POLR2G

Полипептид G РНК-полимеразы II (управляемой ДНК)
PDB rendering based on 2c35.PDB rendering based on 2c35.
Доступные структуры
PDB Поиск ортологов: PDBe, RCSB
Список идентификаторов PDB

2C35

Идентификаторы
Символ POLR2G ; RPB19; RPB7; hRPB19; hsRPB7
Внешние ID OMIM: 602013 MGI: 1914960 HomoloGene: 2019 GeneCards: Ген POLR2G
номер EC 2.7.7.6
Функция • single-stranded DNA binding

• single-stranded RNA binding
• DNA-directed RNA polymerase activity

• translation initiation factor binding
Компонент клетки • cytoplasmic mRNA processing body

• nucleus
• nucleoplasm
• DNA-directed RNA polymerase II, core complex

• nucleolus
Биологический процесс • nuclear-transcribed mRNA catabolic process, exonucleolytic

• mRNA splicing, via spliceosome
• DNA repair
• transcription-coupled nucleotide-excision repair
• nucleotide-excision repair
• transcription from RNA polymerase II promoter
• transcription initiation from RNA polymerase II promoter
• transcription elongation from RNA polymerase II promoter
• 7-methylguanosine mRNA capping
• apoptotic process
• RNA splicing
• gene expression
• viral process
• positive regulation of translational initiation
• positive regulation of viral transcription

• positive regulation of nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening
Источники: Amigo / QuickGO
Профиль экспрессии РНК
Больше информации
Ортологи
Вид Человек Мышь
Entrez 5436 67710
Ensembl ENSG00000168002 ENSMUSG00000071662
UniProt P62487 P62488
RefSeq (мРНК) NM_002696 NM_026329
RefSeq (белок) NP_002687 NP_080605
Локус (UCSC) Chr 11:
62.53 – 62.53 Mb		 Chr 19:
8.79 – 8.8 Mb
Поиск в PubMed Искать Искать

Субъединица RPB7 ДНК-управляемой РНК-полимеразы II  — фермент, кодируемый у человека геном POLR2G .[1][2]

Этот ген кодирует седьмую по величине субъединицу РНК-полимеразы II, полимеразы, ответственной за синтез РНК у эукариот. У дрожжей, объединение этой субъединицы с полимеразой при неоптимальных условиях роста указывает на то, что она может играть роль в регуляции функции полимеразы.[3]

Взаимодействия

POLR2G, как было выявлено, взаимодействует с TAF15,[4] POLR2C,[5] POLR2H[5] и POLR2E.[5]

Примечания

  1. ↑ Khazak V., Sadhale P.P., Woychik N.A., Brent R., Golemis E.A. Human RNA polymerase II subunit hsRPB7 functions in yeast and influences stress survival and cell morphology (англ.) // Molecular Biology of the Cell : journal. — 1995. — December (vol. 6, no. 7). — P. 759—775. — doi:10.1091/mbc.6.7.759. — PMID 7579693. — PMC 301239.
  2. ↑ Schoen T.J., Chandrasekharappa S.C., Guru S.C., Mazuruk K., Chader G.J., Rodriguez I.R. Human gene for the RNA polymerase II seventh subunit (hsRPB7): structure, expression and chromosomal localization (англ.) // Biochim Biophys Acta[англ.] : journal. — 1997. — August (vol. 1353, no. 1). — P. 39—49. — doi:10.1016/s0167-4781(97)00041-9. — PMID 9256063.
  3. ↑ Entrez Gene: POLR2G polymerase (RNA) II (DNA directed) polypeptide G  (неопр.).
  4. ↑ Bertolotti, A; Melot T; Acker J; Vigneron M; Delattre O; Tora L. EWS, but not EWS-FLI-1, is associated with both TFIID and RNA polymerase II: interactions between two members of the TET family, EWS and hTAFII68, and subunits of TFIID and RNA polymerase II complexes (англ.) // Mol. Cell. Biol. : journal. — UNITED STATES, 1998. — March (vol. 18, no. 3). — P. 1489—1497. — ISSN 0270-7306. — PMID 9488465. — PMC 108863.
  5. ↑ 1 2 3 Acker, J; de Graaff M; Cheynel I; Khazak V; Kedinger C; Vigneron M. Interactions between the human RNA polymerase II subunits (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — UNITED STATES, 1997. — July (vol. 272, no. 27). — P. 16815—16821. — ISSN 0021-9258. — doi:10.1074/jbc.272.27.16815. — PMID 9201987.

Литература

  • Jeang K.T. Tat, Tat-associated kinase, and transcription. (англ.) // J. Biomed. Sci.[англ.] : journal. — 1998. — Vol. 5, no. 1. — P. 24—7. — doi:10.1007/BF02253352. — PMID 9570510.
  • Yankulov K., Bentley D. Transcriptional control: Tat cofactors and transcriptional elongation. (англ.) // Curr. Biol. : journal. — 1998. — Vol. 8, no. 13. — P. R447—9. — doi:10.1016/S0960-9822(98)70289-1. — PMID 9651670.
  • Romano G., Kasten M., De Falco G., et al. Regulatory functions of Cdk9 and of cyclin T1 in HIV tat transactivation pathway gene expression. (англ.) // J. Cell. Biochem.[англ.] : journal. — 2000. — Vol. 75, no. 3. — P. 357—368. — doi:10.1002/(SICI)1097-4644(19991201)75:3<357::AID-JCB1>3.0.CO;2-K. — PMID 10536359.
  • Marcello A., Zoppé M., Giacca M. Multiple modes of transcriptional regulation by the HIV-1 Tat transactivator. (англ.) // IUBMB Life : journal. — 2002. — Vol. 51, no. 3. — P. 175—181. — doi:10.1080/152165401753544241. — PMID 11547919.
  • Stevens M., De Clercq E., Balzarini J. The regulation of HIV-1 transcription: molecular targets for chemotherapeutic intervention. (англ.) // Med Res Rev : journal. — 2007. — Vol. 26, no. 5. — P. 595—625. — doi:10.1002/med.20081. — PMID 16838299.
  • Harrich D., McMillan N., Munoz L., et al. Will diverse Tat interactions lead to novel antiretroviral drug targets? (англ.) // Current drug targets : journal. — 2007. — Vol. 7, no. 12. — P. 1595—1606. — doi:10.2174/138945006779025338. — PMID 17168834.
  • Kato H., Sumimoto H., Pognonec P., et al. HIV-1 Tat acts as a processivity factor in vitro in conjunction with cellular elongation factors. (англ.) // Genes Dev. : journal. — 1992. — Vol. 6, no. 4. — P. 655—666. — doi:10.1101/gad.6.4.655. — PMID 1559613.
  • Southgate C., Zapp M.L., Green M.R. Activation of transcription by HIV-1 Tat protein tethered to nascent RNA through another protein. (англ.) // Nature : journal. — 1990. — Vol. 345, no. 6276. — P. 640—642. — doi:10.1038/345640a0. — PMID 2190099.
  • Wu-Baer F., Sigman D., Gaynor R.B. Specific binding of RNA polymerase II to the human immunodeficiency virus trans-activating region RNA is regulated by cellular cofactors and Tat. (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1995. — Vol. 92, no. 16. — P. 7153—7157. — doi:10.1073/pnas.92.16.7153. — PMID 7638159. — PMC 41297.
  • Herrmann C.H., Rice A.P. Lentivirus Tat proteins specifically associate with a cellular protein kinase, TAK, that hyperphosphorylates the carboxyl-terminal domain of the large subunit of RNA polymerase II: candidate for a Tat cofactor. (англ.) // J. Virol.[англ.] : journal. — 1995. — Vol. 69, no. 3. — P. 1612—1620. — PMID 7853496. — PMC 188757.
  • Keen N.J., Gait M.J., Karn J. Human immunodeficiency virus type-1 Tat is an integral component of the activated transcription-elongation complex. (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1996. — Vol. 93, no. 6. — P. 2505—2510. — doi:10.1073/pnas.93.6.2505. — PMID 8637904. — PMC 39827.
  • Yang X., Herrmann C.H., Rice A.P. The human immunodeficiency virus Tat proteins specifically associate with TAK in vivo and require the carboxyl-terminal domain of RNA polymerase II for function. (англ.) // J. Virol.[англ.] : journal. — 1996. — Vol. 70, no. 7. — P. 4576—4584. — PMID 8676484. — PMC 190394.
  • Agostini I., Navarro J.M., Rey F., et al. The human immunodeficiency virus type 1 Vpr transactivator: cooperation with promoter-bound activator domains and binding to TFIIB. (англ.) // J. Mol. Biol.[англ.] : journal. — 1996. — Vol. 261, no. 5. — P. 599—606. — doi:10.1006/jmbi.1996.0485. — PMID 8800208.
  • Zhou Q., Sharp P.A. Tat-SF1: cofactor for stimulation of transcriptional elongation by HIV-1 Tat. (англ.) // Science : journal. — 1996. — Vol. 274, no. 5287. — P. 605—610. — doi:10.1126/science.274.5287.605. — PMID 8849451.
  • Okamoto H., Sheline C.T., Corden J.L., et al. Trans-activation by human immunodeficiency virus Tat protein requires the C-terminal domain of RNA polymerase II. (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1996. — Vol. 93, no. 21. — P. 11575—11579. — doi:10.1073/pnas.93.21.11575. — PMID 8876177. — PMC 38099.
  • Chun R.F., Jeang K.T. Requirements for RNA polymerase II carboxyl-terminal domain for activated transcription of human retroviruses human T-cell lymphotropic virus I and HIV-1. (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 1996. — Vol. 271, no. 44. — P. 27888—27894. — doi:10.1074/jbc.271.44.27888. — PMID 8910388.
  • Parada C.A., Roeder R.G. Enhanced processivity of RNA polymerase II triggered by Tat-induced phosphorylation of its carboxy-terminal domain. (англ.) // Nature : journal. — 1996. — Vol. 384, no. 6607. — P. 375—378. — doi:10.1038/384375a0. — PMID 8934526.
  • García-Martínez L.F., Ivanov D., Gaynor R.B. Association of Tat with purified HIV-1 and HIV-2 transcription preinitiation complexes. (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 1997. — Vol. 272, no. 11. — P. 6951—6958. — doi:10.1074/jbc.272.11.6951. — PMID 9054383.
  • Cujec T.P., Cho H., Maldonado E., et al. The human immunodeficiency virus transactivator Tat interacts with the RNA polymerase II holoenzyme. (англ.) // Mol. Cell. Biol. : journal. — 1997. — Vol. 17, no. 4. — P. 1817—1823. — PMID 9121429. — PMC 232028.