VCAM1 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 1IJ9, 1VCA, 1VSC | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | VCAM1, CD106, INCAM-100, vascular cell adhesion molecule 1 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 192225 MGI: 98926 HomoloGene: 838 GeneCards: VCAM1 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • primary amine oxidase activity • integrin binding • cell adhesion molecule binding |
---|
Клітинна компонента | • integral component of membrane • комплекс Ґольджі • alpha9-beta1 integrin-vascular cell adhesion molecule-1 complex • мембрана • Філоподія • клітинна мембрана • apical part of cell • Мікроворсинки • cell surface • early endosome • ендоплазматичний ретикулум • podosome • Сарколема • екзосома • external side of plasma membrane • міжклітинний простір • integral component of plasma membrane |
---|
Біологічний процес | • leukocyte cell-cell adhesion • response to ionizing radiation • heterophilic cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules • response to hypoxia • response to nutrient • interferon-gamma-mediated signaling pathway • cellular response to tumor necrosis factor • response to nicotine • GO:0010260 старіння людини • response to zinc ion • extracellular matrix organization • amine metabolic process • response to lipopolysaccharide • адгезія клітин • acute inflammatory response • positive regulation of T cell proliferation • membrane to membrane docking • regulation of immune response • leukocyte tethering or rolling • cell chemotaxis • B cell differentiation • cellular response to vascular endothelial growth factor stimulus • cell-matrix adhesion • GO:0022415 viral process • response to ethanol • calcium-mediated signaling using intracellular calcium source • chronic inflammatory response • cell-cell adhesion • cytokine-mediated signaling pathway • heterotypic cell-cell adhesion • іннервація • cardiac neuron differentiation • cell-cell adhesion in response to extracellular stimulus • cellular response to amyloid-beta |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_080682 NM_001078 NM_001199834 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_001069 NP_001186763 NP_542413 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 1: 100.72 – 100.74 Mb | Хр. 3: 115.9 – 115.92 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
VCAM1 (англ. Vascular cell adhesion molecule 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 739 амінокислот, а молекулярна маса — 81 276[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MPGKMVVILG | | ASNILWIMFA | | ASQAFKIETT | | PESRYLAQIG | | DSVSLTCSTT |
GCESPFFSWR | | TQIDSPLNGK | | VTNEGTTSTL | | TMNPVSFGNE | | HSYLCTATCE |
SRKLEKGIQV | | EIYSFPKDPE | | IHLSGPLEAG | | KPITVKCSVA | | DVYPFDRLEI |
DLLKGDHLMK | | SQEFLEDADR | | KSLETKSLEV | | TFTPVIEDIG | | KVLVCRAKLH |
IDEMDSVPTV | | RQAVKELQVY | | ISPKNTVISV | | NPSTKLQEGG | | SVTMTCSSEG |
LPAPEIFWSK | | KLDNGNLQHL | | SGNATLTLIA | | MRMEDSGIYV | | CEGVNLIGKN |
RKEVELIVQE | | KPFTVEISPG | | PRIAAQIGDS | | VMLTCSVMGC | | ESPSFSWRTQ |
IDSPLSGKVR | | SEGTNSTLTL | | SPVSFENEHS | | YLCTVTCGHK | | KLEKGIQVEL |
YSFPRDPEIE | | MSGGLVNGSS | | VTVSCKVPSV | | YPLDRLEIEL | | LKGETILENI |
EFLEDTDMKS | | LENKSLEMTF | | IPTIEDTGKA | | LVCQAKLHID | | DMEFEPKQRQ |
STQTLYVNVA | | PRDTTVLVSP | | SSILEEGSSV | | NMTCLSQGFP | | APKILWSRQL |
PNGELQPLSE | | NATLTLISTK | | MEDSGVYLCE | | GINQAGRSRK | | EVELIIQVTP |
KDIKLTAFPS | | ESVKEGDTVI | | ISCTCGNVPE | | TWIILKKKAE | | TGDTVLKSID |
GAYTIRKAQL | | KDAGVYECES | | KNKVGSQLRS | | LTLDVQGREN | | NKDYFSPELL |
VLYFASSLII | | PAIGMIIYFA | | RKANMKGSYS | | LVEAQKSKV |
Задіяний у таких біологічних процесах як клітинна адгезія, взаємодія хазяїн-вірус. Локалізований у мембрані.
Література
- Polte T., Newman W., Gopal T.V. (1990). Full length vascular cell adhesion molecule 1 (VCAM-1). Nucleic Acids Res. 18: 5901—5901. PMID 1699207 DOI:10.1093/nar/18.19.5901
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Osborn L., Vassallo C., Benjamin C.D. (1992). Activated endothelium binds lymphocytes through a novel binding site in the alternately spliced domain of vascular cell adhesion molecule-1. J. Exp. Med. 176: 99—107. PMID 1377228 DOI:10.1084/jem.176.1.99
- Zhang Z., Henzel W.J. (2004). Signal peptide prediction based on analysis of experimentally verified cleavage sites. Protein Sci. 13: 2819—2824. PMID 15340161 DOI:10.1110/ps.04682504
- Iademarco M.F., McQuillan J.J., Rosen G.D., Dean D.C. (1992). Characterization of the promoter for vascular cell adhesion molecule-1 (VCAM-1). J. Biol. Chem. 267: 16323—16329. PMID 1379595
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12663 (англ.) . Процитовано 25 серпня 2017.
- ↑ UniProt, P19320 (англ.) . Архів оригіналу за 3 жовтня 2017. Процитовано 25 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
Білки: кластери диференціації |
---|
| 1-50 | |
---|
| 51-100 | |
---|
| 101-150 | |
---|
| 151-200 | |
---|
| 201-250 | |
---|
| 251-300 | |
---|
| 301-350 | |
---|
|