LIG1

edit
Ligaza I, DNK, ATP zavisna

PDB prikaz baziran na 1x9n.
Dostupne strukture
1X9N
Identifikatori
SimboliLIG1; MGC117397; MGC130025
Vanjski IDOMIM: 126391 MGI: 101789 HomoloGene: 197 GeneCards: LIG1 Gene
EC broj6.5.1.1
Ontologija gena
Molekularna funkcija vezivanje nukleotida
DNK vezivanje
aktivnost DNK ligaze
aktivnost DNK ligaze (ATP)
ATP vezivanje
aktivnost ligaze
vezivanje metalnih jona
Celularna komponenta nukleus
nukleoplazma
Biološki proces S faza mitotičkog ćelijskog ciklusa
mitotički ćelijski ciklus
održavanje telomera rekombinacijom
održavanje telomera
popravka dvolančanih prekida homolognom rekombinacijom
DNA metabolički proces
Pregled RNK izražavanja
podaci
Ortolozi
VrstaČovekMiš
Entrez397816881
EnsemblENSG00000105486ENSMUSG00000056394
UniProtP18858P37913
RefSeq (mRNA)NM_000234.1NM_001083188.1
RefSeq (protein)NP_000225.1NP_001076657.1
Lokacija (UCSC)Chr 19:
48.62 - 48.67 Mb
Chr 7:
13.86 - 13.9 Mb
PubMed pretraga[1][2]

DNK ligaza 1 je enzim koji je kod ljudi kodiran LIG1 genom. On učestvuje u replikaciji DNK i procesu popravke. Mutacije LIG1 koje proizvode deficijenciju DNK ligaze I rezultiraju u imunodeficijenciji i povećanoj senzitivnosti na agense koji oštećuju DNK.[1]

Reference

  1. „Entrez Gene: LIG1 ligase I, DNA, ATP-dependent”. 

Literatura

  • Leonhardt H, Cardoso MC (1996). „Targeting and association of proteins with functional domains in the nucleus: the insoluble solution.”. Int. Rev. Cytol. 162B: 303–35. DOI:10.1016/S0074-7696(08)62620-0. PMID 8557490. 
  • Tomkinson AE, Mackey ZB (1998). „Structure and function of mammalian DNA ligases.”. Mutat. Res. 407 (1): 1–9. PMID 9539976. 
  • Perrigot M, Pierrot-Deseilligny E, Bussel B, Held JP (1976). „[Paralysis following Dimer X radiculography]”. La Nouvelle presse médicale 5 (17): 1120–2. PMID 934827. 
  • Webster AD, Barnes DE, Arlett CF, et al. (1992). „Growth retardation and immunodeficiency in a patient with mutations in the DNA ligase I gene.”. Lancet 339 (8808): 1508–9. DOI:10.1016/0140-6736(92)91266-B. PMID 1351188. 
  • Barnes DE, Tomkinson AE, Lehmann AR, et al. (1992). „Mutations in the DNA ligase I gene of an individual with immunodeficiencies and cellular hypersensitivity to DNA-damaging agents.”. Cell 69 (3): 495–503. DOI:10.1016/0092-8674(92)90450-Q. PMID 1581963. 
  • Barnes DE, Kodama K, Tynan K, et al. (1992). „Assignment of the gene encoding DNA ligase I to human chromosome 19q13.2-13.3.”. Genomics 12 (1): 164–6. DOI:10.1016/0888-7543(92)90422-O. PMID 1733856. 
  • Petrini JH, Huwiler KG, Weaver DT (1991). „A wild-type DNA ligase I gene is expressed in Bloom's syndrome cells.”. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 88 (17): 7615–9. DOI:10.1073/pnas.88.17.7615. PMC 52352. PMID 1881902. 
  • Lasko DD, Tomkinson AE, Lindahl T (1990). „Mammalian DNA ligases. Biosynthesis and intracellular localization of DNA ligase I.”. J. Biol. Chem. 265 (21): 12618–22. PMID 2197279. 
  • Barnes DE, Johnston LH, Kodama K, et al. (1990). „Human DNA ligase I cDNA: cloning and functional expression in Saccharomyces cerevisiae.”. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 87 (17): 6679–83. DOI:10.1073/pnas.87.17.6679. PMC 54600. PMID 2204063. 
  • Montecucco A, Savini E, Weighardt F, et al. (1996). „The N-terminal domain of human DNA ligase I contains the nuclear localization signal and directs the enzyme to sites of DNA replication.”. EMBO J. 14 (21): 5379–86. PMC 394647. PMID 7489727. 
  • Maruyama K, Sugano S (1994). „Oligo-capping: a simple method to replace the cap structure of eukaryotic mRNAs with oligoribonucleotides.”. Gene 138 (1-2): 171–4. DOI:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298. 
  • Trask B, Fertitta A, Christensen M, et al. (1993). „Fluorescence in situ hybridization mapping of human chromosome 19: cytogenetic band location of 540 cosmids and 70 genes or DNA markers.”. Genomics 15 (1): 133–45. DOI:10.1006/geno.1993.1021. PMID 8432525. 
  • Petrini JH, Walsh ME, DiMare C, et al. (1996). „Isolation and characterization of the human MRE11 homologue.”. Genomics 29 (1): 80–6. DOI:10.1006/geno.1995.1217. PMID 8530104. 
  • Bentley D, Selfridge J, Millar JK, et al. (1996). „DNA ligase I is required for fetal liver erythropoiesis but is not essential for mammalian cell viability.”. Nat. Genet. 13 (4): 489–91. DOI:10.1038/ng0896-489. PMID 8696349. 
  • Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, et al. (1997). „Construction and characterization of a full length-enriched and a 5'-end-enriched cDNA library.”. Gene 200 (1-2): 149–56. DOI:10.1016/S0378-1119(97)00411-3. PMID 9373149. 
  • Rossi R, Villa A, Negri C, et al. (1999). „The replication factory targeting sequence/PCNA-binding site is required in G(1) to control the phosphorylation status of DNA ligase I.”. EMBO J. 18 (20): 5745–54. DOI:10.1093/emboj/18.20.5745. PMC 1171641. PMID 10523317. 
  • Matsumoto Y, Kim K, Hurwitz J, et al. (1999). „Reconstitution of proliferating cell nuclear antigen-dependent repair of apurinic/apyrimidinic sites with purified human proteins.”. J. Biol. Chem. 274 (47): 33703–8. DOI:10.1074/jbc.274.47.33703. PMID 10559261. 
  • Vispé S, Satoh MS (2000). „DNA repair patch-mediated double strand DNA break formation in human cells.”. J. Biol. Chem. 275 (35): 27386–92. DOI:10.1074/jbc.M003126200. PMID 10827190. 

Vidi još

  • p
  • r
  • u
PDB Galerija
1x9n: Kristalna struktura ljudske DNK ligaze I vezane za 5'-adenilisanu, oštećenu DNK
1x9n: Kristalna struktura ljudske DNK ligaze I vezane za 5'-adenilisanu, oštećenu DNK  
  • p
  • r
  • u
6.1: Ugljenik-Kiseonik
6.2: Ugljenik-Sumpor
Sukcinil koenzim A sintetaza - Acetil Co-A sintetaza - Dugačka masna acil CoA sintetaza
6.3: Ugljenik-Azot
Glutamin sintetaza - Ubikvitin ligaza (Von Hippel-Lindau tumor supresor, UBE3A, Mdm2, Anafaza-promovišući kompleks) - Glutation sintetaza - CTP sintetaza - Adenilosukcinat sintetaza - Argininosukcinat sintetaza - Sintetaza holokarboksilaze - GMP sintetaza - Asparagin sintetaza - Karbamoil fosfat sintetaza (I, II) - Gama-glutamilcistein sintetaza
6.4: Ugljenik-Ugljenik
Ugljenik-ugljenik ligaze
6.5: Fosforni Estar
6.6: Azot-Metal
  • p
  • r
  • u
Separacija
i inicijacija
Prokariotska
(inicijacija)
Eukariotska
(priprema u
G1 fazi)
Oba
Replikacija
Prokariotska
(elongacija)
Eukariotska
(sinteza u
S fazi)
Oba
Kretanje: Procesivnost  DNK ligaza
Terminacija
B bsyn: dnk (repl, cycl, reco, repr)  tscr (fact, tcrg, nucl, rnat, rept, ptts)  tltn (risu, pttl, nexn)  dnab, rnab/runp  stru (domn, 1°, 2°, 3°, 4°)