF-1 | |
---|
(1.5) RF-X | |
---|
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
---|
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | підродина 1 | |
---|
підродина 2 | |
---|
підродина 3 | - Стероїдні гормони
- Естроген-зв'язувальні
|
---|
підродина 4 | |
---|
підродина 5 | |
---|
підродина 6 | |
---|
підродина 0 | |
---|
|
---|
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
---|
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
---|
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
---|
(2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
---|
(2.6) WRKY | |
---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
---|
(3.1) Гомеобокс | |
---|
(3.2) Парний бокс | |
---|
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
---|
(3.4) Фактори теплового шоку | |
---|
(3.5) Триптофановий кластер | |
---|
(3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
---|
(4.1) RHR | |
---|
(4.2) STAT | |
---|
(4.3) p53 | |
---|
(4.4) MADS | |
---|
(4.6) TATA | |
---|
(4.7) Високомобільна група | |
---|
(4.9) Grainyhead | |
---|
(4.10) Домен холодового шоку | |
---|
(4.11) Runt | |
---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
---|
(0.2) HMGI(Y) | |
---|
(0.3) Pocket домен | |
---|
(0.5) AP2/EREBP-подібні | |
---|
(0.6) Інші | |
---|
|
|