SLAMF1

SLAMF1
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

1M27, 1KA7, 1I3Z, 1D4T, 1D4W, 1KA6

Ідентифікатори
Символи SLAMF1, CD150, CDw150, SLAM, signaling lymphocytic activation molecule family member 1
Зовнішні ІД OMIM: 603492 MGI: 1351314 HomoloGene: 48162 GeneCards: SLAMF1
Онтологія гена
Молекулярна функція

• GO:0003823, GO:0051635 antigen binding
• virus receptor activity
• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
• transmembrane signaling receptor activity
• identical protein binding
• signaling receptor activity

Клітинна компонента

• integral component of membrane
• мембрана
• клітинна мембрана
• extracellular region
• cell surface
• phagocytic vesicle
• екзосома
• external side of plasma membrane

Біологічний процес

• адаптивна імунна відповідь
• процес імунної системи
• natural killer cell proliferation
• T-helper 1 cell cytokine production
• negative regulation of interleukin-6 production
• positive regulation of JNK cascade
• адгезія клітин
• negative regulation of CD40 signaling pathway
• negative regulation of T cell cytokine production
• myeloid dendritic cell activation involved in immune response
• regulation of vesicle fusion
• positive regulation of cell population proliferation
• positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade
• Фагоцитоз
• lymphocyte activation
• viral entry into host cell
• negative regulation of tumor necrosis factor production
• вроджений імунітет
• GO:0048552 regulation of catalytic activity
• GO:0022415 viral process
• positive regulation of activated T cell proliferation
• negative regulation of interleukin-12 production
• natural killer cell differentiation
• GO:0072468 сигнальна трансдукція
• leukocyte chemotaxis involved in inflammatory response
• positive regulation of macrophage chemotaxis
• positive regulation of dendritic cell chemotaxis

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
6504
27218
Ensembl
ENSG00000117090
ENSMUSG00000015316
UniProt
Q13291
Q9QUM4
RefSeq (мРНК)
NM_003037
NM_001330754
NM_013730
NM_001360898
RefSeq (білок)
NP_001317683
NP_003028
NP_038758
NP_001347827
Локус (UCSC) Хр. 1: 160.61 – 160.65 Mb Хр. 1: 171.59 – 171.63 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

SLAMF1 (англ. Signaling lymphocytic activation molecule family member 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 335 амінокислот, а молекулярна маса — 37 231[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MDPKGLLSLTFVLFLSLAFGASYGTGGRMMNCPKILRQLGSKVLLPLTYE
RINKSMNKSIHIVVTMAKSLENSVENKIVSLDPSEAGPPRYLGDRYKFYL
ENLTLGIRESRKEDEGWYLMTLEKNVSVQRFCLQLRLYEQVSTPEIKVLN
KTQENGTCTLILGCTVEKGDHVAYSWSEKAGTHPLNPANSSHLLSLTLGP
QHADNIYICTVSNPISNNSQTFSPWPGCRTDPSETKPWAVYAGLLGGVIM
ILIMVVILQLRRRGKTNHYQTTVEKKSLTIYAQVQKPGPLQKKLDSFPAQ
DPCTTIYVAATEPVPESVQETNSITVYASVTLPES

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів клітини-хазяїна для входу вірусу, рецепторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як клітинна адгезія, адаптивний імунітет, імунітет, вроджений імунітет, взаємодія хазяїн-вірус, поліморфізм. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані. Також секретований назовні.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Ferrand V., Li C., Romeo G., Yin L. (2003). Absence of SLAM mutations in EBV-associated lymphoproliferative disease patients. J. Med. Virol. 70: 131—136. PMID 12629654 DOI:10.1002/jmv.10373
  • Tatsuo H., Ono N., Tanaka K., Yanagi Y. (2000). SLAM (CDw150) is a cellular receptor for measles virus. Nature. 406: 893—897. PMID 10972291 DOI:10.1038/35022579
  • Li C., Iosef C., Jia C.Y., Han V.K., Li S.S. (2003). Dual functional roles for the X-linked lymphoproliferative syndrome gene product SAP/SH2D1A in signaling through the signaling lymphocyte activation molecule (SLAM) family of immune receptors. J. Biol. Chem. 278: 3852—3859. PMID 12458214 DOI:10.1074/jbc.M206649200

Примітки

  1. ↑ Human PubMed Reference:.
  2. ↑ Mouse PubMed Reference:.
  3. ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10903 (англ.) . Архів оригіналу за 7 квітня 2016. Процитовано 25 серпня 2017.
  4. ↑ UniProt, Q13291 (англ.) . Архів оригіналу за 2 жовтня 2013. Процитовано 25 серпня 2017.

Див. також

  • Хромосома 1
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

  • п
  • о
  • р
Білки: кластери диференціації
1-50
51-100
101-150
151-200
201-250
251-300
301-350