CD6 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | CD6, TP120, CD6 molecule |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 186720 MGI: 103566 HomoloGene: 4893 GeneCards: CD6 |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
розсіяний склероз[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • lipopolysaccharide binding • lipoteichoic acid binding • scavenger receptor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • identical protein binding |
---|
Клітинна компонента | • integral component of membrane • мембрана • intrinsic component of plasma membrane • клітинна мембрана • integral component of plasma membrane • T cell receptor complex • extracellular region • immunological synapse • external side of plasma membrane |
---|
Біологічний процес | • positive regulation of cytokine production involved in inflammatory response • heterophilic cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules • адаптивна імунна відповідь • процес імунної системи • acute inflammatory response to antigenic stimulus • рецептор-опосередкований ендоцитоз • response to lipopolysaccharide • адгезія клітин • positive regulation of T cell proliferation • вроджений імунітет • immunological synapse formation • lipopolysaccharide-mediated signaling pathway • vesicle-mediated transport • ендоцитоз |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001254750 NM_001254751 NM_006725 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_001241679 NP_001241680 NP_006716 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 11: 60.97 – 61.02 Mb | Хр. 19: 10.77 – 10.81 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
CD6 (англ. CD6 molecule) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 668 амінокислот, а молекулярна маса — 71 801[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MWLFFGITGL | | LTAALSGHPS | | PAPPDQLNTS | | SAESELWEPG | | ERLPVRLTNG |
SSSCSGTVEV | | RLEASWEPAC | | GALWDSRAAE | | AVCRALGCGG | | AEAASQLAPP |
TPELPPPPAA | | GNTSVAANAT | | LAGAPALLCS | | GAEWRLCEVV | | EHACRSDGRR |
ARVTCAENRA | | LRLVDGGGAC | | AGRVEMLEHG | | EWGSVCDDTW | | DLEDAHVVCR |
QLGCGWAVQA | | LPGLHFTPGR | | GPIHRDQVNC | | SGAEAYLWDC | | PGLPGQHYCG |
HKEDAGAVCS | | EHQSWRLTGG | | ADRCEGQVEV | | HFRGVWNTVC | | DSEWYPSEAK |
VLCQSLGCGT | | AVERPKGLPH | | SLSGRMYYSC | | NGEELTLSNC | | SWRFNNSNLC |
SQSLAARVLC | | SASRSLHNLS | | TPEVPASVQT | | VTIESSVTVK | | IENKESRELM |
LLIPSIVLGI | | LLLGSLIFIA | | FILLRIKGKY | | ALPVMVNHQH | | LPTTIPAGSN |
SYQPVPITIP | | KEVFMLPIQV | | QAPPPEDSDS | | GSDSDYEHYD | | FSAQPPVALT |
TFYNSQRHRV | | TDEEVQQSRF | | QMPPLEEGLE | | ELHASHIPTA | | NPGHCITDPP |
SLGPQYHPRS | | NSESSTSSGE | | DYCNSPKSKL | | PPWNPQVFSS | | ERSSFLEQPP |
NLELAGTQPA | | FSAGPPADDS | | SSTSSGEWYQ | | NFQPPPQPPS | | EEQFGCPGSP |
SPQPDSTDND | | DYDDISAA |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, адаптивний імунітет, імунітет, вроджений імунітет, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані. Також секретований назовні.
Література
- Aruffo A., Melnick M.B., Linsley P.S., Seed B. (1991). The lymphocyte glycoprotein CD6 contains a repeated domain structure characteristic of a new family of cell surface and secreted proteins. J. Exp. Med. 174: 949—952. PMID 1919444 DOI:10.1084/jem.174.4.949
- Hassan N.J., Barclay A.N., Brown M.H. (2004). Frontline: Optimal T cell activation requires the engagement of CD6 and CD166. Eur. J. Immunol. 34: 930—940. PMID 15048703 DOI:10.1002/eji.200424856
- Swack J.A., Mier J.W., Romain P.L., Hull S.R., Rudd C.E. (1991). Biosynthesis and post-translational modification of CD6, a T cell signal-transducing molecule. J. Biol. Chem. 266: 7137—7143. PMID 2016320
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з CD6 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1691 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
- ↑ UniProt, P30203 (англ.) . Архів оригіналу за 29 серпня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
Білки: кластери диференціації |
---|
| 1-50 | |
---|
| 51-100 | |
---|
| 101-150 | |
---|
| 151-200 | |
---|
| 201-250 | |
---|
| 251-300 | |
---|
| 301-350 | |
---|
|