LIM结构域
LIM domain | |||||||||||
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Pinch蛋白的第四个LIM结构域,锌原子为灰色 | |||||||||||
鑑定 | |||||||||||
標誌 | LIM | ||||||||||
Pfam | PF00412(旧版) | ||||||||||
InterPro(英语:InterPro) | IPR001781 | ||||||||||
PROSITE(英语:PROSITE) | PDOC50178 | ||||||||||
SCOP(英语:Structural Classification of Proteins) | 1ctl / SUPFAM | ||||||||||
CDD(英语:Conserved Domain Database) | cd08368 | ||||||||||
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LIM结构域(英語:LIM domain)是一种蛋白质结构域,由两个疏水氨基酸残基连接两个锌指结构组成[1],其命名来自于最早发现这一结构域的三种蛋白(Lin11, Isl-1 & Mec-3)的首字母[2]。LIM结构域介导蛋白質交互作用,参与细胞骨架组建,在器官发育和肿瘤发生中有重要作用。
除了关键氨基酸如结合锌的半胱氨酸和中心的疏水氨基酸外,LIM结构域的氨基酸序列高度可变,其通式如下:
[C]-[X]2–4-[C]-[X]13–19-[W]-[H]-[X]2–4-[C]-[F]-[LVI]-[C]-[X]2–4-[C]-[X]13–20-C-[X]2–4-[C]
参考文献
- ^ Kadrmas JL, Beckerle MC. The LIM domain: from the cytoskeleton to the nucleus. Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 2004, 5 (11): 920–31. PMID 15520811. doi:10.1038/nrm1499.
- ^ Bach I. The LIM domain: regulation by association. Mech. Dev. 2000, 91 (1–2): 5–17. PMID 10704826. doi:10.1016/S0925-4773(99)00314-7.
- 查
- 论
- 编
- 3H(英语:3H domain)
- ABM(英语:ABM domain)
- ACDC(英语:ACDC domain)
- ACT(英语:ACT domain)
- ADF-H(英语:ADF-H domain)
- ANTH(英语:ANTH domain)
- ARID(英语:ARID domain)
- BAR
- BEN(英语:BEN domain)
- BESS(英语:BESS domain)
- BIR(英语:Inhibitor of apoptosis domain)
- BMC(英语:BMC domain)
- BPS(英语:BPS domain)
- BTB/POZ(英语:BTB/POZ domain)
- BZIP(英语:BZIP domain)
- C1(英语:C1 domain)
- C2(英语:C2 domain)
- Cache(英语:Cache domain)
- CBS(英语:CBS domain)
- CGI-121(英语:Kinase binding protein CGI-121)
- CRM(英语:CRM domain)
- CUB(英语:CUB domain)
- CUT(英语:CUT domain)
- CVNH(英语:CVNH domain)
- 死亡(英语:Death fold)
- CARD(英语:CARD domain)
- DD(英语:Death domain)
- DED(英语:Death effector domain)
- Pyrin(英语:Pyrin domain)
- DEP
- DHHC(英语:DHHC domain)
- DHR1(英语:DHR1 domain)
- DHR2(英语:DHR2 domain)
- DM(英语:DM domain)
- EcoEI_R_C(英语:EcoEI R protein C-terminal domain)
- EF1(英语:EF1 guanine nucleotide exchange domain)
- ENTH
- FGGY(英语:FGGY carbohydrate kinase family)
- FYVE(英语:FYVE domain)
- HEAT(英语:HEAT repeat)
- Kringle(英语:Kringle domain)
- LIM
- LRR
- NACHT(英语:NACHT domain)
- PAS
- LOV(英语:Light-oxygen-voltage-sensing domain)
- PDZ(英语:PDZ domain)
- PH
- PX
- SH2
- SH3
- SUN
- TRIO(英语:CRAL-TRIO domain)
- WD40(英语:WD40 repeat)
- X8
- YTH(英语:YTH protein domain)
- 锌指